RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569571.5

PRMT7-227, Transcript of protein arginine methyltransferase 7, humanhuman

TSL 5

Gene PRMT7, Length 959 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRMT7-227ENST00000569571 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.36■■■■■ 5.97
PRMT7-227ENST00000569571 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.82■■■■■ 5.09
PRMT7-227ENST00000569571 ABCC9O60706 1549 aa46.45■■■■■ 5.03
PRMT7-227ENST00000569571 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.35■■■■■ 4.69
PRMT7-227ENST00000569571 NACADO15069 1562 aa44.15■■■■■ 4.66
PRMT7-227ENST00000569571 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.96■■■■■ 4.63
PRMT7-227ENST00000569571 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.68■■■■■ 4.58
PRMT7-227ENST00000569571 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
PRMT7-227ENST00000569571 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.48■■■■■ 4.55
PRMT7-227ENST00000569571 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.33■■■■■ 4.53
PRMT7-227ENST00000569571 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.31■■■■■ 4.52
PRMT7-227ENST00000569571 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.27■■■■■ 4.52
PRMT7-227ENST00000569571 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.15■■■■■ 4.5
PRMT7-227ENST00000569571 SCRIBQ14160 1630 aa42.68■■■■■ 4.42
PRMT7-227ENST00000569571 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.49■■■■■ 4.39
PRMT7-227ENST00000569571 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42■■■■■ 4.31
PRMT7-227ENST00000569571 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
PRMT7-227ENST00000569571 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.79■■■■■ 4.28
PRMT7-227ENST00000569571 NCAPD3P42695 1498 aa40.78■■■■■ 4.12
PRMT7-227ENST00000569571 SMARCA4P51532 1647 aa40.77■■■■■ 4.12
PRMT7-227ENST00000569571 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.71■■■■■ 4.11
PRMT7-227ENST00000569571 SMARCA2P51531 1590 aa40.58■■■■■ 4.09
PRMT7-227ENST00000569571 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
PRMT7-227ENST00000569571 HMGXB3Q12766 1538 aa40.5■■■■■ 4.07
PRMT7-227ENST00000569571 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.38■■■■■ 4.05
PRMT7-227ENST00000569571 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.38■■■■■ 4.05
PRMT7-227ENST00000569571 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
PRMT7-227ENST00000569571 NESP48681 1621 aa40.05■■■■■ 4
PRMT7-227ENST00000569571 ERCC6Q03468 1493 aa40.01■■■■■ 4
PRMT7-227ENST00000569571 WIZO95785 1651 aa39.92■■■■□ 3.98
PRMT7-227ENST00000569571 CUX2O14529 1486 aa39.85■■■■□ 3.97
PRMT7-227ENST00000569571 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.78■■■■□ 3.96
PRMT7-227ENST00000569571 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
PRMT7-227ENST00000569571 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
PRMT7-227ENST00000569571 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.55■■■■□ 3.92
PRMT7-227ENST00000569571 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.54■■■■□ 3.92
PRMT7-227ENST00000569571 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.5■■■■□ 3.91
PRMT7-227ENST00000569571 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.45■■■■□ 3.91
PRMT7-227ENST00000569571 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
PRMT7-227ENST00000569571 CFTRP13569 1480 aa39.18■■■■□ 3.86
PRMT7-227ENST00000569571 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.17■■■■□ 3.86
PRMT7-227ENST00000569571 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.09■■■■□ 3.85
PRMT7-227ENST00000569571 WDR62O43379 1518 aa39.08■■■■□ 3.85
PRMT7-227ENST00000569571 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.07■■■■□ 3.85
PRMT7-227ENST00000569571 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.97■■■■□ 3.83
PRMT7-227ENST00000569571 PRDM2Q13029 1718 aa38.86■■■■□ 3.81
PRMT7-227ENST00000569571 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.79■■■■□ 3.8
PRMT7-227ENST00000569571 TOPBP1Q92547 1522 aa38.41■■■■□ 3.74
PRMT7-227ENST00000569571 ABCC8Q09428 1581 aa38.3■■■■□ 3.72
PRMT7-227ENST00000569571 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.29■■■■□ 3.72
PRMT7-227ENST00000569571 IFT140Q96RY7 1462 aa38.28■■■■□ 3.72
PRMT7-227ENST00000569571 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.24■■■■□ 3.71
PRMT7-227ENST00000569571 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.13■■■■□ 3.69
PRMT7-227ENST00000569571 OSCARQ8IYS5 282 aa38.09■■■■□ 3.69
PRMT7-227ENST00000569571 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
PRMT7-227ENST00000569571 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.04■■■■□ 3.68
PRMT7-227ENST00000569571 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.02■■■■□ 3.68
PRMT7-227ENST00000569571 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.93■■■■□ 3.663e-7■■■■■ 30.5
PRMT7-227ENST00000569571 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.91■■■■□ 3.66
PRMT7-227ENST00000569571 CUX1P39880 1505 aa37.91■■■■□ 3.66
PRMT7-227ENST00000569571 SOGA1O94964 1423 aa37.85■■■■□ 3.65
PRMT7-227ENST00000569571 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.84■■■■□ 3.65
PRMT7-227ENST00000569571 TRIM41Q8WV44 630 aa37.81■■■■□ 3.64
PRMT7-227ENST00000569571 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
PRMT7-227ENST00000569571 CHD1O14646 1710 aa37.71■■■■□ 3.63
PRMT7-227ENST00000569571 WDR97A6NE52 1622 aa37.65■■■■□ 3.62
PRMT7-227ENST00000569571 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.61■■■■□ 3.61
PRMT7-227ENST00000569571 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.61■■■■□ 3.61
PRMT7-227ENST00000569571 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.61■■■■□ 3.61
PRMT7-227ENST00000569571 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.53■■■■□ 3.6
PRMT7-227ENST00000569571 FBLN2P98095 1184 aa37.53■■■■□ 3.6
PRMT7-227ENST00000569571 ARHGEF11O15085 1522 aa37.51■■■■□ 3.6
PRMT7-227ENST00000569571 GRIN2BQ13224 1484 aa37.47■■■■□ 3.59
PRMT7-227ENST00000569571 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.45■■■■□ 3.59
PRMT7-227ENST00000569571 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.44■■■■□ 3.58
PRMT7-227ENST00000569571 PBRM1Q86U86 1689 aa37.4■■■■□ 3.58
PRMT7-227ENST00000569571 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.39■■■■□ 3.58
PRMT7-227ENST00000569571 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.39■■■■□ 3.58
PRMT7-227ENST00000569571 TOP2BQ02880 1626 aa37.38■■■■□ 3.57
PRMT7-227ENST00000569571 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.37■■■■□ 3.57
PRMT7-227ENST00000569571 SYNJ1O43426 1573 aa37.37■■■■□ 3.57
PRMT7-227ENST00000569571 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.36■■■■□ 3.57
PRMT7-227ENST00000569571 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.32■■■■□ 3.56
PRMT7-227ENST00000569571 SYNJ2O15056 1496 aa37.31■■■■□ 3.56
PRMT7-227ENST00000569571 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.27■■■■□ 3.56
PRMT7-227ENST00000569571 ARAP1Q96P48 1450 aa37.19■■■■□ 3.54
PRMT7-227ENST00000569571 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.18■■■■□ 3.54
PRMT7-227ENST00000569571 ADAMTS12P58397 1594 aa37.05■■■■□ 3.52
PRMT7-227ENST00000569571 GRIN2AQ12879 1464 aa37.01■■■■□ 3.51
PRMT7-227ENST00000569571 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.97■■■■□ 3.51
PRMT7-227ENST00000569571 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.93■■■■□ 3.5
PRMT7-227ENST00000569571 NUP160Q12769 1436 aa36.89■■■■□ 3.5
PRMT7-227ENST00000569571 CEP170Q5SW79 1584 aa36.89■■■■□ 3.5
PRMT7-227ENST00000569571 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.76■■■■□ 3.48
PRMT7-227ENST00000569571 SHROOM2Q13796 1616 aa36.7■■■■□ 3.47
PRMT7-227ENST00000569571 IGF1RP08069 1367 aa36.62■■■■□ 3.45
PRMT7-227ENST00000569571 KIF27Q86VH2 1401 aa36.6■■■■□ 3.45
PRMT7-227ENST00000569571 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
PRMT7-227ENST00000569571 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.51■■■■□ 3.44
PRMT7-227ENST00000569571 CUL7Q14999 1698 aa36.49■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101 ms