RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567639.1

RAB27A-210, Transcript of RAB27A, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 4

Gene RAB27A, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27A-210ENST00000567639 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.85■■■■■ 6.69
RAB27A-210ENST00000567639 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.61■■■■■ 5.69
RAB27A-210ENST00000567639 ABCC9O60706 1549 aa49.47■■■■■ 5.51
RAB27A-210ENST00000567639 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.62■■■■■ 5.21
RAB27A-210ENST00000567639 NACADO15069 1562 aa47.56■■■■■ 5.2
RAB27A-210ENST00000567639 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.43■■■■■ 5.18
RAB27A-210ENST00000567639 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.39■■■■■ 5.18
RAB27A-210ENST00000567639 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.27■■■■■ 5.16
RAB27A-210ENST00000567639 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.06■■■■■ 5.12
RAB27A-210ENST00000567639 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.54■■■■■ 5.04
RAB27A-210ENST00000567639 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.18■■■■■ 4.98
RAB27A-210ENST00000567639 SCRIBQ14160 1630 aa46.15■■■■■ 4.98
RAB27A-210ENST00000567639 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.15■■■■■ 4.98
RAB27A-210ENST00000567639 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.72■■■■■ 4.91
RAB27A-210ENST00000567639 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.34■■■■■ 4.85
RAB27A-210ENST00000567639 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.95■■■■■ 4.79
RAB27A-210ENST00000567639 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.77■■■■■ 4.76
RAB27A-210ENST00000567639 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.47■■■■■ 4.71
RAB27A-210ENST00000567639 SMARCA4P51532 1647 aa44.14■■■■■ 4.66
RAB27A-210ENST00000567639 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.09■■■■■ 4.65
RAB27A-210ENST00000567639 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.88■■■■■ 4.61
RAB27A-210ENST00000567639 SMARCA2P51531 1590 aa43.86■■■■■ 4.61
RAB27A-210ENST00000567639 NCAPD3P42695 1498 aa43.85■■■■■ 4.61
RAB27A-210ENST00000567639 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.8■■■■■ 4.6
RAB27A-210ENST00000567639 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.71■■■■■ 4.59
RAB27A-210ENST00000567639 HMGXB3Q12766 1538 aa43.68■■■■■ 4.58
RAB27A-210ENST00000567639 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.54■■■■■ 4.56
RAB27A-210ENST00000567639 WIZO95785 1651 aa43.34■■■■■ 4.53
RAB27A-210ENST00000567639 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.29■■■■■ 4.52
RAB27A-210ENST00000567639 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
RAB27A-210ENST00000567639 NESP48681 1621 aa42.79■■■■■ 4.44
RAB27A-210ENST00000567639 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.73■■■■■ 4.43
RAB27A-210ENST00000567639 ERCC6Q03468 1493 aa42.68■■■■■ 4.42
RAB27A-210ENST00000567639 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.56■■■■■ 4.4
RAB27A-210ENST00000567639 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.42■■■■■ 4.38
RAB27A-210ENST00000567639 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.36■■■■■ 4.37
RAB27A-210ENST00000567639 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.34■■■■■ 4.37
RAB27A-210ENST00000567639 CFTRP13569 1480 aa42.33■■■■■ 4.37
RAB27A-210ENST00000567639 CUX2O14529 1486 aa42.23■■■■■ 4.35
RAB27A-210ENST00000567639 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
RAB27A-210ENST00000567639 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
RAB27A-210ENST00000567639 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.11■■■■■ 4.33
RAB27A-210ENST00000567639 PRDM2Q13029 1718 aa42.07■■■■■ 4.33
RAB27A-210ENST00000567639 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.07■■■■■ 4.33
RAB27A-210ENST00000567639 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.01■■■■■ 4.32
RAB27A-210ENST00000567639 WDR62O43379 1518 aa41.88■■■■■ 4.29
RAB27A-210ENST00000567639 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
RAB27A-210ENST00000567639 ABCC8Q09428 1581 aa41.43■■■■■ 4.22
RAB27A-210ENST00000567639 TOPBP1Q92547 1522 aa41.43■■■■■ 4.22
RAB27A-210ENST00000567639 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.41■■■■■ 4.22
RAB27A-210ENST00000567639 IFT140Q96RY7 1462 aa41.18■■■■■ 4.18
RAB27A-210ENST00000567639 CUX1P39880 1505 aa41.11■■■■■ 4.17
RAB27A-210ENST00000567639 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
RAB27A-210ENST00000567639 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.98■■■■■ 4.15
RAB27A-210ENST00000567639 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
RAB27A-210ENST00000567639 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
RAB27A-210ENST00000567639 SOGA1O94964 1423 aa40.88■■■■■ 4.13
RAB27A-210ENST00000567639 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.88■■■■■ 4.13
RAB27A-210ENST00000567639 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.87■■■■■ 4.13
RAB27A-210ENST00000567639 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
RAB27A-210ENST00000567639 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.84■■■■■ 4.13
RAB27A-210ENST00000567639 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.78■■■■■ 4.12
RAB27A-210ENST00000567639 TOP2BQ02880 1626 aa40.77■■■■■ 4.12
RAB27A-210ENST00000567639 SYNJ1O43426 1573 aa40.75■■■■■ 4.11
RAB27A-210ENST00000567639 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.72■■■■■ 4.11
RAB27A-210ENST00000567639 WDR97A6NE52 1622 aa40.7■■■■■ 4.11
RAB27A-210ENST00000567639 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
RAB27A-210ENST00000567639 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.58■■■■■ 4.09
RAB27A-210ENST00000567639 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.45■■■■■ 4.07
RAB27A-210ENST00000567639 GRIN2BQ13224 1484 aa40.44■■■■■ 4.06
RAB27A-210ENST00000567639 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.43■■■■■ 4.06
RAB27A-210ENST00000567639 OSCARQ8IYS5 282 aa40.41■■■■■ 4.06
RAB27A-210ENST00000567639 PBRM1Q86U86 1689 aa40.39■■■■■ 4.06
RAB27A-210ENST00000567639 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.39■■■■■ 4.06
RAB27A-210ENST00000567639 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
RAB27A-210ENST00000567639 CHD1O14646 1710 aa40.34■■■■■ 4.05
RAB27A-210ENST00000567639 FBLN2P98095 1184 aa40.23■■■■■ 4.03
RAB27A-210ENST00000567639 SYNJ2O15056 1496 aa40.19■■■■■ 4.02
RAB27A-210ENST00000567639 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
RAB27A-210ENST00000567639 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.11■■■■■ 4.01
RAB27A-210ENST00000567639 ADAMTS12P58397 1594 aa40.06■■■■■ 4
RAB27A-210ENST00000567639 KIF27Q86VH2 1401 aa39.99■■■■□ 3.99
RAB27A-210ENST00000567639 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.97■■■■□ 3.99
RAB27A-210ENST00000567639 GRIN2AQ12879 1464 aa39.92■■■■□ 3.98
RAB27A-210ENST00000567639 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.9■■■■□ 3.98
RAB27A-210ENST00000567639 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.83■■■■□ 3.97
RAB27A-210ENST00000567639 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.83■■■■□ 3.97
RAB27A-210ENST00000567639 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.83■■■■□ 3.97
RAB27A-210ENST00000567639 TRIM41Q8WV44 630 aa39.82■■■■□ 3.97
RAB27A-210ENST00000567639 ARHGEF11O15085 1522 aa39.81■■■■□ 3.96
RAB27A-210ENST00000567639 IGF1RP08069 1367 aa39.78■■■■□ 3.96
RAB27A-210ENST00000567639 CUL7Q14999 1698 aa39.76■■■■□ 3.96
RAB27A-210ENST00000567639 NUP160Q12769 1436 aa39.74■■■■□ 3.95
RAB27A-210ENST00000567639 CEP170Q5SW79 1584 aa39.72■■■■□ 3.95
RAB27A-210ENST00000567639 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.58■■■■□ 3.93
RAB27A-210ENST00000567639 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.57■■■■□ 3.92
RAB27A-210ENST00000567639 ARAP1Q96P48 1450 aa39.49■■■■□ 3.91
RAB27A-210ENST00000567639 SHROOM2Q13796 1616 aa39.46■■■■□ 3.91
RAB27A-210ENST00000567639 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.38■■■■□ 3.89
RAB27A-210ENST00000567639 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.36■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.7 ms