RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577376.5

FAM222B-203, Transcript of family with sequence similarity 222 member B, humanhuman

TSL 2

Gene FAM222B, Length 720 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM222B-203ENST00000577376 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.56■■■■■ 7.29
FAM222B-203ENST00000577376 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.62■■■■■ 6.17
FAM222B-203ENST00000577376 ABCC9O60706 1549 aa52.76■■■■■ 6.04
FAM222B-203ENST00000577376 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.64■■■■■ 5.7
FAM222B-203ENST00000577376 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.52■■■■■ 5.68
FAM222B-203ENST00000577376 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.42■■■■■ 5.66
FAM222B-203ENST00000577376 NACADO15069 1562 aa50.37■■■■■ 5.65
FAM222B-203ENST00000577376 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.16■■■■■ 5.62
FAM222B-203ENST00000577376 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.11■■■■■ 5.61
FAM222B-203ENST00000577376 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.3■■■■■ 5.48
FAM222B-203ENST00000577376 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.05■■■■■ 5.44
FAM222B-203ENST00000577376 SCRIBQ14160 1630 aa49.02■■■■■ 5.44
FAM222B-203ENST00000577376 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.97■■■■■ 5.43
FAM222B-203ENST00000577376 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.86■■■■■ 5.41
FAM222B-203ENST00000577376 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.33■■■■■ 5.33
FAM222B-203ENST00000577376 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.66■■■■■ 5.22
FAM222B-203ENST00000577376 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.59■■■■■ 5.21
FAM222B-203ENST00000577376 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.46■■■■■ 5.19
FAM222B-203ENST00000577376 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.94■■■■■ 5.11
FAM222B-203ENST00000577376 SMARCA4P51532 1647 aa46.89■■■■■ 5.1
FAM222B-203ENST00000577376 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.67■■■■■ 5.06
FAM222B-203ENST00000577376 SMARCA2P51531 1590 aa46.56■■■■■ 5.04
FAM222B-203ENST00000577376 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.55■■■■■ 5.04
FAM222B-203ENST00000577376 NCAPD3P42695 1498 aa46.45■■■■■ 5.03
FAM222B-203ENST00000577376 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.38■■■■■ 5.01
FAM222B-203ENST00000577376 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.31■■■■■ 5
FAM222B-203ENST00000577376 HMGXB3Q12766 1538 aa46.26■■■■■ 5
FAM222B-203ENST00000577376 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.25■■■■■ 5
FAM222B-203ENST00000577376 WIZO95785 1651 aa46.17■■■■■ 4.98
FAM222B-203ENST00000577376 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.76■■■■■ 4.92
FAM222B-203ENST00000577376 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.62■■■■■ 4.89
FAM222B-203ENST00000577376 ERCC6Q03468 1493 aa45.54■■■■■ 4.88
FAM222B-203ENST00000577376 NESP48681 1621 aa45.45■■■■■ 4.87
FAM222B-203ENST00000577376 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.22■■■■■ 4.83
FAM222B-203ENST00000577376 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.2■■■■■ 4.83
FAM222B-203ENST00000577376 CUX2O14529 1486 aa45.18■■■■■ 4.82
FAM222B-203ENST00000577376 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.18■■■■■ 4.82
FAM222B-203ENST00000577376 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.03■■■■■ 4.8
FAM222B-203ENST00000577376 CFTRP13569 1480 aa44.95■■■■■ 4.79
FAM222B-203ENST00000577376 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.77■■■■■ 4.76
FAM222B-203ENST00000577376 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.74■■■■■ 4.75
FAM222B-203ENST00000577376 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.66■■■■■ 4.74
FAM222B-203ENST00000577376 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.58■■■■■ 4.73
FAM222B-203ENST00000577376 PRDM2Q13029 1718 aa44.57■■■■■ 4.73
FAM222B-203ENST00000577376 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.56■■■■■ 4.72
FAM222B-203ENST00000577376 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.55■■■■■ 4.72
FAM222B-203ENST00000577376 WDR62O43379 1518 aa44.37■■■■■ 4.69
FAM222B-203ENST00000577376 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.65
FAM222B-203ENST00000577376 ABCC8Q09428 1581 aa44.04■■■■■ 4.64
FAM222B-203ENST00000577376 TOPBP1Q92547 1522 aa43.96■■■■■ 4.63
FAM222B-203ENST00000577376 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.95■■■■■ 4.63
FAM222B-203ENST00000577376 CUX1P39880 1505 aa43.77■■■■■ 4.6
FAM222B-203ENST00000577376 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.72■■■■■ 4.59
FAM222B-203ENST00000577376 IFT140Q96RY7 1462 aa43.62■■■■■ 4.57
FAM222B-203ENST00000577376 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.61■■■■■ 4.57
FAM222B-203ENST00000577376 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.59■■■■■ 4.57
FAM222B-203ENST00000577376 TOP2BQ02880 1626 aa43.51■■■■■ 4.56
FAM222B-203ENST00000577376 SOGA1O94964 1423 aa43.5■■■■■ 4.55
FAM222B-203ENST00000577376 SYNJ1O43426 1573 aa43.5■■■■■ 4.55
FAM222B-203ENST00000577376 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.47■■■■■ 4.55
FAM222B-203ENST00000577376 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.45■■■■■ 4.55
FAM222B-203ENST00000577376 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.43■■■■■ 4.54
FAM222B-203ENST00000577376 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.54
FAM222B-203ENST00000577376 OSCARQ8IYS5 282 aa43.35■■■■■ 4.53
FAM222B-203ENST00000577376 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
FAM222B-203ENST00000577376 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.19■■■■■ 4.55e-6■■□□□ 14.3
FAM222B-203ENST00000577376 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.17■■■■■ 4.5
FAM222B-203ENST00000577376 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
FAM222B-203ENST00000577376 WDR97A6NE52 1622 aa43.12■■■■■ 4.49
FAM222B-203ENST00000577376 TRIM41Q8WV44 630 aa43.08■■■■■ 4.49
FAM222B-203ENST00000577376 GAPVD1Q14C86 1478 aa43■■■■■ 4.47
FAM222B-203ENST00000577376 GRIN2BQ13224 1484 aa42.94■■■■■ 4.46
FAM222B-203ENST00000577376 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.91■■■■■ 4.46
FAM222B-203ENST00000577376 FBLN2P98095 1184 aa42.89■■■■■ 4.46
FAM222B-203ENST00000577376 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.81■■■■■ 4.44
FAM222B-203ENST00000577376 KIF27Q86VH2 1401 aa42.8■■■■■ 4.44
FAM222B-203ENST00000577376 PBRM1Q86U86 1689 aa42.79■■■■■ 4.44
FAM222B-203ENST00000577376 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
FAM222B-203ENST00000577376 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.74■■■■■ 4.43
FAM222B-203ENST00000577376 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.67■■■■■ 4.42
FAM222B-203ENST00000577376 CHD1O14646 1710 aa42.66■■■■■ 4.42
FAM222B-203ENST00000577376 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.65■■■■■ 4.42
FAM222B-203ENST00000577376 SYNJ2O15056 1496 aa42.59■■■■■ 4.41
FAM222B-203ENST00000577376 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.52■■■■■ 4.4
FAM222B-203ENST00000577376 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.52■■■■■ 4.4
FAM222B-203ENST00000577376 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.52■■■■■ 4.4
FAM222B-203ENST00000577376 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.52■■■■■ 4.4
FAM222B-203ENST00000577376 ARHGEF11O15085 1522 aa42.51■■■■■ 4.4
FAM222B-203ENST00000577376 ADAMTS12P58397 1594 aa42.51■■■■■ 4.4
FAM222B-203ENST00000577376 IGF1RP08069 1367 aa42.51■■■■■ 4.4
FAM222B-203ENST00000577376 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.43■■■■■ 4.38
FAM222B-203ENST00000577376 CUL7Q14999 1698 aa42.37■■■■■ 4.37
FAM222B-203ENST00000577376 GRIN2AQ12879 1464 aa42.36■■■■■ 4.37
FAM222B-203ENST00000577376 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.32■■■■■ 4.37
FAM222B-203ENST00000577376 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.31■■■■■ 4.36
FAM222B-203ENST00000577376 EEA1Q15075 1411 aa42.28■■■■■ 4.36
FAM222B-203ENST00000577376 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.27■■■■■ 4.36
FAM222B-203ENST00000577376 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.18■■■■■ 4.34
FAM222B-203ENST00000577376 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.16■■■■■ 4.34
FAM222B-203ENST00000577376 ARAP1Q96P48 1450 aa42.14■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms