RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578446.1

USP22-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

TSL 3

Gene USP22, Length 605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-208ENST00000578446 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.17■■□□□ 1.62
USP22-208ENST00000578446 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.2■■□□□ 1.15
USP22-208ENST00000578446 ABCC9O60706 1549 aa21.44■■□□□ 1.02
USP22-208ENST00000578446 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
USP22-208ENST00000578446 DCAF8L2P0C7V8 631 aa20.94■□□□□ 0.94
USP22-208ENST00000578446 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa20.83■□□□□ 0.93
USP22-208ENST00000578446 NACADO15069 1562 aa20.81■□□□□ 0.92
USP22-208ENST00000578446 MYO15BQ96JP2 1530 aa20.79■□□□□ 0.92
USP22-208ENST00000578446 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.76■□□□□ 0.91
USP22-208ENST00000578446 SCRIBQ14160 1630 aa20.35■□□□□ 0.85
USP22-208ENST00000578446 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.19■□□□□ 0.82
USP22-208ENST00000578446 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.17■□□□□ 0.82
USP22-208ENST00000578446 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
USP22-208ENST00000578446 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.08■□□□□ 0.8
USP22-208ENST00000578446 CECR2Q9BXF3 1484 aa19.57■□□□□ 0.72
USP22-208ENST00000578446 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
USP22-208ENST00000578446 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
USP22-208ENST00000578446 SMARCA4P51532 1647 aa19.46■□□□□ 0.71
USP22-208ENST00000578446 MROH2BQ7Z745 1585 aa19.41■□□□□ 0.7
USP22-208ENST00000578446 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.37■□□□□ 0.69
USP22-208ENST00000578446 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
USP22-208ENST00000578446 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.29■□□□□ 0.68
USP22-208ENST00000578446 SMARCA2P51531 1590 aa19.27■□□□□ 0.68
USP22-208ENST00000578446 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.27■□□□□ 0.67
USP22-208ENST00000578446 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.24■□□□□ 0.67
USP22-208ENST00000578446 WIZO95785 1651 aa19.2■□□□□ 0.66
USP22-208ENST00000578446 NCAPD3P42695 1498 aa19.19■□□□□ 0.66
USP22-208ENST00000578446 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
USP22-208ENST00000578446 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
USP22-208ENST00000578446 HMGXB3Q12766 1538 aa19.15■□□□□ 0.66
USP22-208ENST00000578446 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
USP22-208ENST00000578446 CCDC88BA6NC98 1476 aa18.81■□□□□ 0.6
USP22-208ENST00000578446 CADPSQ9ULU8 1353 aa18.67■□□□□ 0.58
USP22-208ENST00000578446 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.64■□□□□ 0.57
USP22-208ENST00000578446 NESP48681 1621 aa18.63■□□□□ 0.57
USP22-208ENST00000578446 CFTRP13569 1480 aa18.63■□□□□ 0.57
USP22-208ENST00000578446 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.53■□□□□ 0.56
USP22-208ENST00000578446 ERCC6Q03468 1493 aa18.49■□□□□ 0.55
USP22-208ENST00000578446 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.48■□□□□ 0.55
USP22-208ENST00000578446 PRDM2Q13029 1718 aa18.46■□□□□ 0.55
USP22-208ENST00000578446 CEP164Q9UPV0 1460 aa18.43■□□□□ 0.54
USP22-208ENST00000578446 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.39■□□□□ 0.53
USP22-208ENST00000578446 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.33■□□□□ 0.52
USP22-208ENST00000578446 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
USP22-208ENST00000578446 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
USP22-208ENST00000578446 ABCC8Q09428 1581 aa18.25■□□□□ 0.51
USP22-208ENST00000578446 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.51
USP22-208ENST00000578446 WDR62O43379 1518 aa18.23■□□□□ 0.51
USP22-208ENST00000578446 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.21■□□□□ 0.51
USP22-208ENST00000578446 TOPBP1Q92547 1522 aa18.21■□□□□ 0.51
USP22-208ENST00000578446 CUX1P39880 1505 aa18.2■□□□□ 0.5
USP22-208ENST00000578446 SYNJ1O43426 1573 aa18.15■□□□□ 0.5
USP22-208ENST00000578446 TOP2BQ02880 1626 aa18.12■□□□□ 0.49
USP22-208ENST00000578446 CUX2O14529 1486 aa18.12■□□□□ 0.49
USP22-208ENST00000578446 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.11■□□□□ 0.49
USP22-208ENST00000578446 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.09■□□□□ 0.49
USP22-208ENST00000578446 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
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USP22-208ENST00000578446 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.04■□□□□ 0.48
USP22-208ENST00000578446 IFT140Q96RY7 1462 aa18.01■□□□□ 0.47
USP22-208ENST00000578446 SOGA1O94964 1423 aa18.01■□□□□ 0.47
USP22-208ENST00000578446 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17.99■□□□□ 0.47
USP22-208ENST00000578446 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
USP22-208ENST00000578446 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17.93■□□□□ 0.46
USP22-208ENST00000578446 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
USP22-208ENST00000578446 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
USP22-208ENST00000578446 WDR97A6NE52 1622 aa17.87■□□□□ 0.45
USP22-208ENST00000578446 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
USP22-208ENST00000578446 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.83■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 31.1
USP22-208ENST00000578446 KIF27Q86VH2 1401 aa17.83■□□□□ 0.45
USP22-208ENST00000578446 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa17.82■□□□□ 0.44
USP22-208ENST00000578446 GAPVD1Q14C86 1478 aa17.82■□□□□ 0.44
USP22-208ENST00000578446 GRIN2BQ13224 1484 aa17.77■□□□□ 0.44
USP22-208ENST00000578446 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.73■□□□□ 0.43
USP22-208ENST00000578446 EEA1Q15075 1411 aa17.72■□□□□ 0.43
USP22-208ENST00000578446 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.72■□□□□ 0.43
USP22-208ENST00000578446 PBRM1Q86U86 1689 aa17.71■□□□□ 0.43
USP22-208ENST00000578446 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17.71■□□□□ 0.43
USP22-208ENST00000578446 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
USP22-208ENST00000578446 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
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USP22-208ENST00000578446 ADAMTS12P58397 1594 aa17.64■□□□□ 0.41
USP22-208ENST00000578446 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.63■□□□□ 0.41
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USP22-208ENST00000578446 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.63■□□□□ 0.41
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USP22-208ENST00000578446 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.6■□□□□ 0.41
USP22-208ENST00000578446 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
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USP22-208ENST00000578446 GRIN2AQ12879 1464 aa17.54■□□□□ 0.4
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USP22-208ENST00000578446 CHD1O14646 1710 aa17.5■□□□□ 0.39
USP22-208ENST00000578446 KIF21BO75037 1637 aa17.5■□□□□ 0.39
USP22-208ENST00000578446 GOLGA3Q08378 1498 aa17.46■□□□□ 0.39
USP22-208ENST00000578446 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.45■□□□□ 0.38
USP22-208ENST00000578446 OSCARQ8IYS5 282 aa17.43■□□□□ 0.38
USP22-208ENST00000578446 NUP160Q12769 1436 aa17.43■□□□□ 0.38
USP22-208ENST00000578446 CEP170Q5SW79 1584 aa17.42■□□□□ 0.38
USP22-208ENST00000578446 UBTFP17480 764 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
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