RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537237.5

MVK-205, Transcript of mevalonate kinase, humanhuman

TSL 5

Gene MVK, Length 1,296 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVK-205ENST00000537237 NISCHQ9Y2I1 1504 aa69.85■■■■■ 8.77
MVK-205ENST00000537237 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa62■■■■■ 7.52
MVK-205ENST00000537237 ABCC9O60706 1549 aa60.6■■■■■ 7.29
MVK-205ENST00000537237 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.32■■■■■ 6.93
MVK-205ENST00000537237 NACADO15069 1562 aa58.3■■■■■ 6.92
MVK-205ENST00000537237 DCAF8L2P0C7V8 631 aa58.28■■■■■ 6.92
MVK-205ENST00000537237 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP58.2■■■■■ 6.91
MVK-205ENST00000537237 MYO15BQ96JP2 1530 aa58.02■■■■■ 6.88
MVK-205ENST00000537237 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa57.81■■■■■ 6.85
MVK-205ENST00000537237 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.96■■■■■ 6.71
MVK-205ENST00000537237 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.68■■■■■ 6.66
MVK-205ENST00000537237 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.6■■■■■ 6.65
MVK-205ENST00000537237 SCRIBQ14160 1630 aa56.58■■■■■ 6.65
MVK-205ENST00000537237 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.99■■■■■ 6.55
MVK-205ENST00000537237 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.61■■■■■ 6.49
MVK-205ENST00000537237 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP55.07■■■■■ 6.41
MVK-205ENST00000537237 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.81■■■■■ 6.37
MVK-205ENST00000537237 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.44■■■■■ 6.31
MVK-205ENST00000537237 SMARCA4P51532 1647 aa54.15■■■■■ 6.26
MVK-205ENST00000537237 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP54.11■■■■■ 6.25
MVK-205ENST00000537237 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.87■■■■■ 6.21
MVK-205ENST00000537237 NCAPD3P42695 1498 aa53.84■■■■■ 6.21
MVK-205ENST00000537237 MROH2BQ7Z745 1585 aa53.84■■■■■ 6.21
MVK-205ENST00000537237 SMARCA2P51531 1590 aa53.77■■■■■ 6.2
MVK-205ENST00000537237 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.65■■■■■ 6.18
MVK-205ENST00000537237 HMGXB3Q12766 1538 aa53.54■■■■■ 6.16
MVK-205ENST00000537237 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53.39■■■■■ 6.14
MVK-205ENST00000537237 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP53.27■■■■■ 6.12
MVK-205ENST00000537237 WIZO95785 1651 aa53.23■■■■■ 6.11
MVK-205ENST00000537237 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP52.68■■■■■ 6.02
MVK-205ENST00000537237 NESP48681 1621 aa52.48■■■■■ 5.99
MVK-205ENST00000537237 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.35■■■■■ 5.97
MVK-205ENST00000537237 CADPSQ9ULU8 1353 aa52.26■■■■■ 5.96
MVK-205ENST00000537237 ERCC6Q03468 1493 aa52.19■■■■■ 5.95
MVK-205ENST00000537237 CCDC88BA6NC98 1476 aa52.09■■■■■ 5.93
MVK-205ENST00000537237 PDS5BQ9NTI5 1447 aa52.01■■■■■ 5.92
MVK-205ENST00000537237 CFTRP13569 1480 aa51.98■■■■■ 5.91
MVK-205ENST00000537237 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.96■■■■■ 5.91
MVK-205ENST00000537237 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.81■■■■■ 5.89
MVK-205ENST00000537237 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.65■■■■■ 5.86
MVK-205ENST00000537237 CUX2O14529 1486 aa51.64■■■■■ 5.86
MVK-205ENST00000537237 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.64■■■■■ 5.86
MVK-205ENST00000537237 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.55■■■■■ 5.84
MVK-205ENST00000537237 PRDM2Q13029 1718 aa51.48■■■■■ 5.83
MVK-205ENST00000537237 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.47■■■■■ 5.83
MVK-205ENST00000537237 WDR62O43379 1518 aa51.3■■■■■ 5.8
MVK-205ENST00000537237 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP51.13■■■■■ 5.78
MVK-205ENST00000537237 TOPBP1Q92547 1522 aa50.83■■■■■ 5.73
MVK-205ENST00000537237 ABCC8Q09428 1581 aa50.82■■■■■ 5.73
MVK-205ENST00000537237 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.76■■■■■ 5.72
MVK-205ENST00000537237 CUX1P39880 1505 aa50.49■■■■■ 5.67
MVK-205ENST00000537237 IFT140Q96RY7 1462 aa50.48■■■■■ 5.67
MVK-205ENST00000537237 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.41■■■■■ 5.66
MVK-205ENST00000537237 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.29■■■■■ 5.64
MVK-205ENST00000537237 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP50.27■■■■■ 5.64
MVK-205ENST00000537237 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.26■■■■■ 5.64
MVK-205ENST00000537237 SOGA1O94964 1423 aa50.21■■■■■ 5.63
MVK-205ENST00000537237 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP50.2■■■■■ 5.63
MVK-205ENST00000537237 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50.2■■■■■ 5.63
MVK-205ENST00000537237 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.16■■■■■ 5.62
MVK-205ENST00000537237 TOP2BQ02880 1626 aa50.07■■■■■ 5.61
MVK-205ENST00000537237 SYNJ1O43426 1573 aa50.06■■■■■ 5.6
MVK-205ENST00000537237 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.05■■■■■ 5.6
MVK-205ENST00000537237 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP50.02■■■■■ 5.6
MVK-205ENST00000537237 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.99■■■■■ 5.591e-6■■■■■ 28.6
MVK-205ENST00000537237 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.92■■■■■ 5.58
MVK-205ENST00000537237 WDR97A6NE52 1622 aa49.85■■■■■ 5.57
MVK-205ENST00000537237 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.83■■■■■ 5.57
MVK-205ENST00000537237 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.63■■■■■ 5.53
MVK-205ENST00000537237 GRIN2BQ13224 1484 aa49.6■■■■■ 5.53
MVK-205ENST00000537237 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49.6■■■■■ 5.53
MVK-205ENST00000537237 OSCARQ8IYS5 282 aa49.54■■■■■ 5.52
MVK-205ENST00000537237 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.51■■■■■ 5.52
MVK-205ENST00000537237 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.45■■■■■ 5.51
MVK-205ENST00000537237 PBRM1Q86U86 1689 aa49.45■■■■■ 5.51
MVK-205ENST00000537237 CHD1O14646 1710 aa49.34■■■■■ 5.49
MVK-205ENST00000537237 FBLN2P98095 1184 aa49.33■■■■■ 5.49
MVK-205ENST00000537237 SYNJ2O15056 1496 aa49.27■■■■■ 5.48
MVK-205ENST00000537237 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.24■■■■■ 5.47
MVK-205ENST00000537237 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49.22■■■■■ 5.47
MVK-205ENST00000537237 KIF27Q86VH2 1401 aa49.14■■■■■ 5.46
MVK-205ENST00000537237 ADAMTS12P58397 1594 aa49.11■■■■■ 5.45
MVK-205ENST00000537237 TRIM41Q8WV44 630 aa49.08■■■■■ 5.45
MVK-205ENST00000537237 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49.06■■■■■ 5.44
MVK-205ENST00000537237 IGF1RP08069 1367 aa48.98■■■■■ 5.43
MVK-205ENST00000537237 GRIN2AQ12879 1464 aa48.97■■■■■ 5.43
MVK-205ENST00000537237 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.88■■■■■ 5.41
MVK-205ENST00000537237 NUP160Q12769 1436 aa48.77■■■■■ 5.4
MVK-205ENST00000537237 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.76■■■■■ 5.4
MVK-205ENST00000537237 CUL7Q14999 1698 aa48.75■■■■■ 5.4
MVK-205ENST00000537237 ARHGEF11O15085 1522 aa48.72■■■■■ 5.39
MVK-205ENST00000537237 CEP170Q5SW79 1584 aa48.72■■■■■ 5.39
MVK-205ENST00000537237 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.69■■■■■ 5.39
MVK-205ENST00000537237 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.69■■■■■ 5.39
MVK-205ENST00000537237 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.69■■■■■ 5.39
MVK-205ENST00000537237 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa48.66■■■■■ 5.38
MVK-205ENST00000537237 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.59■■■■■ 5.37
MVK-205ENST00000537237 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa48.36■■■■■ 5.33
MVK-205ENST00000537237 SHROOM2Q13796 1616 aa48.36■■■■■ 5.33
MVK-205ENST00000537237 ARAP1Q96P48 1450 aa48.35■■■■■ 5.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms