RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535818.1

VPS37C-202, Transcript of VPS37C, ESCRT-I subunit, humanhuman

TSL 2

Gene VPS37C, Length 865 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37C-202ENST00000535818 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.84■■■■■ 6.21
VPS37C-202ENST00000535818 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.91■■■■■ 5.26
VPS37C-202ENST00000535818 ABCC9O60706 1549 aa46.9■■■■■ 5.1
VPS37C-202ENST00000535818 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.11■■■■■ 4.81
VPS37C-202ENST00000535818 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.08■■■■■ 4.81
VPS37C-202ENST00000535818 NACADO15069 1562 aa45.03■■■■■ 4.8
VPS37C-202ENST00000535818 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.86■■■■■ 4.77
VPS37C-202ENST00000535818 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.71■■■■■ 4.75
VPS37C-202ENST00000535818 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.53■■■■■ 4.72
VPS37C-202ENST00000535818 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.06■■■■■ 4.64
VPS37C-202ENST00000535818 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.8■■■■■ 4.6
VPS37C-202ENST00000535818 SCRIBQ14160 1630 aa43.75■■■■■ 4.59
VPS37C-202ENST00000535818 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.68■■■■■ 4.58
VPS37C-202ENST00000535818 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.25■■■■■ 4.51
VPS37C-202ENST00000535818 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.95■■■■■ 4.47
VPS37C-202ENST00000535818 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.57■■■■■ 4.41
VPS37C-202ENST00000535818 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.41■■■■■ 4.38
VPS37C-202ENST00000535818 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.13■■■■■ 4.34
VPS37C-202ENST00000535818 SMARCA4P51532 1647 aa41.81■■■■■ 4.28
VPS37C-202ENST00000535818 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
VPS37C-202ENST00000535818 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.56■■■■■ 4.24
VPS37C-202ENST00000535818 SMARCA2P51531 1590 aa41.54■■■■■ 4.24
VPS37C-202ENST00000535818 NCAPD3P42695 1498 aa41.51■■■■■ 4.24
VPS37C-202ENST00000535818 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.5■■■■■ 4.23
VPS37C-202ENST00000535818 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.36■■■■■ 4.21
VPS37C-202ENST00000535818 HMGXB3Q12766 1538 aa41.34■■■■■ 4.21
VPS37C-202ENST00000535818 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
VPS37C-202ENST00000535818 WIZO95785 1651 aa41.08■■■■■ 4.17
VPS37C-202ENST00000535818 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.15
VPS37C-202ENST00000535818 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
VPS37C-202ENST00000535818 NESP48681 1621 aa40.56■■■■■ 4.08
VPS37C-202ENST00000535818 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.47■■■■■ 4.07
VPS37C-202ENST00000535818 ERCC6Q03468 1493 aa40.46■■■■■ 4.07
VPS37C-202ENST00000535818 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.33■■■■■ 4.05
VPS37C-202ENST00000535818 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.2■■■■■ 4.03
VPS37C-202ENST00000535818 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.14■■■■■ 4.02
VPS37C-202ENST00000535818 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.11■■■■■ 4.01
VPS37C-202ENST00000535818 CFTRP13569 1480 aa40.07■■■■■ 4.01
VPS37C-202ENST00000535818 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
VPS37C-202ENST00000535818 CUX2O14529 1486 aa39.98■■■■□ 3.99
VPS37C-202ENST00000535818 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
VPS37C-202ENST00000535818 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.89■■■■□ 3.98
VPS37C-202ENST00000535818 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.87■■■■□ 3.97
VPS37C-202ENST00000535818 PRDM2Q13029 1718 aa39.83■■■■□ 3.97
VPS37C-202ENST00000535818 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.8■■■■□ 3.96
VPS37C-202ENST00000535818 WDR62O43379 1518 aa39.64■■■■□ 3.94
VPS37C-202ENST00000535818 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
VPS37C-202ENST00000535818 ABCC8Q09428 1581 aa39.25■■■■□ 3.87
VPS37C-202ENST00000535818 TOPBP1Q92547 1522 aa39.24■■■■□ 3.87
VPS37C-202ENST00000535818 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.21■■■■□ 3.87
VPS37C-202ENST00000535818 IFT140Q96RY7 1462 aa39.01■■■■□ 3.84
VPS37C-202ENST00000535818 CUX1P39880 1505 aa38.94■■■■□ 3.82
VPS37C-202ENST00000535818 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.92■■■■□ 3.82
VPS37C-202ENST00000535818 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.84■■■■□ 3.81
VPS37C-202ENST00000535818 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.81■■■■□ 3.8
VPS37C-202ENST00000535818 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.8■■■■□ 3.8
VPS37C-202ENST00000535818 SOGA1O94964 1423 aa38.76■■■■□ 3.8
VPS37C-202ENST00000535818 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.75■■■■□ 3.79
VPS37C-202ENST00000535818 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.72■■■■□ 3.79
VPS37C-202ENST00000535818 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.71■■■■□ 3.79
VPS37C-202ENST00000535818 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.7■■■■□ 3.79
VPS37C-202ENST00000535818 TOP2BQ02880 1626 aa38.62■■■■□ 3.77
VPS37C-202ENST00000535818 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.62■■■■□ 3.77
VPS37C-202ENST00000535818 SYNJ1O43426 1573 aa38.61■■■■□ 3.77
VPS37C-202ENST00000535818 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.6■■■■□ 3.77
VPS37C-202ENST00000535818 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
VPS37C-202ENST00000535818 WDR97A6NE52 1622 aa38.52■■■■□ 3.76
VPS37C-202ENST00000535818 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.43■■■■□ 3.74
VPS37C-202ENST00000535818 OSCARQ8IYS5 282 aa38.32■■■■□ 3.72
VPS37C-202ENST00000535818 GRIN2BQ13224 1484 aa38.32■■■■□ 3.72
VPS37C-202ENST00000535818 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.32■■■■□ 3.72
VPS37C-202ENST00000535818 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.3■■■■□ 3.72
VPS37C-202ENST00000535818 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.28■■■■□ 3.72
VPS37C-202ENST00000535818 PBRM1Q86U86 1689 aa38.27■■■■□ 3.72
VPS37C-202ENST00000535818 CHD1O14646 1710 aa38.22■■■■□ 3.71
VPS37C-202ENST00000535818 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.22■■■■□ 3.71
VPS37C-202ENST00000535818 FBLN2P98095 1184 aa38.21■■■■□ 3.71
VPS37C-202ENST00000535818 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.07■■■■□ 3.68
VPS37C-202ENST00000535818 SYNJ2O15056 1496 aa38.06■■■■□ 3.68
VPS37C-202ENST00000535818 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.99■■■■□ 3.67
VPS37C-202ENST00000535818 ADAMTS12P58397 1594 aa37.95■■■■□ 3.67
VPS37C-202ENST00000535818 KIF27Q86VH2 1401 aa37.91■■■■□ 3.66
VPS37C-202ENST00000535818 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.87■■■■□ 3.65
VPS37C-202ENST00000535818 GRIN2AQ12879 1464 aa37.83■■■■□ 3.65
VPS37C-202ENST00000535818 TRIM41Q8WV44 630 aa37.82■■■■□ 3.64
VPS37C-202ENST00000535818 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.77■■■■□ 3.64
VPS37C-202ENST00000535818 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.73■■■■□ 3.63
VPS37C-202ENST00000535818 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.73■■■■□ 3.63
VPS37C-202ENST00000535818 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.73■■■■□ 3.63
VPS37C-202ENST00000535818 ARHGEF11O15085 1522 aa37.71■■■■□ 3.63
VPS37C-202ENST00000535818 IGF1RP08069 1367 aa37.69■■■■□ 3.62
VPS37C-202ENST00000535818 CUL7Q14999 1698 aa37.68■■■■□ 3.62
VPS37C-202ENST00000535818 CEP170Q5SW79 1584 aa37.63■■■■□ 3.61
VPS37C-202ENST00000535818 NUP160Q12769 1436 aa37.62■■■■□ 3.61
VPS37C-202ENST00000535818 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.53■■■■□ 3.6
VPS37C-202ENST00000535818 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.53■■■■□ 3.6
VPS37C-202ENST00000535818 ARAP1Q96P48 1450 aa37.4■■■■□ 3.58
VPS37C-202ENST00000535818 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.37■■■■□ 3.57
VPS37C-202ENST00000535818 SHROOM2Q13796 1616 aa37.35■■■■□ 3.57
VPS37C-202ENST00000535818 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.31■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms