RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557762.1

RIN3-211, Transcript of Ras and Rab interactor 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RIN3, Length 517 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3-211ENST00000557762 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.69■■■■■ 4.26
RIN3-211ENST00000557762 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.1■■■■□ 3.53
RIN3-211ENST00000557762 ABCC9O60706 1549 aa35.99■■■■□ 3.35
RIN3-211ENST00000557762 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
RIN3-211ENST00000557762 NACADO15069 1562 aa34.76■■■■□ 3.16
RIN3-211ENST00000557762 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.76■■■■□ 3.16
RIN3-211ENST00000557762 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.65■■■■□ 3.14
RIN3-211ENST00000557762 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.55■■■■□ 3.12
RIN3-211ENST00000557762 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.47■■■■□ 3.11
RIN3-211ENST00000557762 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.13■■■■□ 3.05
RIN3-211ENST00000557762 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.78■■■■□ 3
RIN3-211ENST00000557762 SCRIBQ14160 1630 aa33.76■■■■□ 3
RIN3-211ENST00000557762 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.56■■■□□ 2.96
RIN3-211ENST00000557762 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.41■■■□□ 2.94
RIN3-211ENST00000557762 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.9■■■□□ 2.86
RIN3-211ENST00000557762 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.82■■■□□ 2.84
RIN3-211ENST00000557762 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.65■■■□□ 2.82
RIN3-211ENST00000557762 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.43■■■□□ 2.78
RIN3-211ENST00000557762 SMARCA4P51532 1647 aa32.36■■■□□ 2.77
RIN3-211ENST00000557762 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
RIN3-211ENST00000557762 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.13■■■□□ 2.73
RIN3-211ENST00000557762 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.09■■■□□ 2.73
RIN3-211ENST00000557762 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.07■■■□□ 2.72
RIN3-211ENST00000557762 SMARCA2P51531 1590 aa32.07■■■□□ 2.72
RIN3-211ENST00000557762 NCAPD3P42695 1498 aa32.04■■■□□ 2.72
RIN3-211ENST00000557762 HMGXB3Q12766 1538 aa31.96■■■□□ 2.71
RIN3-211ENST00000557762 WIZO95785 1651 aa31.82■■■□□ 2.68
RIN3-211ENST00000557762 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
RIN3-211ENST00000557762 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.68
RIN3-211ENST00000557762 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
RIN3-211ENST00000557762 NESP48681 1621 aa31.23■■■□□ 2.59
RIN3-211ENST00000557762 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.22■■■□□ 2.59
RIN3-211ENST00000557762 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.07■■■□□ 2.56
RIN3-211ENST00000557762 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.05■■■□□ 2.56
RIN3-211ENST00000557762 CFTRP13569 1480 aa30.97■■■□□ 2.55
RIN3-211ENST00000557762 ERCC6Q03468 1493 aa30.97■■■□□ 2.55
RIN3-211ENST00000557762 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.97■■■□□ 2.55
RIN3-211ENST00000557762 PRDM2Q13029 1718 aa30.92■■■□□ 2.54
RIN3-211ENST00000557762 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.9■■■□□ 2.54
RIN3-211ENST00000557762 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
RIN3-211ENST00000557762 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
RIN3-211ENST00000557762 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.74■■■□□ 2.51
RIN3-211ENST00000557762 CUX2O14529 1486 aa30.69■■■□□ 2.5
RIN3-211ENST00000557762 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.69■■■□□ 2.5
RIN3-211ENST00000557762 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.63■■■□□ 2.49
RIN3-211ENST00000557762 WDR62O43379 1518 aa30.58■■■□□ 2.49
RIN3-211ENST00000557762 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
RIN3-211ENST00000557762 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.3■■■□□ 2.44
RIN3-211ENST00000557762 TOPBP1Q92547 1522 aa30.3■■■□□ 2.44
RIN3-211ENST00000557762 ABCC8Q09428 1581 aa30.27■■■□□ 2.44
RIN3-211ENST00000557762 CUX1P39880 1505 aa30.13■■■□□ 2.41
RIN3-211ENST00000557762 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
RIN3-211ENST00000557762 IFT140Q96RY7 1462 aa30.05■■■□□ 2.4
RIN3-211ENST00000557762 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
RIN3-211ENST00000557762 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.98■■■□□ 2.39
RIN3-211ENST00000557762 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.98■■■□□ 2.39
RIN3-211ENST00000557762 TOP2BQ02880 1626 aa29.94■■■□□ 2.38
RIN3-211ENST00000557762 SYNJ1O43426 1573 aa29.93■■■□□ 2.38
RIN3-211ENST00000557762 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.92■■■□□ 2.38
RIN3-211ENST00000557762 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
RIN3-211ENST00000557762 WDR97A6NE52 1622 aa29.88■■■□□ 2.37
RIN3-211ENST00000557762 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.87■■■□□ 2.37
RIN3-211ENST00000557762 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
RIN3-211ENST00000557762 SOGA1O94964 1423 aa29.85■■■□□ 2.37
RIN3-211ENST00000557762 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.72■■■□□ 2.35
RIN3-211ENST00000557762 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.71■■■□□ 2.35
RIN3-211ENST00000557762 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.66■■■□□ 2.34
RIN3-211ENST00000557762 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
RIN3-211ENST00000557762 PBRM1Q86U86 1689 aa29.6■■■□□ 2.33
RIN3-211ENST00000557762 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.54■■■□□ 2.32
RIN3-211ENST00000557762 GRIN2BQ13224 1484 aa29.53■■■□□ 2.32
RIN3-211ENST00000557762 CHD1O14646 1710 aa29.49■■■□□ 2.31
RIN3-211ENST00000557762 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.49■■■□□ 2.31
RIN3-211ENST00000557762 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.48■■■□□ 2.31
RIN3-211ENST00000557762 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
RIN3-211ENST00000557762 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.37■■■□□ 2.29
RIN3-211ENST00000557762 ADAMTS12P58397 1594 aa29.35■■■□□ 2.29
RIN3-211ENST00000557762 SYNJ2O15056 1496 aa29.33■■■□□ 2.29
RIN3-211ENST00000557762 OSCARQ8IYS5 282 aa29.29■■■□□ 2.28
RIN3-211ENST00000557762 KIF27Q86VH2 1401 aa29.26■■■□□ 2.27
RIN3-211ENST00000557762 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.2■■■□□ 2.27
RIN3-211ENST00000557762 FBLN2P98095 1184 aa29.18■■■□□ 2.26
RIN3-211ENST00000557762 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
RIN3-211ENST00000557762 TRIM41Q8WV44 630 aa29.17■■■□□ 2.26
RIN3-211ENST00000557762 CUL7Q14999 1698 aa29.17■■■□□ 2.26
RIN3-211ENST00000557762 GRIN2AQ12879 1464 aa29.17■■■□□ 2.26
RIN3-211ENST00000557762 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.15■■■□□ 2.26
RIN3-211ENST00000557762 IGF1RP08069 1367 aa29.13■■■□□ 2.25
RIN3-211ENST00000557762 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.1■■■□□ 2.25
RIN3-211ENST00000557762 CEP170Q5SW79 1584 aa29.07■■■□□ 2.24
RIN3-211ENST00000557762 NUP160Q12769 1436 aa29.05■■■□□ 2.24
RIN3-211ENST00000557762 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29■■■□□ 2.23
RIN3-211ENST00000557762 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29■■■□□ 2.23
RIN3-211ENST00000557762 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29■■■□□ 2.23
RIN3-211ENST00000557762 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.98■■■□□ 2.23
RIN3-211ENST00000557762 ARHGEF11O15085 1522 aa28.96■■■□□ 2.23
RIN3-211ENST00000557762 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.95■■■□□ 2.22
RIN3-211ENST00000557762 SHROOM2Q13796 1616 aa28.9■■■□□ 2.22
RIN3-211ENST00000557762 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.83■■■□□ 2.21
RIN3-211ENST00000557762 EEA1Q15075 1411 aa28.82■■■□□ 2.2
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