RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576295.5

AKAP1-217, Transcript of A-kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene AKAP1, Length 614 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP1-217ENST00000576295 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.78■■■■□ 3.32
AKAP1-217ENST00000576295 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.03■■■□□ 2.72
AKAP1-217ENST00000576295 ABCC9O60706 1549 aa31.69■■■□□ 2.66
AKAP1-217ENST00000576295 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.27■■■□□ 2.44
AKAP1-217ENST00000576295 NACADO15069 1562 aa30.11■■■□□ 2.41
AKAP1-217ENST00000576295 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.01■■■□□ 2.39
AKAP1-217ENST00000576295 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.77■■■□□ 2.36
AKAP1-217ENST00000576295 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
AKAP1-217ENST00000576295 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.73■■■□□ 2.35
AKAP1-217ENST00000576295 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.51■■■□□ 2.32
AKAP1-217ENST00000576295 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.49■■■□□ 2.31
AKAP1-217ENST00000576295 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.42■■■□□ 2.3
AKAP1-217ENST00000576295 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.32■■■□□ 2.28
AKAP1-217ENST00000576295 SCRIBQ14160 1630 aa29.27■■■□□ 2.28
AKAP1-217ENST00000576295 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.93■■■□□ 2.22
AKAP1-217ENST00000576295 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
AKAP1-217ENST00000576295 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.65■■■□□ 2.18
AKAP1-217ENST00000576295 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.46■■■□□ 2.15
AKAP1-217ENST00000576295 SMARCA4P51532 1647 aa27.91■■■□□ 2.06
AKAP1-217ENST00000576295 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.76■■■□□ 2.04
AKAP1-217ENST00000576295 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
AKAP1-217ENST00000576295 NCAPD3P42695 1498 aa27.74■■■□□ 2.03
AKAP1-217ENST00000576295 SMARCA2P51531 1590 aa27.71■■■□□ 2.03
AKAP1-217ENST00000576295 HMGXB3Q12766 1538 aa27.65■■■□□ 2.02
AKAP1-217ENST00000576295 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.61■■■□□ 2.01
AKAP1-217ENST00000576295 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.56■■■□□ 2
AKAP1-217ENST00000576295 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
AKAP1-217ENST00000576295 WIZO95785 1651 aa27.37■■□□□ 1.97
AKAP1-217ENST00000576295 NESP48681 1621 aa27.34■■□□□ 1.97
AKAP1-217ENST00000576295 ERCC6Q03468 1493 aa27.3■■□□□ 1.96
AKAP1-217ENST00000576295 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.14■■□□□ 1.93
AKAP1-217ENST00000576295 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
AKAP1-217ENST00000576295 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.08■■□□□ 1.93
AKAP1-217ENST00000576295 CUX2O14529 1486 aa27.07■■□□□ 1.92
AKAP1-217ENST00000576295 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
AKAP1-217ENST00000576295 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
AKAP1-217ENST00000576295 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.91■■□□□ 1.9
AKAP1-217ENST00000576295 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.89■■□□□ 1.89
AKAP1-217ENST00000576295 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.72■■□□□ 1.87
AKAP1-217ENST00000576295 CFTRP13569 1480 aa26.71■■□□□ 1.87
AKAP1-217ENST00000576295 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.69■■□□□ 1.86
AKAP1-217ENST00000576295 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.68■■□□□ 1.86
AKAP1-217ENST00000576295 PRDM2Q13029 1718 aa26.68■■□□□ 1.86
AKAP1-217ENST00000576295 WDR62O43379 1518 aa26.67■■□□□ 1.86
AKAP1-217ENST00000576295 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.62■■□□□ 1.85
AKAP1-217ENST00000576295 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.59■■□□□ 1.85
AKAP1-217ENST00000576295 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
AKAP1-217ENST00000576295 TOPBP1Q92547 1522 aa26.24■■□□□ 1.79
AKAP1-217ENST00000576295 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.19■■□□□ 1.78
AKAP1-217ENST00000576295 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
AKAP1-217ENST00000576295 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
AKAP1-217ENST00000576295 IFT140Q96RY7 1462 aa26.1■■□□□ 1.77
AKAP1-217ENST00000576295 ABCC8Q09428 1581 aa26.09■■□□□ 1.77
AKAP1-217ENST00000576295 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
AKAP1-217ENST00000576295 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
AKAP1-217ENST00000576295 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
AKAP1-217ENST00000576295 CUX1P39880 1505 aa25.94■■□□□ 1.74
AKAP1-217ENST00000576295 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.91■■□□□ 1.74
AKAP1-217ENST00000576295 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.9■■□□□ 1.74
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AKAP1-217ENST00000576295 OSCARQ8IYS5 282 aa25.81■■□□□ 1.72
AKAP1-217ENST00000576295 SOGA1O94964 1423 aa25.8■■□□□ 1.72
AKAP1-217ENST00000576295 WDR97A6NE52 1622 aa25.79■■□□□ 1.72
AKAP1-217ENST00000576295 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
AKAP1-217ENST00000576295 TRIM41Q8WV44 630 aa25.69■■□□□ 1.7
AKAP1-217ENST00000576295 PBRM1Q86U86 1689 aa25.67■■□□□ 1.7
AKAP1-217ENST00000576295 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.66■■□□□ 1.7
AKAP1-217ENST00000576295 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.65■■□□□ 1.7
AKAP1-217ENST00000576295 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.65■■□□□ 1.7
AKAP1-217ENST00000576295 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.65■■□□□ 1.7
AKAP1-217ENST00000576295 SYNJ1O43426 1573 aa25.65■■□□□ 1.7
AKAP1-217ENST00000576295 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.64■■□□□ 1.7
AKAP1-217ENST00000576295 TOP2BQ02880 1626 aa25.6■■□□□ 1.69
AKAP1-217ENST00000576295 FBLN2P98095 1184 aa25.59■■□□□ 1.69
AKAP1-217ENST00000576295 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.59■■□□□ 1.69
AKAP1-217ENST00000576295 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
AKAP1-217ENST00000576295 GRIN2BQ13224 1484 aa25.57■■□□□ 1.68
AKAP1-217ENST00000576295 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.57■■□□□ 1.68
AKAP1-217ENST00000576295 ARHGEF11O15085 1522 aa25.55■■□□□ 1.68
AKAP1-217ENST00000576295 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.53■■□□□ 1.68
AKAP1-217ENST00000576295 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
AKAP1-217ENST00000576295 SYNJ2O15056 1496 aa25.45■■□□□ 1.66
AKAP1-217ENST00000576295 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.43■■□□□ 1.66
AKAP1-217ENST00000576295 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
AKAP1-217ENST00000576295 ADAMTS12P58397 1594 aa25.39■■□□□ 1.65
AKAP1-217ENST00000576295 ARAP1Q96P48 1450 aa25.34■■□□□ 1.65
AKAP1-217ENST00000576295 GRIN2AQ12879 1464 aa25.28■■□□□ 1.64
AKAP1-217ENST00000576295 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.26■■□□□ 1.63
AKAP1-217ENST00000576295 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.25■■□□□ 1.63
AKAP1-217ENST00000576295 CEP170Q5SW79 1584 aa25.23■■□□□ 1.63
AKAP1-217ENST00000576295 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.2■■□□□ 1.62
AKAP1-217ENST00000576295 NUP160Q12769 1436 aa25.14■■□□□ 1.62
AKAP1-217ENST00000576295 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.12■■□□□ 1.61
AKAP1-217ENST00000576295 SHROOM2Q13796 1616 aa25.07■■□□□ 1.6
AKAP1-217ENST00000576295 KIF27Q86VH2 1401 aa25.03■■□□□ 1.6
AKAP1-217ENST00000576295 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.02■■□□□ 1.6
AKAP1-217ENST00000576295 CUL7Q14999 1698 aa25.02■■□□□ 1.6
AKAP1-217ENST00000576295 IGF1RP08069 1367 aa24.94■■□□□ 1.58
AKAP1-217ENST00000576295 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
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