RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570265.5

C15orf41-215, Transcript of chromosome 15 open reading frame 41, humanhuman

TSL 2

Gene C15orf41, Length 1,265 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf41-215ENST00000570265 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.67■■■■■ 5.22
C15orf41-215ENST00000570265 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.42■■■■■ 4.38
C15orf41-215ENST00000570265 ABCC9O60706 1549 aa41.13■■■■■ 4.17
C15orf41-215ENST00000570265 NACADO15069 1562 aa39.84■■■■□ 3.97
C15orf41-215ENST00000570265 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.83■■■■□ 3.97
C15orf41-215ENST00000570265 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.76■■■■□ 3.96
C15orf41-215ENST00000570265 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
C15orf41-215ENST00000570265 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.6■■■■□ 3.93
C15orf41-215ENST00000570265 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.56■■■■□ 3.92
C15orf41-215ENST00000570265 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.81■■■■□ 3.8
C15orf41-215ENST00000570265 SCRIBQ14160 1630 aa38.5■■■■□ 3.75
C15orf41-215ENST00000570265 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.5■■■■□ 3.75
C15orf41-215ENST00000570265 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.4■■■■□ 3.74
C15orf41-215ENST00000570265 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.39■■■■□ 3.74
C15orf41-215ENST00000570265 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.55■■■■□ 3.6
C15orf41-215ENST00000570265 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.6
C15orf41-215ENST00000570265 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.29■■■■□ 3.56
C15orf41-215ENST00000570265 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.02■■■■□ 3.52
C15orf41-215ENST00000570265 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
C15orf41-215ENST00000570265 SMARCA4P51532 1647 aa36.95■■■■□ 3.51
C15orf41-215ENST00000570265 SMARCA2P51531 1590 aa36.75■■■■□ 3.47
C15orf41-215ENST00000570265 NCAPD3P42695 1498 aa36.74■■■■□ 3.47
C15orf41-215ENST00000570265 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.71■■■■□ 3.47
C15orf41-215ENST00000570265 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.69■■■■□ 3.46
C15orf41-215ENST00000570265 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.65■■■■□ 3.46
C15orf41-215ENST00000570265 HMGXB3Q12766 1538 aa36.59■■■■□ 3.45
C15orf41-215ENST00000570265 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
C15orf41-215ENST00000570265 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
C15orf41-215ENST00000570265 WIZO95785 1651 aa36.25■■■■□ 3.39
C15orf41-215ENST00000570265 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
C15orf41-215ENST00000570265 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.76■■■■□ 3.32
C15orf41-215ENST00000570265 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.64■■■■□ 3.3
C15orf41-215ENST00000570265 NESP48681 1621 aa35.61■■■■□ 3.29
C15orf41-215ENST00000570265 ERCC6Q03468 1493 aa35.53■■■■□ 3.28
C15orf41-215ENST00000570265 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.5■■■■□ 3.27
C15orf41-215ENST00000570265 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.49■■■■□ 3.27
C15orf41-215ENST00000570265 CFTRP13569 1480 aa35.47■■■■□ 3.27
C15orf41-215ENST00000570265 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
C15orf41-215ENST00000570265 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.27■■■■□ 3.24
C15orf41-215ENST00000570265 PRDM2Q13029 1718 aa35.25■■■■□ 3.23
C15orf41-215ENST00000570265 CUX2O14529 1486 aa35.22■■■■□ 3.23
C15orf41-215ENST00000570265 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.19■■■■□ 3.22
C15orf41-215ENST00000570265 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
C15orf41-215ENST00000570265 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.16■■■■□ 3.22
C15orf41-215ENST00000570265 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.08■■■■□ 3.21
C15orf41-215ENST00000570265 WDR62O43379 1518 aa34.98■■■■□ 3.19
C15orf41-215ENST00000570265 ABCC8Q09428 1581 aa34.81■■■■□ 3.16
C15orf41-215ENST00000570265 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
C15orf41-215ENST00000570265 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.66■■■■□ 3.14
C15orf41-215ENST00000570265 TOPBP1Q92547 1522 aa34.64■■■■□ 3.14
C15orf41-215ENST00000570265 IFT140Q96RY7 1462 aa34.46■■■■□ 3.11
C15orf41-215ENST00000570265 CUX1P39880 1505 aa34.39■■■■□ 3.1
C15orf41-215ENST00000570265 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
C15orf41-215ENST00000570265 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.28■■■■□ 3.08
C15orf41-215ENST00000570265 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.27■■■■□ 3.08
C15orf41-215ENST00000570265 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
C15orf41-215ENST00000570265 TOP2BQ02880 1626 aa34.22■■■■□ 3.07
C15orf41-215ENST00000570265 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.22■■■■□ 3.07
C15orf41-215ENST00000570265 SOGA1O94964 1423 aa34.21■■■■□ 3.07
C15orf41-215ENST00000570265 WDR97A6NE52 1622 aa34.19■■■■□ 3.06
C15orf41-215ENST00000570265 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
C15orf41-215ENST00000570265 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.11■■■■□ 3.05
C15orf41-215ENST00000570265 SYNJ1O43426 1573 aa34.11■■■■□ 3.05
C15orf41-215ENST00000570265 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
C15orf41-215ENST00000570265 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.08■■■■□ 3.05
C15orf41-215ENST00000570265 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.03■■■■□ 3.04
C15orf41-215ENST00000570265 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.96■■■■□ 3.03
C15orf41-215ENST00000570265 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
C15orf41-215ENST00000570265 GRIN2BQ13224 1484 aa33.85■■■■□ 3.01
C15orf41-215ENST00000570265 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.85■■■■□ 3.01
C15orf41-215ENST00000570265 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.84■■■■□ 3.01
C15orf41-215ENST00000570265 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.78■■■■□ 3
C15orf41-215ENST00000570265 PBRM1Q86U86 1689 aa33.74■■■□□ 2.99
C15orf41-215ENST00000570265 OSCARQ8IYS5 282 aa33.72■■■□□ 2.99
C15orf41-215ENST00000570265 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.69■■■□□ 2.98
C15orf41-215ENST00000570265 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.65■■■□□ 2.98
C15orf41-215ENST00000570265 SYNJ2O15056 1496 aa33.62■■■□□ 2.97
C15orf41-215ENST00000570265 CHD1O14646 1710 aa33.59■■■□□ 2.97
C15orf41-215ENST00000570265 KIF27Q86VH2 1401 aa33.59■■■□□ 2.97
C15orf41-215ENST00000570265 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
C15orf41-215ENST00000570265 TRIM41Q8WV44 630 aa33.51■■■□□ 2.95
C15orf41-215ENST00000570265 FBLN2P98095 1184 aa33.5■■■□□ 2.95
C15orf41-215ENST00000570265 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.5■■■□□ 2.95
C15orf41-215ENST00000570265 ADAMTS12P58397 1594 aa33.5■■■□□ 2.95
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C15orf41-215ENST00000570265 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.3■■■□□ 2.92
C15orf41-215ENST00000570265 NUP160Q12769 1436 aa33.26■■■□□ 2.91
C15orf41-215ENST00000570265 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.2■■■□□ 2.9
C15orf41-215ENST00000570265 CEP170Q5SW79 1584 aa33.16■■■□□ 2.9
C15orf41-215ENST00000570265 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.15■■■□□ 2.9
C15orf41-215ENST00000570265 EEA1Q15075 1411 aa33.13■■■□□ 2.89
C15orf41-215ENST00000570265 ARHGEF11O15085 1522 aa33.12■■■□□ 2.89
C15orf41-215ENST00000570265 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.12■■■□□ 2.89
C15orf41-215ENST00000570265 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.1■■■□□ 2.89
C15orf41-215ENST00000570265 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.1■■■□□ 2.89
C15orf41-215ENST00000570265 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.1■■■□□ 2.89
C15orf41-215ENST00000570265 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.05■■■□□ 2.88
C15orf41-215ENST00000570265 SHROOM2Q13796 1616 aa33■■■□□ 2.87
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