RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-224ENST00000551155 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.99■□□□□ 0.79
CS-224ENST00000551155 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
CS-224ENST00000551155 ABCC9O60706 1549 aa19.4■□□□□ 0.7
CS-224ENST00000551155 NACADO15069 1562 aa18.76■□□□□ 0.59
CS-224ENST00000551155 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.76■□□□□ 0.59
CS-224ENST00000551155 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.75■□□□□ 0.59
CS-224ENST00000551155 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
CS-224ENST00000551155 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.68■□□□□ 0.58
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CS-224ENST00000551155 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.62■□□□□ 0.57
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CS-224ENST00000551155 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.49
CS-224ENST00000551155 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.01■□□□□ 0.47
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CS-224ENST00000551155 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
CS-224ENST00000551155 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.58■□□□□ 0.4
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CS-224ENST00000551155 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
CS-224ENST00000551155 SMARCA4P51532 1647 aa17.43■□□□□ 0.38
CS-224ENST00000551155 POTEDQ86YR6 584 aa17.37■□□□□ 0.37
CS-224ENST00000551155 SMARCA2P51531 1590 aa17.32■□□□□ 0.36
CS-224ENST00000551155 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.29■□□□□ 0.36
CS-224ENST00000551155 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.29■□□□□ 0.36
CS-224ENST00000551155 NCAPD3P42695 1498 aa17.28■□□□□ 0.36
CS-224ENST00000551155 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.26■□□□□ 0.35
CS-224ENST00000551155 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
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CS-224ENST00000551155 WIZO95785 1651 aa17.13■□□□□ 0.33
CS-224ENST00000551155 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
CS-224ENST00000551155 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CS-224ENST00000551155 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.85■□□□□ 0.29
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CS-224ENST00000551155 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
CS-224ENST00000551155 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.77■□□□□ 0.28
CS-224ENST00000551155 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
CS-224ENST00000551155 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.75■□□□□ 0.27
CS-224ENST00000551155 ERCC6Q03468 1493 aa16.75■□□□□ 0.27
CS-224ENST00000551155 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-224ENST00000551155 CFTRP13569 1480 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-224ENST00000551155 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.65■□□□□ 0.26
CS-224ENST00000551155 PRDM2Q13029 1718 aa16.65■□□□□ 0.26
CS-224ENST00000551155 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.59■□□□□ 0.25
CS-224ENST00000551155 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.57■□□□□ 0.24
CS-224ENST00000551155 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CS-224ENST00000551155 CUX2O14529 1486 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-224ENST00000551155 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.51■□□□□ 0.23
CS-224ENST00000551155 WDR62O43379 1518 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-224ENST00000551155 ABCC8Q09428 1581 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-224ENST00000551155 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CS-224ENST00000551155 TOPBP1Q92547 1522 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-224ENST00000551155 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-224ENST00000551155 CUX1P39880 1505 aa16.22■□□□□ 0.19
CS-224ENST00000551155 IFT140Q96RY7 1462 aa16.22■□□□□ 0.19
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CS-224ENST00000551155 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.17■□□□□ 0.18
CS-224ENST00000551155 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.16■□□□□ 0.18
CS-224ENST00000551155 SOGA1O94964 1423 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-224ENST00000551155 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CS-224ENST00000551155 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-224ENST00000551155 TOP2BQ02880 1626 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-224ENST00000551155 FOXD1Q16676 465 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-224ENST00000551155 SYNJ1O43426 1573 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-224ENST00000551155 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-224ENST00000551155 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CS-224ENST00000551155 WDR97A6NE52 1622 aa16.08■□□□□ 0.17
CS-224ENST00000551155 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CS-224ENST00000551155 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.02■□□□□ 0.15
CS-224ENST00000551155 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.152e-12■■■■□ 26.6
CS-224ENST00000551155 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CS-224ENST00000551155 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.96■□□□□ 0.14
CS-224ENST00000551155 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.95■□□□□ 0.14
CS-224ENST00000551155 GRIN2BQ13224 1484 aa15.95■□□□□ 0.14
CS-224ENST00000551155 PBRM1Q86U86 1689 aa15.95■□□□□ 0.14
CS-224ENST00000551155 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.91■□□□□ 0.14
CS-224ENST00000551155 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CS-224ENST00000551155 OSCARQ8IYS5 282 aa15.89■□□□□ 0.13
CS-224ENST00000551155 TRIM41Q8WV44 630 aa15.88■□□□□ 0.13
CS-224ENST00000551155 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.88■□□□□ 0.13
CS-224ENST00000551155 CHD1O14646 1710 aa15.87■□□□□ 0.13
CS-224ENST00000551155 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-224ENST00000551155 FBLN2P98095 1184 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-224ENST00000551155 KIF27Q86VH2 1401 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-224ENST00000551155 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
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CS-224ENST00000551155 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-224ENST00000551155 ADAMTS12P58397 1594 aa15.78■□□□□ 0.12
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CS-224ENST00000551155 IGF1RP08069 1367 aa15.74■□□□□ 0.11
CS-224ENST00000551155 GRIN2AQ12879 1464 aa15.73■□□□□ 0.11
CS-224ENST00000551155 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.67■□□□□ 0.1
CS-224ENST00000551155 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.67■□□□□ 0.1
CS-224ENST00000551155 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-224ENST00000551155 MSH5O43196 834 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-224ENST00000551155 NUP160Q12769 1436 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-224ENST00000551155 CEP170Q5SW79 1584 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-224ENST00000551155 EEA1Q15075 1411 aa15.63■□□□□ 0.09
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