RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556333.1

RCCD1-205, Transcript of RCC1 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RCCD1, Length 735 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1-205ENST00000556333 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.48■■■■■ 5.35
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RCCD1-205ENST00000556333 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.43■■■■■ 4.06
RCCD1-205ENST00000556333 NACADO15069 1562 aa40.39■■■■■ 4.06
RCCD1-205ENST00000556333 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.13■■■■■ 4.01
RCCD1-205ENST00000556333 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.08■■■■■ 4.01
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RCCD1-205ENST00000556333 SCRIBQ14160 1630 aa39.37■■■■□ 3.89
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RCCD1-205ENST00000556333 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.68■■■■□ 3.78
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RCCD1-205ENST00000556333 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.94■■■■□ 3.66
RCCD1-205ENST00000556333 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.75■■■■□ 3.63
RCCD1-205ENST00000556333 SMARCA4P51532 1647 aa37.64■■■■□ 3.62
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RCCD1-205ENST00000556333 SMARCA2P51531 1590 aa37.31■■■■□ 3.56
RCCD1-205ENST00000556333 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.28■■■■□ 3.56
RCCD1-205ENST00000556333 NCAPD3P42695 1498 aa37.2■■■■□ 3.54
RCCD1-205ENST00000556333 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.18■■■■□ 3.54
RCCD1-205ENST00000556333 WIZO95785 1651 aa37.1■■■■□ 3.53
RCCD1-205ENST00000556333 HMGXB3Q12766 1538 aa37.1■■■■□ 3.53
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RCCD1-205ENST00000556333 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.28■■■■□ 3.4
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RCCD1-205ENST00000556333 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.15■■■■□ 3.38
RCCD1-205ENST00000556333 ERCC6Q03468 1493 aa36.13■■■■□ 3.37
RCCD1-205ENST00000556333 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.02■■■■□ 3.36
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RCCD1-205ENST00000556333 CFTRP13569 1480 aa35.98■■■■□ 3.35
RCCD1-205ENST00000556333 PRDM2Q13029 1718 aa35.97■■■■□ 3.35
RCCD1-205ENST00000556333 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.79■■■■□ 3.32
RCCD1-205ENST00000556333 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.74■■■■□ 3.31
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RCCD1-205ENST00000556333 TOPBP1Q92547 1522 aa35.24■■■■□ 3.23
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RCCD1-205ENST00000556333 IFT140Q96RY7 1462 aa34.94■■■■□ 3.18
RCCD1-205ENST00000556333 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.93■■■■□ 3.18
RCCD1-205ENST00000556333 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.89■■■■□ 3.18
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RCCD1-205ENST00000556333 WDR97A6NE52 1622 aa34.69■■■■□ 3.14
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RCCD1-205ENST00000556333 CHD1O14646 1710 aa34.33■■■■□ 3.09
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RCCD1-205ENST00000556333 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.17■■■■□ 3.06
RCCD1-205ENST00000556333 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
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RCCD1-205ENST00000556333 CEP170Q5SW79 1584 aa33.8■■■■□ 3
RCCD1-205ENST00000556333 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.79■■■■□ 3
RCCD1-205ENST00000556333 NUP160Q12769 1436 aa33.72■■■□□ 2.99
RCCD1-205ENST00000556333 EEA1Q15075 1411 aa33.68■■■□□ 2.98
RCCD1-205ENST00000556333 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.66■■■□□ 2.98
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