RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559020.1

CERS2-211, Transcript of ceramide synthase 2, humanhuman

TSL 4

Gene CERS2, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS2-211ENST00000559020 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.52■■■■□ 3.28
CERS2-211ENST00000559020 ABCC9O60706 1549 aa32.11■■■□□ 2.73
CERS2-211ENST00000559020 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.06■■■□□ 2.72
CERS2-211ENST00000559020 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.52■■■□□ 2.48
CERS2-211ENST00000559020 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.36■■■□□ 2.45
CERS2-211ENST00000559020 NACADO15069 1562 aa30.24■■■□□ 2.43
CERS2-211ENST00000559020 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.12■■■□□ 2.41
CERS2-211ENST00000559020 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.75■■■□□ 2.35
CERS2-211ENST00000559020 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.75■■■□□ 2.35
CERS2-211ENST00000559020 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.73■■■□□ 2.35
CERS2-211ENST00000559020 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.67■■■□□ 2.34
CERS2-211ENST00000559020 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
CERS2-211ENST00000559020 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.46■■■□□ 2.31
CERS2-211ENST00000559020 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.23■■■□□ 2.27
CERS2-211ENST00000559020 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.12■■■□□ 2.25
CERS2-211ENST00000559020 SCRIBQ14160 1630 aa29.08■■■□□ 2.25
CERS2-211ENST00000559020 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CERS2-211ENST00000559020 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.96■■■□□ 2.23
CERS2-211ENST00000559020 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.03■■■□□ 2.08
CERS2-211ENST00000559020 NCAPD3P42695 1498 aa27.87■■■□□ 2.05
CERS2-211ENST00000559020 CUX2O14529 1486 aa27.83■■■□□ 2.05
CERS2-211ENST00000559020 SMARCA4P51532 1647 aa27.75■■■□□ 2.03
CERS2-211ENST00000559020 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.75■■■□□ 2.03
CERS2-211ENST00000559020 HMGXB3Q12766 1538 aa27.72■■■□□ 2.03
CERS2-211ENST00000559020 ERCC6Q03468 1493 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS2-211ENST00000559020 SMARCA2P51531 1590 aa27.68■■■□□ 2.02
CERS2-211ENST00000559020 NESP48681 1621 aa27.56■■■□□ 2
CERS2-211ENST00000559020 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
CERS2-211ENST00000559020 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.51■■□□□ 1.99
CERS2-211ENST00000559020 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
CERS2-211ENST00000559020 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
CERS2-211ENST00000559020 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.37■■□□□ 1.97
CERS2-211ENST00000559020 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.36■■□□□ 1.97
CERS2-211ENST00000559020 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.33■■□□□ 1.97
CERS2-211ENST00000559020 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.06■■□□□ 1.92
CERS2-211ENST00000559020 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CERS2-211ENST00000559020 WIZO95785 1651 aa27.01■■□□□ 1.92
CERS2-211ENST00000559020 WDR62O43379 1518 aa26.95■■□□□ 1.91
CERS2-211ENST00000559020 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.94■■□□□ 1.9
CERS2-211ENST00000559020 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.93■■□□□ 1.9
CERS2-211ENST00000559020 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CERS2-211ENST00000559020 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.74■■□□□ 1.87
CERS2-211ENST00000559020 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.68■■□□□ 1.86
CERS2-211ENST00000559020 PRDM2Q13029 1718 aa26.67■■□□□ 1.86
CERS2-211ENST00000559020 CFTRP13569 1480 aa26.65■■□□□ 1.86
CERS2-211ENST00000559020 TRIM41Q8WV44 630 aa26.6■■□□□ 1.85
CERS2-211ENST00000559020 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CERS2-211ENST00000559020 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.45■■□□□ 1.82
CERS2-211ENST00000559020 OSCARQ8IYS5 282 aa26.33■■□□□ 1.81
CERS2-211ENST00000559020 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.3■■□□□ 1.8
CERS2-211ENST00000559020 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.3■■□□□ 1.8
CERS2-211ENST00000559020 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.3■■□□□ 1.8
CERS2-211ENST00000559020 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CERS2-211ENST00000559020 IFT140Q96RY7 1462 aa26.2■■□□□ 1.78
CERS2-211ENST00000559020 TOPBP1Q92547 1522 aa26.19■■□□□ 1.78
CERS2-211ENST00000559020 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CERS2-211ENST00000559020 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CERS2-211ENST00000559020 CHD1O14646 1710 aa26.12■■□□□ 1.77
CERS2-211ENST00000559020 ARHGEF11O15085 1522 aa26.11■■□□□ 1.77
CERS2-211ENST00000559020 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.11■■□□□ 1.77
CERS2-211ENST00000559020 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CERS2-211ENST00000559020 ABCC8Q09428 1581 aa26.05■■□□□ 1.76
CERS2-211ENST00000559020 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.748e-9■■■■■ 27
CERS2-211ENST00000559020 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CERS2-211ENST00000559020 ARAP1Q96P48 1450 aa25.85■■□□□ 1.73
CERS2-211ENST00000559020 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.78■■□□□ 1.72
CERS2-211ENST00000559020 WDR97A6NE52 1622 aa25.77■■□□□ 1.72
CERS2-211ENST00000559020 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.73■■□□□ 1.71
CERS2-211ENST00000559020 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.73■■□□□ 1.71
CERS2-211ENST00000559020 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.68■■□□□ 1.7
CERS2-211ENST00000559020 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.67■■□□□ 1.7
CERS2-211ENST00000559020 SOGA1O94964 1423 aa25.67■■□□□ 1.7
CERS2-211ENST00000559020 CUX1P39880 1505 aa25.67■■□□□ 1.7
CERS2-211ENST00000559020 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
CERS2-211ENST00000559020 PBRM1Q86U86 1689 aa25.64■■□□□ 1.7
CERS2-211ENST00000559020 FBLN2P98095 1184 aa25.62■■□□□ 1.69
CERS2-211ENST00000559020 SYNJ1O43426 1573 aa25.61■■□□□ 1.69
CERS2-211ENST00000559020 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CERS2-211ENST00000559020 GRIN2BQ13224 1484 aa25.53■■□□□ 1.68
CERS2-211ENST00000559020 SYNJ2O15056 1496 aa25.51■■□□□ 1.67
CERS2-211ENST00000559020 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.49■■□□□ 1.67
CERS2-211ENST00000559020 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CERS2-211ENST00000559020 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
CERS2-211ENST00000559020 TOP2BQ02880 1626 aa25.42■■□□□ 1.66
CERS2-211ENST00000559020 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.41■■□□□ 1.66
CERS2-211ENST00000559020 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CERS2-211ENST00000559020 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.4■■□□□ 1.66
CERS2-211ENST00000559020 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.39■■□□□ 1.66
CERS2-211ENST00000559020 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.3■■□□□ 1.64
CERS2-211ENST00000559020 ADAMTS12P58397 1594 aa25.29■■□□□ 1.64
CERS2-211ENST00000559020 CEP170Q5SW79 1584 aa25.25■■□□□ 1.63
CERS2-211ENST00000559020 SHROOM2Q13796 1616 aa25.24■■□□□ 1.63
CERS2-211ENST00000559020 GRIN2AQ12879 1464 aa25.24■■□□□ 1.63
CERS2-211ENST00000559020 NUP160Q12769 1436 aa25.18■■□□□ 1.62
CERS2-211ENST00000559020 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.15■■□□□ 1.62
CERS2-211ENST00000559020 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.07■■□□□ 1.6
CERS2-211ENST00000559020 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.04■■□□□ 1.6
CERS2-211ENST00000559020 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.96■■□□□ 1.59
CERS2-211ENST00000559020 KIF27Q86VH2 1401 aa24.96■■□□□ 1.59
CERS2-211ENST00000559020 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.6 ms