RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568657.1

AMFR-211, Transcript of autocrine motility factor receptor, humanhuman

TSL 4

Gene AMFR, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFR-211ENST00000568657 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.02■■■■■ 6.56
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AMFR-211ENST00000568657 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.42■■■■■ 5.18
AMFR-211ENST00000568657 NACADO15069 1562 aa47.23■■■■■ 5.15
AMFR-211ENST00000568657 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.91■■■■■ 5.1
AMFR-211ENST00000568657 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.79■■■■■ 5.08
AMFR-211ENST00000568657 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.57■■■■■ 5.04
AMFR-211ENST00000568657 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.39■■■■■ 5.02
AMFR-211ENST00000568657 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.36■■■■■ 5.01
AMFR-211ENST00000568657 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.97■■■■■ 4.95
AMFR-211ENST00000568657 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.91■■■■■ 4.94
AMFR-211ENST00000568657 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.64■■■■■ 4.9
AMFR-211ENST00000568657 SCRIBQ14160 1630 aa45.61■■■■■ 4.89
AMFR-211ENST00000568657 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.53■■■■■ 4.88
AMFR-211ENST00000568657 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.77■■■■■ 4.76
AMFR-211ENST00000568657 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.72■■■■■ 4.75
AMFR-211ENST00000568657 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.47■■■■■ 4.71
AMFR-211ENST00000568657 SMARCA4P51532 1647 aa43.62■■■■■ 4.57
AMFR-211ENST00000568657 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.52■■■■■ 4.56
AMFR-211ENST00000568657 NCAPD3P42695 1498 aa43.51■■■■■ 4.56
AMFR-211ENST00000568657 SMARCA2P51531 1590 aa43.46■■■■■ 4.55
AMFR-211ENST00000568657 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.45■■■■■ 4.55
AMFR-211ENST00000568657 HMGXB3Q12766 1538 aa43.32■■■■■ 4.53
AMFR-211ENST00000568657 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.21■■■■■ 4.51
AMFR-211ENST00000568657 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.12■■■■■ 4.49
AMFR-211ENST00000568657 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.11■■■■■ 4.49
AMFR-211ENST00000568657 WIZO95785 1651 aa42.68■■■■■ 4.42
AMFR-211ENST00000568657 ERCC6Q03468 1493 aa42.68■■■■■ 4.42
AMFR-211ENST00000568657 NESP48681 1621 aa42.57■■■■■ 4.4
AMFR-211ENST00000568657 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.53■■■■■ 4.4
AMFR-211ENST00000568657 CUX2O14529 1486 aa42.44■■■■■ 4.38
AMFR-211ENST00000568657 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
AMFR-211ENST00000568657 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
AMFR-211ENST00000568657 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.22■■■■■ 4.35
AMFR-211ENST00000568657 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.2■■■■■ 4.35
AMFR-211ENST00000568657 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.18■■■■■ 4.34
AMFR-211ENST00000568657 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
AMFR-211ENST00000568657 CFTRP13569 1480 aa41.86■■■■■ 4.29
AMFR-211ENST00000568657 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.8■■■■■ 4.28
AMFR-211ENST00000568657 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.78■■■■■ 4.28
AMFR-211ENST00000568657 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.74■■■■■ 4.27
AMFR-211ENST00000568657 PRDM2Q13029 1718 aa41.7■■■■■ 4.27
AMFR-211ENST00000568657 WDR62O43379 1518 aa41.69■■■■■ 4.27
AMFR-211ENST00000568657 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.65■■■■■ 4.26
AMFR-211ENST00000568657 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.61■■■■■ 4.25
AMFR-211ENST00000568657 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
AMFR-211ENST00000568657 ABCC8Q09428 1581 aa41.08■■■■■ 4.17
AMFR-211ENST00000568657 TOPBP1Q92547 1522 aa41.02■■■■■ 4.16
AMFR-211ENST00000568657 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.98■■■■■ 4.15
AMFR-211ENST00000568657 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
AMFR-211ENST00000568657 IFT140Q96RY7 1462 aa40.91■■■■■ 4.14
AMFR-211ENST00000568657 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
AMFR-211ENST00000568657 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
AMFR-211ENST00000568657 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
AMFR-211ENST00000568657 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
AMFR-211ENST00000568657 OSCARQ8IYS5 282 aa40.51■■■■■ 4.08
AMFR-211ENST00000568657 CUX1P39880 1505 aa40.5■■■■■ 4.07
AMFR-211ENST00000568657 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.46■■■■■ 4.07
AMFR-211ENST00000568657 SOGA1O94964 1423 aa40.44■■■■■ 4.06
AMFR-211ENST00000568657 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.4■■■■■ 4.06
AMFR-211ENST00000568657 WDR97A6NE52 1622 aa40.4■■■■■ 4.06
AMFR-211ENST00000568657 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.39■■■■■ 4.061e-8■■■■□ 24
AMFR-211ENST00000568657 CHD1O14646 1710 aa40.23■■■■■ 4.03
AMFR-211ENST00000568657 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
AMFR-211ENST00000568657 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.12■■■■■ 4.01
AMFR-211ENST00000568657 TOP2BQ02880 1626 aa40.09■■■■■ 4.01
AMFR-211ENST00000568657 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.08■■■■■ 4.01
AMFR-211ENST00000568657 GRIN2BQ13224 1484 aa40.07■■■■■ 4.01
AMFR-211ENST00000568657 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.06■■■■■ 4
AMFR-211ENST00000568657 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.06■■■■■ 4
AMFR-211ENST00000568657 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
AMFR-211ENST00000568657 PBRM1Q86U86 1689 aa40.04■■■■■ 4
AMFR-211ENST00000568657 FBLN2P98095 1184 aa40.01■■■■■ 4
AMFR-211ENST00000568657 TRIM41Q8WV44 630 aa40.01■■■■■ 4
AMFR-211ENST00000568657 SYNJ1O43426 1573 aa39.99■■■■□ 3.99
AMFR-211ENST00000568657 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.99■■■■□ 3.99
AMFR-211ENST00000568657 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.98■■■■□ 3.99
AMFR-211ENST00000568657 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.98■■■■□ 3.99
AMFR-211ENST00000568657 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.98■■■■□ 3.99
AMFR-211ENST00000568657 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.98■■■■□ 3.99
AMFR-211ENST00000568657 ARHGEF11O15085 1522 aa39.9■■■■□ 3.98
AMFR-211ENST00000568657 SYNJ2O15056 1496 aa39.88■■■■□ 3.97
AMFR-211ENST00000568657 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
AMFR-211ENST00000568657 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.73■■■■□ 3.95
AMFR-211ENST00000568657 ADAMTS12P58397 1594 aa39.64■■■■□ 3.94
AMFR-211ENST00000568657 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.61■■■■□ 3.93
AMFR-211ENST00000568657 GRIN2AQ12879 1464 aa39.55■■■■□ 3.92
AMFR-211ENST00000568657 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.52■■■■□ 3.92
AMFR-211ENST00000568657 ARAP1Q96P48 1450 aa39.5■■■■□ 3.91
AMFR-211ENST00000568657 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.47■■■■□ 3.91
AMFR-211ENST00000568657 NUP160Q12769 1436 aa39.37■■■■□ 3.89
AMFR-211ENST00000568657 CEP170Q5SW79 1584 aa39.37■■■■□ 3.89
AMFR-211ENST00000568657 KIF27Q86VH2 1401 aa39.3■■■■□ 3.88
AMFR-211ENST00000568657 CUL7Q14999 1698 aa39.22■■■■□ 3.87
AMFR-211ENST00000568657 SHROOM2Q13796 1616 aa39.2■■■■□ 3.87
AMFR-211ENST00000568657 IGF1RP08069 1367 aa39.11■■■■□ 3.85
AMFR-211ENST00000568657 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.07■■■■□ 3.84
AMFR-211ENST00000568657 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.06■■■■□ 3.84
AMFR-211ENST00000568657 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.92■■■■□ 3.82
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