RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555766.1

PAX8-AS1-211, PAX8 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PAX8-AS1, Length 1,499 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8-AS1-211ENST00000555766 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.38■■□□□ 1.01
PAX8-AS1-211ENST00000555766 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.93■□□□□ 0.62
PAX8-AS1-211ENST00000555766 ABCC9O60706 1549 aa18.57■□□□□ 0.56
PAX8-AS1-211ENST00000555766 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.06■□□□□ 0.48
PAX8-AS1-211ENST00000555766 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
PAX8-AS1-211ENST00000555766 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.82■□□□□ 0.44
PAX8-AS1-211ENST00000555766 NACADO15069 1562 aa17.77■□□□□ 0.44
PAX8-AS1-211ENST00000555766 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.61■□□□□ 0.41
PAX8-AS1-211ENST00000555766 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.61■□□□□ 0.41
PAX8-AS1-211ENST00000555766 SCRIBQ14160 1630 aa17.42■□□□□ 0.38
PAX8-AS1-211ENST00000555766 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.42■□□□□ 0.38
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PAX8-AS1-211ENST00000555766 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.25■□□□□ 0.35
PAX8-AS1-211ENST00000555766 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.16■□□□□ 0.34
PAX8-AS1-211ENST00000555766 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.98■□□□□ 0.31
PAX8-AS1-211ENST00000555766 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
PAX8-AS1-211ENST00000555766 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.75■□□□□ 0.27
PAX8-AS1-211ENST00000555766 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.7■□□□□ 0.26
PAX8-AS1-211ENST00000555766 SMARCA4P51532 1647 aa16.59■□□□□ 0.25
PAX8-AS1-211ENST00000555766 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
PAX8-AS1-211ENST00000555766 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.52■□□□□ 0.24
PAX8-AS1-211ENST00000555766 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.46■□□□□ 0.23
PAX8-AS1-211ENST00000555766 SMARCA2P51531 1590 aa16.44■□□□□ 0.22
PAX8-AS1-211ENST00000555766 NCAPD3P42695 1498 aa16.39■□□□□ 0.21
PAX8-AS1-211ENST00000555766 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
PAX8-AS1-211ENST00000555766 WIZO95785 1651 aa16.38■□□□□ 0.21
PAX8-AS1-211ENST00000555766 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PAX8-AS1-211ENST00000555766 HMGXB3Q12766 1538 aa16.33■□□□□ 0.21
PAX8-AS1-211ENST00000555766 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.33■□□□□ 0.21
PAX8-AS1-211ENST00000555766 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
PAX8-AS1-211ENST00000555766 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PAX8-AS1-211ENST00000555766 NESP48681 1621 aa16.08■□□□□ 0.16
PAX8-AS1-211ENST00000555766 ERCC6Q03468 1493 aa16.01■□□□□ 0.15
PAX8-AS1-211ENST00000555766 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.99■□□□□ 0.15
PAX8-AS1-211ENST00000555766 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.97■□□□□ 0.15
PAX8-AS1-211ENST00000555766 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.97■□□□□ 0.15
PAX8-AS1-211ENST00000555766 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.89■□□□□ 0.13
PAX8-AS1-211ENST00000555766 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.88■□□□□ 0.13
PAX8-AS1-211ENST00000555766 CFTRP13569 1480 aa15.87■□□□□ 0.13
PAX8-AS1-211ENST00000555766 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.82■□□□□ 0.12
PAX8-AS1-211ENST00000555766 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.8■□□□□ 0.12
PAX8-AS1-211ENST00000555766 PRDM2Q13029 1718 aa15.77■□□□□ 0.11
PAX8-AS1-211ENST00000555766 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
PAX8-AS1-211ENST00000555766 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.74■□□□□ 0.11
PAX8-AS1-211ENST00000555766 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.69■□□□□ 0.1
PAX8-AS1-211ENST00000555766 CUX2O14529 1486 aa15.68■□□□□ 0.1
PAX8-AS1-211ENST00000555766 WDR62O43379 1518 aa15.64■□□□□ 0.09
PAX8-AS1-211ENST00000555766 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PAX8-AS1-211ENST00000555766 TOPBP1Q92547 1522 aa15.56■□□□□ 0.08
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PAX8-AS1-211ENST00000555766 ABCC8Q09428 1581 aa15.51■□□□□ 0.07
PAX8-AS1-211ENST00000555766 CUX1P39880 1505 aa15.49■□□□□ 0.07
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PAX8-AS1-211ENST00000555766 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.44■□□□□ 0.06
PAX8-AS1-211ENST00000555766 IFT140Q96RY7 1462 aa15.43■□□□□ 0.06
PAX8-AS1-211ENST00000555766 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.42■□□□□ 0.06
PAX8-AS1-211ENST00000555766 SYNJ1O43426 1573 aa15.41■□□□□ 0.06
PAX8-AS1-211ENST00000555766 SOGA1O94964 1423 aa15.4■□□□□ 0.06
PAX8-AS1-211ENST00000555766 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
PAX8-AS1-211ENST00000555766 TOP2BQ02880 1626 aa15.36■□□□□ 0.05
PAX8-AS1-211ENST00000555766 CHIC1Q5VXU3 224 aa15.36■□□□□ 0.05
PAX8-AS1-211ENST00000555766 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PAX8-AS1-211ENST00000555766 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.35■□□□□ 0.05
PAX8-AS1-211ENST00000555766 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.34■□□□□ 0.05
PAX8-AS1-211ENST00000555766 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.05
PAX8-AS1-211ENST00000555766 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
PAX8-AS1-211ENST00000555766 WDR97A6NE52 1622 aa15.25■□□□□ 0.03
PAX8-AS1-211ENST00000555766 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PAX8-AS1-211ENST00000555766 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.24■□□□□ 0.03
PAX8-AS1-211ENST00000555766 FBLN2P98095 1184 aa15.24■□□□□ 0.03
PAX8-AS1-211ENST00000555766 TRIM41Q8WV44 630 aa15.23■□□□□ 0.03
PAX8-AS1-211ENST00000555766 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.21■□□□□ 0.03
PAX8-AS1-211ENST00000555766 GRIN2BQ13224 1484 aa15.19■□□□□ 0.02
PAX8-AS1-211ENST00000555766 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.19■□□□□ 0.02
PAX8-AS1-211ENST00000555766 PBRM1Q86U86 1689 aa15.19■□□□□ 0.02
PAX8-AS1-211ENST00000555766 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.18■□□□□ 0.02
PAX8-AS1-211ENST00000555766 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
PAX8-AS1-211ENST00000555766 CHD1O14646 1710 aa15.13■□□□□ 0.01
PAX8-AS1-211ENST00000555766 OSCARQ8IYS5 282 aa15.12■□□□□ 0.01
PAX8-AS1-211ENST00000555766 KIF27Q86VH2 1401 aa15.11■□□□□ 0.01
PAX8-AS1-211ENST00000555766 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
PAX8-AS1-211ENST00000555766 SYNJ2O15056 1496 aa15.06■□□□□ 0
PAX8-AS1-211ENST00000555766 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.05■□□□□ 0
PAX8-AS1-211ENST00000555766 ADAMTS12P58397 1594 aa15.05■□□□□ 0
PAX8-AS1-211ENST00000555766 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.04■□□□□ -0
PAX8-AS1-211ENST00000555766 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.02□□□□□ -0.01
PAX8-AS1-211ENST00000555766 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PAX8-AS1-211ENST00000555766 IGF1RP08069 1367 aa15□□□□□ -0.01
PAX8-AS1-211ENST00000555766 GRIN2AQ12879 1464 aa14.99□□□□□ -0.01
PAX8-AS1-211ENST00000555766 CUL7Q14999 1698 aa14.96□□□□□ -0.01
PAX8-AS1-211ENST00000555766 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.96□□□□□ -0.02
PAX8-AS1-211ENST00000555766 EEA1Q15075 1411 aa14.93□□□□□ -0.02
PAX8-AS1-211ENST00000555766 CEP170Q5SW79 1584 aa14.93□□□□□ -0.02
PAX8-AS1-211ENST00000555766 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.89□□□□□ -0.03
PAX8-AS1-211ENST00000555766 EHMT2Q96KQ7 1210 aa14.89□□□□□ -0.03
PAX8-AS1-211ENST00000555766 NUP160Q12769 1436 aa14.88□□□□□ -0.03
PAX8-AS1-211ENST00000555766 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.88□□□□□ -0.03
PAX8-AS1-211ENST00000555766 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.87□□□□□ -0.03
PAX8-AS1-211ENST00000555766 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.87□□□□□ -0.03
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