RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569344.5

ACSM2B-218, Transcript of acyl-CoA synthetase medium chain family member 2B, humanhuman

TSL 3

Gene ACSM2B, Length 556 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2B-218ENST00000569344 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.3■■■□□ 2.44
ACSM2B-218ENST00000569344 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.79■■□□□ 1.88
ACSM2B-218ENST00000569344 ABCC9O60706 1549 aa25.81■■□□□ 1.72
ACSM2B-218ENST00000569344 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
ACSM2B-218ENST00000569344 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.22■■□□□ 1.63
ACSM2B-218ENST00000569344 NACADO15069 1562 aa25.08■■□□□ 1.61
ACSM2B-218ENST00000569344 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.07■■□□□ 1.6
ACSM2B-218ENST00000569344 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.02■■□□□ 1.6
ACSM2B-218ENST00000569344 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.02■■□□□ 1.6
ACSM2B-218ENST00000569344 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.52■■□□□ 1.52
ACSM2B-218ENST00000569344 SCRIBQ14160 1630 aa24.49■■□□□ 1.51
ACSM2B-218ENST00000569344 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.22■■□□□ 1.47
ACSM2B-218ENST00000569344 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.22■■□□□ 1.47
ACSM2B-218ENST00000569344 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
ACSM2B-218ENST00000569344 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ACSM2B-218ENST00000569344 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.55■■□□□ 1.36
ACSM2B-218ENST00000569344 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ACSM2B-218ENST00000569344 SMARCA4P51532 1647 aa23.45■■□□□ 1.34
ACSM2B-218ENST00000569344 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.38■■□□□ 1.33
ACSM2B-218ENST00000569344 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.35■■□□□ 1.33
ACSM2B-218ENST00000569344 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.29■■□□□ 1.32
ACSM2B-218ENST00000569344 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ACSM2B-218ENST00000569344 SMARCA2P51531 1590 aa23.21■■□□□ 1.31
ACSM2B-218ENST00000569344 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.18■■□□□ 1.3
ACSM2B-218ENST00000569344 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.18■■□□□ 1.3
ACSM2B-218ENST00000569344 WIZO95785 1651 aa23.17■■□□□ 1.3
ACSM2B-218ENST00000569344 NCAPD3P42695 1498 aa23.1■■□□□ 1.29
ACSM2B-218ENST00000569344 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
ACSM2B-218ENST00000569344 HMGXB3Q12766 1538 aa23.04■■□□□ 1.28
ACSM2B-218ENST00000569344 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
ACSM2B-218ENST00000569344 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ACSM2B-218ENST00000569344 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.64■■□□□ 1.21
ACSM2B-218ENST00000569344 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.47■■□□□ 1.19
ACSM2B-218ENST00000569344 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.47■■□□□ 1.19
ACSM2B-218ENST00000569344 NESP48681 1621 aa22.45■■□□□ 1.18
ACSM2B-218ENST00000569344 CFTRP13569 1480 aa22.41■■□□□ 1.18
ACSM2B-218ENST00000569344 PRDM2Q13029 1718 aa22.39■■□□□ 1.17
ACSM2B-218ENST00000569344 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.3■■□□□ 1.16
ACSM2B-218ENST00000569344 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.26■■□□□ 1.15
ACSM2B-218ENST00000569344 ERCC6Q03468 1493 aa22.24■■□□□ 1.15
ACSM2B-218ENST00000569344 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.22■■□□□ 1.15
ACSM2B-218ENST00000569344 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.16■■□□□ 1.14
ACSM2B-218ENST00000569344 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.03■■□□□ 1.12
ACSM2B-218ENST00000569344 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ACSM2B-218ENST00000569344 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
ACSM2B-218ENST00000569344 ABCC8Q09428 1581 aa21.95■■□□□ 1.11
ACSM2B-218ENST00000569344 WDR62O43379 1518 aa21.95■■□□□ 1.1
ACSM2B-218ENST00000569344 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.94■■□□□ 1.1
ACSM2B-218ENST00000569344 TOPBP1Q92547 1522 aa21.91■■□□□ 1.1
ACSM2B-218ENST00000569344 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
ACSM2B-218ENST00000569344 CUX1P39880 1505 aa21.9■■□□□ 1.1
ACSM2B-218ENST00000569344 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.84■■□□□ 1.09
ACSM2B-218ENST00000569344 SYNJ1O43426 1573 aa21.83■■□□□ 1.09
ACSM2B-218ENST00000569344 TOP2BQ02880 1626 aa21.83■■□□□ 1.08
ACSM2B-218ENST00000569344 CUX2O14529 1486 aa21.83■■□□□ 1.08
ACSM2B-218ENST00000569344 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.76■■□□□ 1.07
ACSM2B-218ENST00000569344 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ACSM2B-218ENST00000569344 TRIM41Q8WV44 630 aa21.7■■□□□ 1.06
ACSM2B-218ENST00000569344 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.68■■□□□ 1.06
ACSM2B-218ENST00000569344 SOGA1O94964 1423 aa21.68■■□□□ 1.06
ACSM2B-218ENST00000569344 IFT140Q96RY7 1462 aa21.67■■□□□ 1.06
ACSM2B-218ENST00000569344 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.65■■□□□ 1.06
ACSM2B-218ENST00000569344 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
ACSM2B-218ENST00000569344 WDR97A6NE52 1622 aa21.58■■□□□ 1.05
ACSM2B-218ENST00000569344 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.56■■□□□ 1.04
ACSM2B-218ENST00000569344 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ACSM2B-218ENST00000569344 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ACSM2B-218ENST00000569344 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ACSM2B-218ENST00000569344 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
ACSM2B-218ENST00000569344 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.45■■□□□ 1.02
ACSM2B-218ENST00000569344 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.44■■□□□ 1.02
ACSM2B-218ENST00000569344 PBRM1Q86U86 1689 aa21.42■■□□□ 1.02
ACSM2B-218ENST00000569344 KIF27Q86VH2 1401 aa21.42■■□□□ 1.02
ACSM2B-218ENST00000569344 GRIN2BQ13224 1484 aa21.37■■□□□ 1.01
ACSM2B-218ENST00000569344 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.34■■□□□ 1.01
ACSM2B-218ENST00000569344 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.32■■□□□ 1
ACSM2B-218ENST00000569344 EEA1Q15075 1411 aa21.29■■□□□ 1
ACSM2B-218ENST00000569344 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.28■■□□□ 1
ACSM2B-218ENST00000569344 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
ACSM2B-218ENST00000569344 IGF1RP08069 1367 aa21.26■□□□□ 0.99
ACSM2B-218ENST00000569344 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
ACSM2B-218ENST00000569344 CUL7Q14999 1698 aa21.24■□□□□ 0.99
ACSM2B-218ENST00000569344 ADAMTS12P58397 1594 aa21.22■□□□□ 0.99
ACSM2B-218ENST00000569344 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.2■□□□□ 0.98
ACSM2B-218ENST00000569344 CHD1O14646 1710 aa21.2■□□□□ 0.98
ACSM2B-218ENST00000569344 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.19■□□□□ 0.98
ACSM2B-218ENST00000569344 FBLN2P98095 1184 aa21.18■□□□□ 0.98
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ACSM2B-218ENST00000569344 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
ACSM2B-218ENST00000569344 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.17■□□□□ 0.98
ACSM2B-218ENST00000569344 GRIN2AQ12879 1464 aa21.09■□□□□ 0.97
ACSM2B-218ENST00000569344 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.09■□□□□ 0.97
ACSM2B-218ENST00000569344 PRXQ9BXM0 1461 aa21.08■□□□□ 0.97
ACSM2B-218ENST00000569344 KIF21BO75037 1637 aa21.05■□□□□ 0.96
ACSM2B-218ENST00000569344 OSCARQ8IYS5 282 aa21.01■□□□□ 0.95
ACSM2B-218ENST00000569344 CEP170Q5SW79 1584 aa20.97■□□□□ 0.95
ACSM2B-218ENST00000569344 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.96■□□□□ 0.95
ACSM2B-218ENST00000569344 NUP160Q12769 1436 aa20.95■□□□□ 0.95
ACSM2B-218ENST00000569344 GOLGA3Q08378 1498 aa20.94■□□□□ 0.94
ACSM2B-218ENST00000569344 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.94■□□□□ 0.94
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