RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565987.5

NUBP2-208, Transcript of nucleotide binding protein 2, human

TSL 5 BASIC

Gene NUBP2, Length 1,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUBP2-208	ENST00000565987	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		39.11	■■■■□ 3.85
NUBP2-208	ENST00000565987	ABCC9	O60706	1549 aa		35.97	■■■■□ 3.35
NUBP2-208	ENST00000565987	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		34.96	■■■■□ 3.19
NUBP2-208	ENST00000565987	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		34.59	■■■■□ 3.13
NUBP2-208	ENST00000565987	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.71	■■■□□ 2.99
NUBP2-208	ENST00000565987	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	33.37	■■■□□ 2.93
NUBP2-208	ENST00000565987	NACAD	O15069	1562 aa		33.25	■■■□□ 2.91
NUBP2-208	ENST00000565987	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		33.05	■■■□□ 2.88
NUBP2-208	ENST00000565987	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.01	■■■□□ 2.87
NUBP2-208	ENST00000565987	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.87	■■■□□ 2.85
NUBP2-208	ENST00000565987	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.58	■■■□□ 2.81
NUBP2-208	ENST00000565987	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
NUBP2-208	ENST00000565987	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		32.44	■■■□□ 2.78
NUBP2-208	ENST00000565987	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		32.4	■■■□□ 2.78
NUBP2-208	ENST00000565987	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.3	■■■□□ 2.76
NUBP2-208	ENST00000565987	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		32.28	■■■□□ 2.76
NUBP2-208	ENST00000565987	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.18	■■■□□ 2.74
NUBP2-208	ENST00000565987	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
NUBP2-208	ENST00000565987	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.93	■■■□□ 2.7
NUBP2-208	ENST00000565987	CUX2	O14529	1486 aa		31.24	■■■□□ 2.59
NUBP2-208	ENST00000565987	ERCC6	Q03468	1493 aa		31.05	■■■□□ 2.56
NUBP2-208	ENST00000565987	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.72	■■■□□ 2.51
NUBP2-208	ENST00000565987	NES	P48681	1621 aa		30.67	■■■□□ 2.5
NUBP2-208	ENST00000565987	TRIM41	Q8WV44	630 aa		30.59	■■■□□ 2.49
NUBP2-208	ENST00000565987	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.56	■■■□□ 2.48
NUBP2-208	ENST00000565987	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	30.48	■■■□□ 2.47
NUBP2-208	ENST00000565987	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.46	■■■□□ 2.47
NUBP2-208	ENST00000565987	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.41	■■■□□ 2.46
NUBP2-208	ENST00000565987	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.36	■■■□□ 2.45
NUBP2-208	ENST00000565987	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.33	■■■□□ 2.45
NUBP2-208	ENST00000565987	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		30.2	■■■□□ 2.43
NUBP2-208	ENST00000565987	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.2	■■■□□ 2.43
NUBP2-208	ENST00000565987	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.16	■■■□□ 2.42
NUBP2-208	ENST00000565987	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.16	■■■□□ 2.42
NUBP2-208	ENST00000565987	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.13	■■■□□ 2.41
NUBP2-208	ENST00000565987	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		30.01	■■■□□ 2.39
NUBP2-208	ENST00000565987	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.87	■■■□□ 2.37
NUBP2-208	ENST00000565987	WIZ	O95785	1651 aa		29.83	■■■□□ 2.37
NUBP2-208	ENST00000565987	WDR62	O43379	1518 aa		29.82	■■■□□ 2.36
NUBP2-208	ENST00000565987	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.77	■■■□□ 2.36
NUBP2-208	ENST00000565987	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.67	■■■□□ 2.34
NUBP2-208	ENST00000565987	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.63	■■■□□ 2.33
NUBP2-208	ENST00000565987	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.56	■■■□□ 2.32
NUBP2-208	ENST00000565987	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		29.48	■■■□□ 2.31
NUBP2-208	ENST00000565987	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		29.48	■■■□□ 2.31
NUBP2-208	ENST00000565987	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		29.48	■■■□□ 2.31
NUBP2-208	ENST00000565987	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.47	■■■□□ 2.31
NUBP2-208	ENST00000565987	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.45	■■■□□ 2.3
NUBP2-208	ENST00000565987	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.33	■■■□□ 2.29
NUBP2-208	ENST00000565987	ARHGEF11	O15085	1522 aa		29.27	■■■□□ 2.28
NUBP2-208	ENST00000565987	CFTR	P13569	1480 aa		29.25	■■■□□ 2.27
NUBP2-208	ENST00000565987	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
NUBP2-208	ENST00000565987	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		29.12	■■■□□ 2.25
NUBP2-208	ENST00000565987	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.11	■■■□□ 2.25
NUBP2-208	ENST00000565987	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
NUBP2-208	ENST00000565987	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.01	■■■□□ 2.23
NUBP2-208	ENST00000565987	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.98	■■■□□ 2.23
NUBP2-208	ENST00000565987	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.95	■■■□□ 2.22
NUBP2-208	ENST00000565987	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
NUBP2-208	ENST00000565987	CHD1	O14646	1710 aa		28.85	■■■□□ 2.21
NUBP2-208	ENST00000565987	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
NUBP2-208	ENST00000565987	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.81	■■■□□ 2.2
NUBP2-208	ENST00000565987	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.73	■■■□□ 2.19	3e-7	■■■■□ 23.2
NUBP2-208	ENST00000565987	FBLN2	P98095	1184 aa		28.71	■■■□□ 2.19
NUBP2-208	ENST00000565987	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
NUBP2-208	ENST00000565987	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.61	■■■□□ 2.17
NUBP2-208	ENST00000565987	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.61	■■■□□ 2.17
NUBP2-208	ENST00000565987	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
NUBP2-208	ENST00000565987	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.48	■■■□□ 2.15
NUBP2-208	ENST00000565987	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.47	■■■□□ 2.15
NUBP2-208	ENST00000565987	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.44	■■■□□ 2.14
NUBP2-208	ENST00000565987	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
NUBP2-208	ENST00000565987	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.4	■■■□□ 2.14
NUBP2-208	ENST00000565987	CUX1	P39880	1505 aa		28.33	■■■□□ 2.13
NUBP2-208	ENST00000565987	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.32	■■■□□ 2.12
NUBP2-208	ENST00000565987	SOGA1	O94964	1423 aa		28.29	■■■□□ 2.12
NUBP2-208	ENST00000565987	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
NUBP2-208	ENST00000565987	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.28	■■■□□ 2.12
NUBP2-208	ENST00000565987	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.23	■■■□□ 2.11
NUBP2-208	ENST00000565987	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.21	■■■□□ 2.11
NUBP2-208	ENST00000565987	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.21	■■■□□ 2.11
NUBP2-208	ENST00000565987	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.15	■■■□□ 2.1
NUBP2-208	ENST00000565987	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.13	■■■□□ 2.09
NUBP2-208	ENST00000565987	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		28.07	■■■□□ 2.08
NUBP2-208	ENST00000565987	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.01	■■■□□ 2.07
NUBP2-208	ENST00000565987	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		27.97	■■■□□ 2.07
NUBP2-208	ENST00000565987	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		27.95	■■■□□ 2.06
NUBP2-208	ENST00000565987	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	27.94	■■■□□ 2.06
NUBP2-208	ENST00000565987	TOP2B	Q02880	1626 aa		27.94	■■■□□ 2.06
NUBP2-208	ENST00000565987	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.92	■■■□□ 2.06
NUBP2-208	ENST00000565987	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		27.88	■■■□□ 2.05
NUBP2-208	ENST00000565987	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NUBP2-208	ENST00000565987	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NUBP2-208	ENST00000565987	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
NUBP2-208	ENST00000565987	NUP160	Q12769	1436 aa		27.73	■■■□□ 2.03
NUBP2-208	ENST00000565987	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.71	■■■□□ 2.03
NUBP2-208	ENST00000565987	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.69	■■■□□ 2.02
NUBP2-208	ENST00000565987	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		27.68	■■■□□ 2.02
NUBP2-208	ENST00000565987	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		27.62	■■■□□ 2.01
NUBP2-208	ENST00000565987	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.62	■■■□□ 2.01

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