RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572739.5

NAA60-215, Transcript of N(alpha)-acetyltransferase 60, NatF catalytic subunit, human

TSL 4

Gene NAA60, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NAA60-215	ENST00000572739	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		38.47	■■■■□ 3.75
NAA60-215	ENST00000572739	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		34.4	■■■■□ 3.1
NAA60-215	ENST00000572739	ABCC9	O60706	1549 aa		33.96	■■■■□ 3.03
NAA60-215	ENST00000572739	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		32.49	■■■□□ 2.79
NAA60-215	ENST00000572739	NACAD	O15069	1562 aa		32.35	■■■□□ 2.77
NAA60-215	ENST00000572739	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.16	■■■□□ 2.74
NAA60-215	ENST00000572739	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.02	■■■□□ 2.72
NAA60-215	ENST00000572739	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
NAA60-215	ENST00000572739	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		31.88	■■■□□ 2.69
NAA60-215	ENST00000572739	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		31.78	■■■□□ 2.68
NAA60-215	ENST00000572739	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	31.62	■■■□□ 2.65
NAA60-215	ENST00000572739	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		31.6	■■■□□ 2.65
NAA60-215	ENST00000572739	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		31.43	■■■□□ 2.62
NAA60-215	ENST00000572739	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.41	■■■□□ 2.62
NAA60-215	ENST00000572739	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		31.13	■■■□□ 2.57
NAA60-215	ENST00000572739	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	30.76	■■■□□ 2.52
NAA60-215	ENST00000572739	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		30.72	■■■□□ 2.51
NAA60-215	ENST00000572739	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		30.52	■■■□□ 2.48
NAA60-215	ENST00000572739	SMARCA4	P51532	1647 aa		29.97	■■■□□ 2.39
NAA60-215	ENST00000572739	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	29.83	■■■□□ 2.37
NAA60-215	ENST00000572739	NCAPD3	P42695	1498 aa		29.83	■■■□□ 2.37
NAA60-215	ENST00000572739	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		29.83	■■■□□ 2.37
NAA60-215	ENST00000572739	SMARCA2	P51531	1590 aa		29.77	■■■□□ 2.36
NAA60-215	ENST00000572739	HMGXB3	Q12766	1538 aa		29.71	■■■□□ 2.35
NAA60-215	ENST00000572739	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		29.68	■■■□□ 2.34
NAA60-215	ENST00000572739	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		29.65	■■■□□ 2.34
NAA60-215	ENST00000572739	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	29.58	■■■□□ 2.33
NAA60-215	ENST00000572739	WIZ	O95785	1651 aa		29.37	■■■□□ 2.29
NAA60-215	ENST00000572739	NES	P48681	1621 aa		29.31	■■■□□ 2.28
NAA60-215	ENST00000572739	ERCC6	Q03468	1493 aa		29.26	■■■□□ 2.27
NAA60-215	ENST00000572739	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
NAA60-215	ENST00000572739	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.13	■■■□□ 2.25
NAA60-215	ENST00000572739	CUX2	O14529	1486 aa		29.05	■■■□□ 2.24
NAA60-215	ENST00000572739	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.01	■■■□□ 2.23
NAA60-215	ENST00000572739	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
NAA60-215	ENST00000572739	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
NAA60-215	ENST00000572739	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		28.92	■■■□□ 2.22
NAA60-215	ENST00000572739	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		28.88	■■■□□ 2.21
NAA60-215	ENST00000572739	CFTR	P13569	1480 aa		28.72	■■■□□ 2.19
NAA60-215	ENST00000572739	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		28.69	■■■□□ 2.18
NAA60-215	ENST00000572739	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		28.66	■■■□□ 2.18
NAA60-215	ENST00000572739	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		28.65	■■■□□ 2.18
NAA60-215	ENST00000572739	WDR62	O43379	1518 aa		28.64	■■■□□ 2.17
NAA60-215	ENST00000572739	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		28.63	■■■□□ 2.17
NAA60-215	ENST00000572739	PRDM2	Q13029	1718 aa		28.59	■■■□□ 2.17
NAA60-215	ENST00000572739	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		28.49	■■■□□ 2.15
NAA60-215	ENST00000572739	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
NAA60-215	ENST00000572739	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.18	■■■□□ 2.1
NAA60-215	ENST00000572739	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.12	■■■□□ 2.09
NAA60-215	ENST00000572739	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
NAA60-215	ENST00000572739	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.05	■■■□□ 2.08
NAA60-215	ENST00000572739	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.03	■■■□□ 2.08
NAA60-215	ENST00000572739	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
NAA60-215	ENST00000572739	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
NAA60-215	ENST00000572739	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
NAA60-215	ENST00000572739	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
NAA60-215	ENST00000572739	CUX1	P39880	1505 aa		27.87	■■■□□ 2.05
NAA60-215	ENST00000572739	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NAA60-215	ENST00000572739	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NAA60-215	ENST00000572739	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	27.76	■■■□□ 2.04	2e-8	■■■■□ 26.5
NAA60-215	ENST00000572739	SOGA1	O94964	1423 aa		27.72	■■■□□ 2.03
NAA60-215	ENST00000572739	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		27.69	■■■□□ 2.02
NAA60-215	ENST00000572739	WDR97	A6NE52	1622 aa		27.67	■■■□□ 2.02
NAA60-215	ENST00000572739	CHD1	O14646	1710 aa		27.66	■■■□□ 2.02
NAA60-215	ENST00000572739	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
NAA60-215	ENST00000572739	SYNJ1	O43426	1573 aa		27.56	■■■□□ 2
NAA60-215	ENST00000572739	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		27.55	■■■□□ 2
NAA60-215	ENST00000572739	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		27.53	■■■□□ 2
NAA60-215	ENST00000572739	TOP2B	Q02880	1626 aa		27.52	■■■□□ 2
NAA60-215	ENST00000572739	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.51	■■□□□ 1.99
NAA60-215	ENST00000572739	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	27.5	■■□□□ 1.99
NAA60-215	ENST00000572739	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		27.49	■■□□□ 1.99
NAA60-215	ENST00000572739	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.49	■■□□□ 1.99
NAA60-215	ENST00000572739	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		27.47	■■□□□ 1.99
NAA60-215	ENST00000572739	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		27.47	■■□□□ 1.99
NAA60-215	ENST00000572739	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		27.47	■■□□□ 1.99
NAA60-215	ENST00000572739	GRIN2B	Q13224	1484 aa		27.46	■■□□□ 1.99
NAA60-215	ENST00000572739	TRIM41	Q8WV44	630 aa		27.45	■■□□□ 1.98
NAA60-215	ENST00000572739	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	27.44	■■□□□ 1.98
NAA60-215	ENST00000572739	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.43	■■□□□ 1.98
NAA60-215	ENST00000572739	FBLN2	P98095	1184 aa		27.42	■■□□□ 1.98
NAA60-215	ENST00000572739	ARHGEF11	O15085	1522 aa		27.4	■■□□□ 1.98
NAA60-215	ENST00000572739	SYNJ2	O15056	1496 aa		27.35	■■□□□ 1.97
NAA60-215	ENST00000572739	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.31	■■□□□ 1.96
NAA60-215	ENST00000572739	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	27.27	■■□□□ 1.96
NAA60-215	ENST00000572739	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.26	■■□□□ 1.95
NAA60-215	ENST00000572739	ARAP1	Q96P48	1450 aa		27.17	■■□□□ 1.94
NAA60-215	ENST00000572739	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.15	■■□□□ 1.94
NAA60-215	ENST00000572739	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.15	■■□□□ 1.94
NAA60-215	ENST00000572739	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.09	■■□□□ 1.93
NAA60-215	ENST00000572739	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.08	■■□□□ 1.93
NAA60-215	ENST00000572739	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		27.05	■■□□□ 1.92
NAA60-215	ENST00000572739	NUP160	Q12769	1436 aa		27.03	■■□□□ 1.92
NAA60-215	ENST00000572739	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		26.95	■■□□□ 1.9
NAA60-215	ENST00000572739	KIF27	Q86VH2	1401 aa		26.92	■■□□□ 1.9
NAA60-215	ENST00000572739	SHROOM2	Q13796	1616 aa		26.92	■■□□□ 1.9
NAA60-215	ENST00000572739	CUL7	Q14999	1698 aa		26.89	■■□□□ 1.89
NAA60-215	ENST00000572739	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		26.88	■■□□□ 1.89
NAA60-215	ENST00000572739	IGF1R	P08069	1367 aa		26.84	■■□□□ 1.89
NAA60-215	ENST00000572739	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	26.71	■■□□□ 1.87

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