RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563995.1

SLX1A-204, Transcript of SLX1 homolog A, structure-specific endonuclease subunit, humanhuman

TSL 3

Gene SLX1A, Length 589 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1A-204ENST00000563995 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.34■■■■■ 5.17
SLX1A-204ENST00000563995 ABCC9O60706 1549 aa42.87■■■■■ 4.45
SLX1A-204ENST00000563995 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.71■■■■■ 4.43
SLX1A-204ENST00000563995 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.35■■■■■ 4.21
SLX1A-204ENST00000563995 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.69■■■■■ 4.1
SLX1A-204ENST00000563995 NACADO15069 1562 aa40.35■■■■■ 4.05
SLX1A-204ENST00000563995 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.96■■■■□ 3.99
SLX1A-204ENST00000563995 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.82■■■■□ 3.97
SLX1A-204ENST00000563995 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.74■■■■□ 3.95
SLX1A-204ENST00000563995 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.73■■■■□ 3.95
SLX1A-204ENST00000563995 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.58■■■■□ 3.93
SLX1A-204ENST00000563995 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.22■■■■□ 3.87
SLX1A-204ENST00000563995 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.14■■■■□ 3.86
SLX1A-204ENST00000563995 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.98■■■■□ 3.83
SLX1A-204ENST00000563995 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.92■■■■□ 3.82
SLX1A-204ENST00000563995 SCRIBQ14160 1630 aa38.81■■■■□ 3.8
SLX1A-204ENST00000563995 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.77■■■■□ 3.8
SLX1A-204ENST00000563995 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.74■■■■□ 3.79
SLX1A-204ENST00000563995 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
SLX1A-204ENST00000563995 CUX2O14529 1486 aa37.48■■■■□ 3.59
SLX1A-204ENST00000563995 NCAPD3P42695 1498 aa37.22■■■■□ 3.55
SLX1A-204ENST00000563995 ERCC6Q03468 1493 aa37.13■■■■□ 3.53
SLX1A-204ENST00000563995 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.07■■■■□ 3.53
SLX1A-204ENST00000563995 SMARCA4P51532 1647 aa37.03■■■■□ 3.52
SLX1A-204ENST00000563995 HMGXB3Q12766 1538 aa36.98■■■■□ 3.51
SLX1A-204ENST00000563995 SMARCA2P51531 1590 aa36.97■■■■□ 3.51
SLX1A-204ENST00000563995 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
SLX1A-204ENST00000563995 NESP48681 1621 aa36.73■■■■□ 3.47
SLX1A-204ENST00000563995 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.7■■■■□ 3.47
SLX1A-204ENST00000563995 TRIM41Q8WV44 630 aa36.69■■■■□ 3.46
SLX1A-204ENST00000563995 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
SLX1A-204ENST00000563995 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.44
SLX1A-204ENST00000563995 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.48■■■■□ 3.43
SLX1A-204ENST00000563995 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.47■■■■□ 3.43
SLX1A-204ENST00000563995 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.36■■■■□ 3.41
SLX1A-204ENST00000563995 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.17■■■■□ 3.38
SLX1A-204ENST00000563995 WIZO95785 1651 aa36.07■■■■□ 3.37
SLX1A-204ENST00000563995 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.02■■■■□ 3.36
SLX1A-204ENST00000563995 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.92■■■■□ 3.34
SLX1A-204ENST00000563995 WDR62O43379 1518 aa35.91■■■■□ 3.34
SLX1A-204ENST00000563995 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
SLX1A-204ENST00000563995 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.72■■■■□ 3.31
SLX1A-204ENST00000563995 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.65■■■■□ 3.3
SLX1A-204ENST00000563995 CFTRP13569 1480 aa35.61■■■■□ 3.29
SLX1A-204ENST00000563995 OSCARQ8IYS5 282 aa35.58■■■■□ 3.29
SLX1A-204ENST00000563995 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.29
SLX1A-204ENST00000563995 PRDM2Q13029 1718 aa35.44■■■■□ 3.26
SLX1A-204ENST00000563995 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
SLX1A-204ENST00000563995 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.23■■■■□ 3.23
SLX1A-204ENST00000563995 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.23■■■■□ 3.23
SLX1A-204ENST00000563995 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.23■■■■□ 3.23
SLX1A-204ENST00000563995 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.11■■■■□ 3.21
SLX1A-204ENST00000563995 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
SLX1A-204ENST00000563995 IFT140Q96RY7 1462 aa35.02■■■■□ 3.2
SLX1A-204ENST00000563995 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
SLX1A-204ENST00000563995 ARHGEF11O15085 1522 aa34.99■■■■□ 3.19
SLX1A-204ENST00000563995 TOPBP1Q92547 1522 aa34.98■■■■□ 3.19
SLX1A-204ENST00000563995 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
SLX1A-204ENST00000563995 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
SLX1A-204ENST00000563995 ABCC8Q09428 1581 aa34.85■■■■□ 3.17
SLX1A-204ENST00000563995 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.85■■■■□ 3.17
SLX1A-204ENST00000563995 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.83■■■■□ 3.17
SLX1A-204ENST00000563995 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
SLX1A-204ENST00000563995 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
SLX1A-204ENST00000563995 CHD1O14646 1710 aa34.71■■■■□ 3.15
SLX1A-204ENST00000563995 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
SLX1A-204ENST00000563995 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.59■■■■□ 3.137e-13■■■■□ 23.3
SLX1A-204ENST00000563995 ARAP1Q96P48 1450 aa34.56■■■■□ 3.12
SLX1A-204ENST00000563995 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.45■■■■□ 3.1
SLX1A-204ENST00000563995 WDR97A6NE52 1622 aa34.39■■■■□ 3.1
SLX1A-204ENST00000563995 SOGA1O94964 1423 aa34.36■■■■□ 3.09
SLX1A-204ENST00000563995 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.33■■■■□ 3.09
SLX1A-204ENST00000563995 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
SLX1A-204ENST00000563995 FBLN2P98095 1184 aa34.3■■■■□ 3.08
SLX1A-204ENST00000563995 CUX1P39880 1505 aa34.3■■■■□ 3.08
SLX1A-204ENST00000563995 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.28■■■■□ 3.08
SLX1A-204ENST00000563995 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.25■■■■□ 3.07
SLX1A-204ENST00000563995 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.06
SLX1A-204ENST00000563995 SYNJ1O43426 1573 aa34.16■■■■□ 3.06
SLX1A-204ENST00000563995 GRIN2BQ13224 1484 aa34.14■■■■□ 3.06
SLX1A-204ENST00000563995 PBRM1Q86U86 1689 aa34.13■■■■□ 3.05
SLX1A-204ENST00000563995 SYNJ2O15056 1496 aa34.07■■■■□ 3.04
SLX1A-204ENST00000563995 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
SLX1A-204ENST00000563995 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34■■■■□ 3.03
SLX1A-204ENST00000563995 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.98■■■■□ 3.03
SLX1A-204ENST00000563995 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.95■■■■□ 3.03
SLX1A-204ENST00000563995 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.75■■■□□ 2.99
SLX1A-204ENST00000563995 ADAMTS12P58397 1594 aa33.74■■■□□ 2.99
SLX1A-204ENST00000563995 GRIN2AQ12879 1464 aa33.72■■■□□ 2.99
SLX1A-204ENST00000563995 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.71■■■□□ 2.99
SLX1A-204ENST00000563995 TOP2BQ02880 1626 aa33.7■■■□□ 2.99
SLX1A-204ENST00000563995 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.68■■■□□ 2.98
SLX1A-204ENST00000563995 CEP170Q5SW79 1584 aa33.67■■■□□ 2.98
SLX1A-204ENST00000563995 NUP160Q12769 1436 aa33.63■■■□□ 2.97
SLX1A-204ENST00000563995 SHROOM2Q13796 1616 aa33.6■■■□□ 2.97
SLX1A-204ENST00000563995 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.53■■■□□ 2.96
SLX1A-204ENST00000563995 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.53■■■□□ 2.96
SLX1A-204ENST00000563995 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
SLX1A-204ENST00000563995 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.34■■■□□ 2.93
SLX1A-204ENST00000563995 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.28■■■□□ 2.92
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