RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578208.1

GGA3-204, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-204ENST00000578208 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.28■■■□□ 2.12
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GGA3-204ENST00000578208 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.8■■□□□ 1.4
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GGA3-204ENST00000578208 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.7■■□□□ 1.38
GGA3-204ENST00000578208 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
GGA3-204ENST00000578208 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.54■■□□□ 1.36
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GGA3-204ENST00000578208 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.18■■□□□ 1.3
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GGA3-204ENST00000578208 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.38■■□□□ 1.17
GGA3-204ENST00000578208 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.26■■□□□ 1.15
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GGA3-204ENST00000578208 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
GGA3-204ENST00000578208 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
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GGA3-204ENST00000578208 TOP2BQ02880 1626 aa20.26■□□□□ 0.83
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GGA3-204ENST00000578208 CHD1O14646 1710 aa20.14■□□□□ 0.81
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