RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567633.1

PARP6-215, Transcript of poly(ADP-ribose) polymerase family member 6, human

TSL 3

Gene PARP6, Length 405 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PARP6-215	ENST00000567633	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		56.93	■■■■■ 6.7
PARP6-215	ENST00000567633	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.6	■■■■■ 5.69
PARP6-215	ENST00000567633	ABCC9	O60706	1549 aa		49.34	■■■■■ 5.49
PARP6-215	ENST00000567633	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.64	■■■■■ 5.22
PARP6-215	ENST00000567633	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.56	■■■■■ 5.2
PARP6-215	ENST00000567633	NACAD	O15069	1562 aa		47.52	■■■■■ 5.2
PARP6-215	ENST00000567633	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	47.46	■■■■■ 5.19
PARP6-215	ENST00000567633	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		47.22	■■■■■ 5.15
PARP6-215	ENST00000567633	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		47.09	■■■■■ 5.13
PARP6-215	ENST00000567633	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.46	■■■■■ 5.03
PARP6-215	ENST00000567633	SCRIB	Q14160	1630 aa		46.21	■■■■■ 4.99
PARP6-215	ENST00000567633	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.13	■■■■■ 4.98
PARP6-215	ENST00000567633	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.01	■■■■■ 4.96
PARP6-215	ENST00000567633	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.6	■■■■■ 4.89
PARP6-215	ENST00000567633	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		45.01	■■■■■ 4.8
PARP6-215	ENST00000567633	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	44.85	■■■■■ 4.77
PARP6-215	ENST00000567633	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		44.64	■■■■■ 4.74
PARP6-215	ENST00000567633	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.32	■■■■■ 4.69
PARP6-215	ENST00000567633	SMARCA4	P51532	1647 aa		44.17	■■■■■ 4.66
PARP6-215	ENST00000567633	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	44.16	■■■■■ 4.66
PARP6-215	ENST00000567633	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.88	■■■■■ 4.61
PARP6-215	ENST00000567633	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.87	■■■■■ 4.61
PARP6-215	ENST00000567633	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.85	■■■■■ 4.61
PARP6-215	ENST00000567633	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.78	■■■■■ 4.6
PARP6-215	ENST00000567633	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.68	■■■■■ 4.58
PARP6-215	ENST00000567633	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.63	■■■■■ 4.58
PARP6-215	ENST00000567633	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.57	■■■■■ 4.57
PARP6-215	ENST00000567633	WIZ	O95785	1651 aa		43.46	■■■■■ 4.55
PARP6-215	ENST00000567633	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	43.41	■■■■■ 4.54
PARP6-215	ENST00000567633	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	43	■■■■■ 4.47
PARP6-215	ENST00000567633	NES	P48681	1621 aa		42.71	■■■■■ 4.43
PARP6-215	ENST00000567633	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.67	■■■■■ 4.42
PARP6-215	ENST00000567633	ERCC6	Q03468	1493 aa		42.6	■■■■■ 4.41
PARP6-215	ENST00000567633	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	42.57	■■■■■ 4.41
PARP6-215	ENST00000567633	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.55	■■■■■ 4.4
PARP6-215	ENST00000567633	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		42.47	■■■■■ 4.39
PARP6-215	ENST00000567633	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.4	■■■■■ 4.38
PARP6-215	ENST00000567633	CFTR	P13569	1480 aa		42.31	■■■■■ 4.36
PARP6-215	ENST00000567633	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.28	■■■■■ 4.36
PARP6-215	ENST00000567633	PRDM2	Q13029	1718 aa		42.12	■■■■■ 4.33
PARP6-215	ENST00000567633	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		42.1	■■■■■ 4.33
PARP6-215	ENST00000567633	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		42.06	■■■■■ 4.32
PARP6-215	ENST00000567633	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.04	■■■■■ 4.32
PARP6-215	ENST00000567633	CUX2	O14529	1486 aa		42.01	■■■■■ 4.32
PARP6-215	ENST00000567633	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		41.94	■■■■■ 4.3
PARP6-215	ENST00000567633	WDR62	O43379	1518 aa		41.77	■■■■■ 4.28
PARP6-215	ENST00000567633	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.62	■■■■■ 4.25
PARP6-215	ENST00000567633	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.46	■■■■■ 4.23
PARP6-215	ENST00000567633	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.43	■■■■■ 4.22
PARP6-215	ENST00000567633	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.42	■■■■■ 4.22
PARP6-215	ENST00000567633	CUX1	P39880	1505 aa		41.16	■■■■■ 4.18
PARP6-215	ENST00000567633	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.15	■■■■■ 4.18
PARP6-215	ENST00000567633	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	41.08	■■■■■ 4.17
PARP6-215	ENST00000567633	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		41.02	■■■■■ 4.16
PARP6-215	ENST00000567633	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	41.01	■■■■■ 4.15
PARP6-215	ENST00000567633	SOGA1	O94964	1423 aa		40.94	■■■■■ 4.14
PARP6-215	ENST00000567633	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	40.94	■■■■■ 4.14
PARP6-215	ENST00000567633	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.9	■■■■■ 4.14
PARP6-215	ENST00000567633	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	40.9	■■■■■ 4.14
PARP6-215	ENST00000567633	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.88	■■■■■ 4.13
PARP6-215	ENST00000567633	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.88	■■■■■ 4.13
PARP6-215	ENST00000567633	SYNJ1	O43426	1573 aa		40.86	■■■■■ 4.13
PARP6-215	ENST00000567633	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	40.8	■■■■■ 4.12
PARP6-215	ENST00000567633	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.71	■■■■■ 4.11	9e-6	■□□□□ 10.2
PARP6-215	ENST00000567633	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.68	■■■■■ 4.1
PARP6-215	ENST00000567633	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.67	■■■■■ 4.1
PARP6-215	ENST00000567633	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.62	■■■■■ 4.09
PARP6-215	ENST00000567633	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.48	■■■■■ 4.07
PARP6-215	ENST00000567633	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		40.47	■■■■■ 4.07
PARP6-215	ENST00000567633	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.45	■■■■■ 4.07
PARP6-215	ENST00000567633	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.45	■■■■■ 4.07
PARP6-215	ENST00000567633	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.43	■■■■■ 4.06
PARP6-215	ENST00000567633	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.37	■■■■■ 4.05
PARP6-215	ENST00000567633	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.32	■■■■■ 4.05
PARP6-215	ENST00000567633	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		40.32	■■■■■ 4.05
PARP6-215	ENST00000567633	FBLN2	P98095	1184 aa		40.3	■■■■■ 4.04
PARP6-215	ENST00000567633	CHD1	O14646	1710 aa		40.29	■■■■■ 4.04
PARP6-215	ENST00000567633	TRIM41	Q8WV44	630 aa		40.2	■■■■■ 4.03
PARP6-215	ENST00000567633	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.18	■■■■■ 4.02
PARP6-215	ENST00000567633	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.16	■■■■■ 4.02
PARP6-215	ENST00000567633	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		40.16	■■■■■ 4.02
PARP6-215	ENST00000567633	KIF27	Q86VH2	1401 aa		40.15	■■■■■ 4.02
PARP6-215	ENST00000567633	ADAMTS12	P58397	1594 aa		40.07	■■■■■ 4.01
PARP6-215	ENST00000567633	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		40	■■■■□ 3.99
PARP6-215	ENST00000567633	GRIN2A	Q12879	1464 aa		39.92	■■■■□ 3.98
PARP6-215	ENST00000567633	IGF1R	P08069	1367 aa		39.88	■■■■□ 3.97
PARP6-215	ENST00000567633	CUL7	Q14999	1698 aa		39.87	■■■■□ 3.97
PARP6-215	ENST00000567633	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		39.77	■■■■□ 3.96
PARP6-215	ENST00000567633	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		39.75	■■■■□ 3.95
PARP6-215	ENST00000567633	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		39.74	■■■■□ 3.95
PARP6-215	ENST00000567633	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		39.71	■■■■□ 3.95
PARP6-215	ENST00000567633	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.7	■■■■□ 3.95
PARP6-215	ENST00000567633	NUP160	Q12769	1436 aa		39.69	■■■■□ 3.94
PARP6-215	ENST00000567633	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		39.64	■■■■□ 3.94
PARP6-215	ENST00000567633	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		39.64	■■■■□ 3.94
PARP6-215	ENST00000567633	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		39.64	■■■■□ 3.94
PARP6-215	ENST00000567633	ARHGEF11	O15085	1522 aa		39.64	■■■■□ 3.94
PARP6-215	ENST00000567633	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		39.5	■■■■□ 3.91
PARP6-215	ENST00000567633	EEA1	Q15075	1411 aa		39.49	■■■■□ 3.91
PARP6-215	ENST00000567633	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		39.4	■■■■□ 3.9

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