RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, humanhuman

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1-222ENST00000533557 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.33■■■□□ 2.61
BBS1-222ENST00000533557 ABCC9O60706 1549 aa28.89■■■□□ 2.21
BBS1-222ENST00000533557 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.17■■■□□ 2.1
BBS1-222ENST00000533557 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.76■■■□□ 2.03
BBS1-222ENST00000533557 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.1■■□□□ 1.93
BBS1-222ENST00000533557 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
BBS1-222ENST00000533557 NACADO15069 1562 aa26.81■■□□□ 1.88
BBS1-222ENST00000533557 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.74■■□□□ 1.87
BBS1-222ENST00000533557 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.53■■□□□ 1.84
BBS1-222ENST00000533557 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.5■■□□□ 1.83
BBS1-222ENST00000533557 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.27■■□□□ 1.8
BBS1-222ENST00000533557 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.03■■□□□ 1.76
BBS1-222ENST00000533557 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26■■□□□ 1.75
BBS1-222ENST00000533557 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.86■■□□□ 1.73
BBS1-222ENST00000533557 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
BBS1-222ENST00000533557 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
BBS1-222ENST00000533557 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.76■■□□□ 1.71
BBS1-222ENST00000533557 SCRIBQ14160 1630 aa25.76■■□□□ 1.71
BBS1-222ENST00000533557 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.72■■□□□ 1.71
BBS1-222ENST00000533557 CUX2O14529 1486 aa24.97■■□□□ 1.59
BBS1-222ENST00000533557 NCAPD3P42695 1498 aa24.86■■□□□ 1.57
BBS1-222ENST00000533557 ERCC6Q03468 1493 aa24.85■■□□□ 1.57
BBS1-222ENST00000533557 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.72■■□□□ 1.55
BBS1-222ENST00000533557 NESP48681 1621 aa24.72■■□□□ 1.55
BBS1-222ENST00000533557 HMGXB3Q12766 1538 aa24.53■■□□□ 1.52
BBS1-222ENST00000533557 SMARCA2P51531 1590 aa24.5■■□□□ 1.51
BBS1-222ENST00000533557 SMARCA4P51532 1647 aa24.5■■□□□ 1.51
BBS1-222ENST00000533557 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
BBS1-222ENST00000533557 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
BBS1-222ENST00000533557 TRIM41Q8WV44 630 aa24.36■■□□□ 1.49
BBS1-222ENST00000533557 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.27■■□□□ 1.48
BBS1-222ENST00000533557 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
BBS1-222ENST00000533557 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.25■■□□□ 1.47
BBS1-222ENST00000533557 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.23■■□□□ 1.47
BBS1-222ENST00000533557 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.2■■□□□ 1.46
BBS1-222ENST00000533557 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.18■■□□□ 1.46
BBS1-222ENST00000533557 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.08■■□□□ 1.45
BBS1-222ENST00000533557 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.02■■□□□ 1.44
BBS1-222ENST00000533557 WDR62O43379 1518 aa23.98■■□□□ 1.43
BBS1-222ENST00000533557 OSCARQ8IYS5 282 aa23.84■■□□□ 1.41
BBS1-222ENST00000533557 WIZO95785 1651 aa23.83■■□□□ 1.41
BBS1-222ENST00000533557 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.81■■□□□ 1.4
BBS1-222ENST00000533557 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.79■■□□□ 1.4
BBS1-222ENST00000533557 CFTRP13569 1480 aa23.69■■□□□ 1.38
BBS1-222ENST00000533557 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
BBS1-222ENST00000533557 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.55■■□□□ 1.36
BBS1-222ENST00000533557 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.55■■□□□ 1.36
BBS1-222ENST00000533557 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.55■■□□□ 1.36
BBS1-222ENST00000533557 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
BBS1-222ENST00000533557 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
BBS1-222ENST00000533557 ARHGEF11O15085 1522 aa23.44■■□□□ 1.34
BBS1-222ENST00000533557 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
BBS1-222ENST00000533557 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.38■■□□□ 1.33
BBS1-222ENST00000533557 IFT140Q96RY7 1462 aa23.36■■□□□ 1.33
BBS1-222ENST00000533557 TOPBP1Q92547 1522 aa23.28■■□□□ 1.32
BBS1-222ENST00000533557 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.27■■□□□ 1.32
BBS1-222ENST00000533557 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
BBS1-222ENST00000533557 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.313e-6■■■■□ 24.7
BBS1-222ENST00000533557 ARAP1Q96P48 1450 aa23.22■■□□□ 1.31
BBS1-222ENST00000533557 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
BBS1-222ENST00000533557 PRDM2Q13029 1718 aa23.21■■□□□ 1.31
BBS1-222ENST00000533557 FBLN2P98095 1184 aa23.13■■□□□ 1.29
BBS1-222ENST00000533557 CHD1O14646 1710 aa23.12■■□□□ 1.29
BBS1-222ENST00000533557 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
BBS1-222ENST00000533557 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.09■■□□□ 1.29
BBS1-222ENST00000533557 ABCC8Q09428 1581 aa23.08■■□□□ 1.29
BBS1-222ENST00000533557 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
BBS1-222ENST00000533557 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.02■■□□□ 1.28
BBS1-222ENST00000533557 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
BBS1-222ENST00000533557 SOGA1O94964 1423 aa22.92■■□□□ 1.26
BBS1-222ENST00000533557 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.9■■□□□ 1.26
BBS1-222ENST00000533557 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.89■■□□□ 1.25
BBS1-222ENST00000533557 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
BBS1-222ENST00000533557 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
BBS1-222ENST00000533557 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.8■■□□□ 1.24
BBS1-222ENST00000533557 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
BBS1-222ENST00000533557 SYNJ1O43426 1573 aa22.74■■□□□ 1.23
BBS1-222ENST00000533557 CUX1P39880 1505 aa22.73■■□□□ 1.23
BBS1-222ENST00000533557 GRIN2BQ13224 1484 aa22.73■■□□□ 1.23
BBS1-222ENST00000533557 SYNJ2O15056 1496 aa22.71■■□□□ 1.23
BBS1-222ENST00000533557 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.7■■□□□ 1.22
BBS1-222ENST00000533557 WDR97A6NE52 1622 aa22.68■■□□□ 1.22
BBS1-222ENST00000533557 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.62■■□□□ 1.21
BBS1-222ENST00000533557 PBRM1Q86U86 1689 aa22.52■■□□□ 1.2
BBS1-222ENST00000533557 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.49■■□□□ 1.19
BBS1-222ENST00000533557 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.48■■□□□ 1.19
BBS1-222ENST00000533557 GRIN2AQ12879 1464 aa22.45■■□□□ 1.18
BBS1-222ENST00000533557 CEP170Q5SW79 1584 aa22.43■■□□□ 1.18
BBS1-222ENST00000533557 NUP160Q12769 1436 aa22.42■■□□□ 1.18
BBS1-222ENST00000533557 ADAMTS12P58397 1594 aa22.33■■□□□ 1.17
BBS1-222ENST00000533557 SHROOM2Q13796 1616 aa22.33■■□□□ 1.17
BBS1-222ENST00000533557 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.31■■□□□ 1.16
BBS1-222ENST00000533557 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.28■■□□□ 1.16
BBS1-222ENST00000533557 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
BBS1-222ENST00000533557 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
BBS1-222ENST00000533557 JPH4Q96JJ6 628 aa22.24■■□□□ 1.15
BBS1-222ENST00000533557 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.23■■□□□ 1.15
BBS1-222ENST00000533557 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.2■■□□□ 1.14
BBS1-222ENST00000533557 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.17■■□□□ 1.14
BBS1-222ENST00000533557 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.15■■□□□ 1.14
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