RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557991.5

RNF31-205, Transcript of ring finger protein 31, humanhuman

TSL 4

Gene RNF31, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31-205ENST00000557991 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.87■■■■■ 5.73
RNF31-205ENST00000557991 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.34■■■■■ 4.85
RNF31-205ENST00000557991 ABCC9O60706 1549 aa44.19■■■■■ 4.66
RNF31-205ENST00000557991 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.62■■■■■ 4.41
RNF31-205ENST00000557991 NACADO15069 1562 aa42.55■■■■■ 4.4
RNF31-205ENST00000557991 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.48■■■■■ 4.39
RNF31-205ENST00000557991 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
RNF31-205ENST00000557991 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.27■■■■■ 4.36
RNF31-205ENST00000557991 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.11■■■■■ 4.33
RNF31-205ENST00000557991 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.7■■■■■ 4.27
RNF31-205ENST00000557991 SCRIBQ14160 1630 aa41.31■■■■■ 4.2
RNF31-205ENST00000557991 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.23■■■■■ 4.19
RNF31-205ENST00000557991 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.23■■■■■ 4.19
RNF31-205ENST00000557991 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.88■■■■■ 4.13
RNF31-205ENST00000557991 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.36■■■■■ 4.05
RNF31-205ENST00000557991 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
RNF31-205ENST00000557991 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.02■■■■■ 4
RNF31-205ENST00000557991 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.7■■■■□ 3.95
RNF31-205ENST00000557991 SMARCA4P51532 1647 aa39.51■■■■□ 3.92
RNF31-205ENST00000557991 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
RNF31-205ENST00000557991 SMARCA2P51531 1590 aa39.26■■■■□ 3.88
RNF31-205ENST00000557991 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.21■■■■□ 3.87
RNF31-205ENST00000557991 NCAPD3P42695 1498 aa39.18■■■■□ 3.86
RNF31-205ENST00000557991 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.18■■■■□ 3.86
RNF31-205ENST00000557991 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.11■■■■□ 3.85
RNF31-205ENST00000557991 HMGXB3Q12766 1538 aa39.07■■■■□ 3.84
RNF31-205ENST00000557991 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.96■■■■□ 3.83
RNF31-205ENST00000557991 WIZO95785 1651 aa38.83■■■■□ 3.81
RNF31-205ENST00000557991 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.72■■■■□ 3.79
RNF31-205ENST00000557991 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
RNF31-205ENST00000557991 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.25■■■■□ 3.71
RNF31-205ENST00000557991 NESP48681 1621 aa38.23■■■■□ 3.71
RNF31-205ENST00000557991 ERCC6Q03468 1493 aa38.15■■■■□ 3.7
RNF31-205ENST00000557991 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.05■■■■□ 3.68
RNF31-205ENST00000557991 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.95■■■■□ 3.67
RNF31-205ENST00000557991 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.91■■■■□ 3.66
RNF31-205ENST00000557991 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.9■■■■□ 3.66
RNF31-205ENST00000557991 CFTRP13569 1480 aa37.84■■■■□ 3.65
RNF31-205ENST00000557991 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.81■■■■□ 3.64
RNF31-205ENST00000557991 PRDM2Q13029 1718 aa37.78■■■■□ 3.64
RNF31-205ENST00000557991 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
RNF31-205ENST00000557991 CUX2O14529 1486 aa37.71■■■■□ 3.63
RNF31-205ENST00000557991 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.64■■■■□ 3.62
RNF31-205ENST00000557991 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.64■■■■□ 3.62
RNF31-205ENST00000557991 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.54■■■■□ 3.6
RNF31-205ENST00000557991 WDR62O43379 1518 aa37.42■■■■□ 3.58
RNF31-205ENST00000557991 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
RNF31-205ENST00000557991 ABCC8Q09428 1581 aa37.11■■■■□ 3.53
RNF31-205ENST00000557991 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.05■■■■□ 3.52
RNF31-205ENST00000557991 TOPBP1Q92547 1522 aa37.05■■■■□ 3.52
RNF31-205ENST00000557991 IFT140Q96RY7 1462 aa36.82■■■■□ 3.48
RNF31-205ENST00000557991 CUX1P39880 1505 aa36.77■■■■□ 3.48
RNF31-205ENST00000557991 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
RNF31-205ENST00000557991 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.66■■■■□ 3.46
RNF31-205ENST00000557991 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
RNF31-205ENST00000557991 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
RNF31-205ENST00000557991 SOGA1O94964 1423 aa36.58■■■■□ 3.45
RNF31-205ENST00000557991 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.57■■■■□ 3.44
RNF31-205ENST00000557991 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
RNF31-205ENST00000557991 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.55■■■■□ 3.44
RNF31-205ENST00000557991 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.54■■■■□ 3.44
RNF31-205ENST00000557991 TOP2BQ02880 1626 aa36.52■■■■□ 3.44
RNF31-205ENST00000557991 SYNJ1O43426 1573 aa36.49■■■■□ 3.43
RNF31-205ENST00000557991 WDR97A6NE52 1622 aa36.45■■■■□ 3.43
RNF31-205ENST00000557991 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.4■■■■□ 3.42
RNF31-205ENST00000557991 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.39■■■■□ 3.429e-11■■■■■ 32.3
RNF31-205ENST00000557991 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
RNF31-205ENST00000557991 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.3■■■■□ 3.4
RNF31-205ENST00000557991 PBRM1Q86U86 1689 aa36.22■■■■□ 3.39
RNF31-205ENST00000557991 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.19■■■■□ 3.38
RNF31-205ENST00000557991 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.18■■■■□ 3.38
RNF31-205ENST00000557991 GRIN2BQ13224 1484 aa36.17■■■■□ 3.38
RNF31-205ENST00000557991 CHD1O14646 1710 aa36.13■■■■□ 3.37
RNF31-205ENST00000557991 OSCARQ8IYS5 282 aa36.11■■■■□ 3.37
RNF31-205ENST00000557991 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.11■■■■□ 3.37
RNF31-205ENST00000557991 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
RNF31-205ENST00000557991 FBLN2P98095 1184 aa36■■■■□ 3.35
RNF31-205ENST00000557991 SYNJ2O15056 1496 aa35.93■■■■□ 3.34
RNF31-205ENST00000557991 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.91■■■■□ 3.34
RNF31-205ENST00000557991 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
RNF31-205ENST00000557991 ADAMTS12P58397 1594 aa35.85■■■■□ 3.33
RNF31-205ENST00000557991 KIF27Q86VH2 1401 aa35.82■■■■□ 3.32
RNF31-205ENST00000557991 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.75■■■■□ 3.31
RNF31-205ENST00000557991 TRIM41Q8WV44 630 aa35.73■■■■□ 3.31
RNF31-205ENST00000557991 GRIN2AQ12879 1464 aa35.71■■■■□ 3.31
RNF31-205ENST00000557991 CUL7Q14999 1698 aa35.66■■■■□ 3.3
RNF31-205ENST00000557991 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.64■■■■□ 3.3
RNF31-205ENST00000557991 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.59■■■■□ 3.29
RNF31-205ENST00000557991 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.59■■■■□ 3.29
RNF31-205ENST00000557991 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.59■■■■□ 3.29
RNF31-205ENST00000557991 IGF1RP08069 1367 aa35.58■■■■□ 3.29
RNF31-205ENST00000557991 ARHGEF11O15085 1522 aa35.55■■■■□ 3.28
RNF31-205ENST00000557991 CEP170Q5SW79 1584 aa35.52■■■■□ 3.28
RNF31-205ENST00000557991 NUP160Q12769 1436 aa35.5■■■■□ 3.27
RNF31-205ENST00000557991 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.42■■■■□ 3.26
RNF31-205ENST00000557991 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.42■■■■□ 3.26
RNF31-205ENST00000557991 SHROOM2Q13796 1616 aa35.29■■■■□ 3.24
RNF31-205ENST00000557991 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.25■■■■□ 3.23
RNF31-205ENST00000557991 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.25■■■■□ 3.23
RNF31-205ENST00000557991 ARAP1Q96P48 1450 aa35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 285.3 ms