RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576594.1

ACAP1-211, Transcript of ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 1, humanhuman

TSL 2

Gene ACAP1, Length 310 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP1-211ENST00000576594 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.95■■■■□ 3.51
ACAP1-211ENST00000576594 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.84■■■□□ 2.85
ACAP1-211ENST00000576594 ABCC9O60706 1549 aa32.08■■■□□ 2.73
ACAP1-211ENST00000576594 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.87■■■□□ 2.53
ACAP1-211ENST00000576594 NACADO15069 1562 aa30.83■■■□□ 2.53
ACAP1-211ENST00000576594 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
ACAP1-211ENST00000576594 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.8■■■□□ 2.52
ACAP1-211ENST00000576594 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.67■■■□□ 2.5
ACAP1-211ENST00000576594 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.57■■■□□ 2.48
ACAP1-211ENST00000576594 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.22■■■□□ 2.43
ACAP1-211ENST00000576594 SCRIBQ14160 1630 aa29.99■■■□□ 2.39
ACAP1-211ENST00000576594 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.97■■■□□ 2.39
ACAP1-211ENST00000576594 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.96■■■□□ 2.39
ACAP1-211ENST00000576594 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.61■■■□□ 2.33
ACAP1-211ENST00000576594 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.39■■■□□ 2.3
ACAP1-211ENST00000576594 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
ACAP1-211ENST00000576594 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.03■■■□□ 2.24
ACAP1-211ENST00000576594 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.81■■■□□ 2.2
ACAP1-211ENST00000576594 SMARCA4P51532 1647 aa28.68■■■□□ 2.18
ACAP1-211ENST00000576594 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
ACAP1-211ENST00000576594 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.49■■■□□ 2.15
ACAP1-211ENST00000576594 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.49■■■□□ 2.15
ACAP1-211ENST00000576594 NCAPD3P42695 1498 aa28.45■■■□□ 2.14
ACAP1-211ENST00000576594 SMARCA2P51531 1590 aa28.45■■■□□ 2.14
ACAP1-211ENST00000576594 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.39■■■□□ 2.14
ACAP1-211ENST00000576594 HMGXB3Q12766 1538 aa28.34■■■□□ 2.13
ACAP1-211ENST00000576594 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
ACAP1-211ENST00000576594 WIZO95785 1651 aa28.19■■■□□ 2.1
ACAP1-211ENST00000576594 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
ACAP1-211ENST00000576594 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
ACAP1-211ENST00000576594 NESP48681 1621 aa27.79■■■□□ 2.04
ACAP1-211ENST00000576594 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.7■■■□□ 2.03
ACAP1-211ENST00000576594 ERCC6Q03468 1493 aa27.64■■■□□ 2.01
ACAP1-211ENST00000576594 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.62■■■□□ 2.01
ACAP1-211ENST00000576594 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.55■■■□□ 2
ACAP1-211ENST00000576594 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.5■■□□□ 1.99
ACAP1-211ENST00000576594 CFTRP13569 1480 aa27.48■■□□□ 1.99
ACAP1-211ENST00000576594 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.47■■□□□ 1.99
ACAP1-211ENST00000576594 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
ACAP1-211ENST00000576594 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
ACAP1-211ENST00000576594 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.32■■□□□ 1.96
ACAP1-211ENST00000576594 CUX2O14529 1486 aa27.32■■□□□ 1.96
ACAP1-211ENST00000576594 PRDM2Q13029 1718 aa27.31■■□□□ 1.96
ACAP1-211ENST00000576594 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.28■■□□□ 1.96
ACAP1-211ENST00000576594 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.24■■□□□ 1.95
ACAP1-211ENST00000576594 WDR62O43379 1518 aa27.16■■□□□ 1.94
ACAP1-211ENST00000576594 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
ACAP1-211ENST00000576594 TOPBP1Q92547 1522 aa26.9■■□□□ 1.9
ACAP1-211ENST00000576594 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.88■■□□□ 1.89
ACAP1-211ENST00000576594 ABCC8Q09428 1581 aa26.85■■□□□ 1.89
ACAP1-211ENST00000576594 CUX1P39880 1505 aa26.73■■□□□ 1.87
ACAP1-211ENST00000576594 IFT140Q96RY7 1462 aa26.7■■□□□ 1.87
ACAP1-211ENST00000576594 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
ACAP1-211ENST00000576594 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.62■■□□□ 1.85
ACAP1-211ENST00000576594 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
ACAP1-211ENST00000576594 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
ACAP1-211ENST00000576594 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.56■■□□□ 1.84
ACAP1-211ENST00000576594 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
ACAP1-211ENST00000576594 SOGA1O94964 1423 aa26.54■■□□□ 1.84
ACAP1-211ENST00000576594 SYNJ1O43426 1573 aa26.53■■□□□ 1.84
ACAP1-211ENST00000576594 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
ACAP1-211ENST00000576594 TOP2BQ02880 1626 aa26.5■■□□□ 1.83
ACAP1-211ENST00000576594 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.5■■□□□ 1.83
ACAP1-211ENST00000576594 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
ACAP1-211ENST00000576594 WDR97A6NE52 1622 aa26.43■■□□□ 1.82
ACAP1-211ENST00000576594 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
ACAP1-211ENST00000576594 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.39■■□□□ 1.82
ACAP1-211ENST00000576594 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.36■■□□□ 1.81
ACAP1-211ENST00000576594 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.28■■□□□ 1.8
ACAP1-211ENST00000576594 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.24■■□□□ 1.79
ACAP1-211ENST00000576594 GRIN2BQ13224 1484 aa26.23■■□□□ 1.79
ACAP1-211ENST00000576594 PBRM1Q86U86 1689 aa26.22■■□□□ 1.79
ACAP1-211ENST00000576594 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.22■■□□□ 1.79
ACAP1-211ENST00000576594 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
ACAP1-211ENST00000576594 CHD1O14646 1710 aa26.17■■□□□ 1.78
ACAP1-211ENST00000576594 OSCARQ8IYS5 282 aa26.15■■□□□ 1.78
ACAP1-211ENST00000576594 FBLN2P98095 1184 aa26.08■■□□□ 1.77
ACAP1-211ENST00000576594 SYNJ2O15056 1496 aa26.07■■□□□ 1.76
ACAP1-211ENST00000576594 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.04■■□□□ 1.76
ACAP1-211ENST00000576594 ADAMTS12P58397 1594 aa26.03■■□□□ 1.76
ACAP1-211ENST00000576594 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
ACAP1-211ENST00000576594 KIF27Q86VH2 1401 aa25.97■■□□□ 1.75
ACAP1-211ENST00000576594 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.94■■□□□ 1.74
ACAP1-211ENST00000576594 TRIM41Q8WV44 630 aa25.92■■□□□ 1.74
ACAP1-211ENST00000576594 GRIN2AQ12879 1464 aa25.91■■□□□ 1.74
ACAP1-211ENST00000576594 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.88■■□□□ 1.73
ACAP1-211ENST00000576594 IGF1RP08069 1367 aa25.87■■□□□ 1.73
ACAP1-211ENST00000576594 CUL7Q14999 1698 aa25.82■■□□□ 1.72
ACAP1-211ENST00000576594 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.8■■□□□ 1.72
ACAP1-211ENST00000576594 CEP170Q5SW79 1584 aa25.8■■□□□ 1.72
ACAP1-211ENST00000576594 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.8■■□□□ 1.72
ACAP1-211ENST00000576594 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.8■■□□□ 1.72
ACAP1-211ENST00000576594 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.8■■□□□ 1.72
ACAP1-211ENST00000576594 NUP160Q12769 1436 aa25.8■■□□□ 1.72
ACAP1-211ENST00000576594 ARHGEF11O15085 1522 aa25.79■■□□□ 1.72
ACAP1-211ENST00000576594 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.7■■□□□ 1.71
ACAP1-211ENST00000576594 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.66■■□□□ 1.7
ACAP1-211ENST00000576594 SHROOM2Q13796 1616 aa25.61■■□□□ 1.69
ACAP1-211ENST00000576594 ARAP1Q96P48 1450 aa25.6■■□□□ 1.69
ACAP1-211ENST00000576594 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114 ms