RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531285.1

TRNP1-202, Transcript of TMF1-regulated nuclear protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene TRNP1, Length 575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1-202ENST00000531285 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.06■■■■■ 6.24
TRNP1-202ENST00000531285 ABCC9O60706 1549 aa48.97■■■■■ 5.43
TRNP1-202ENST00000531285 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.69■■■■■ 5.39
TRNP1-202ENST00000531285 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.47■■■■■ 5.03
TRNP1-202ENST00000531285 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.16■■■■■ 4.98
TRNP1-202ENST00000531285 NACADO15069 1562 aa46.05■■■■■ 4.96
TRNP1-202ENST00000531285 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.76■■■■■ 4.92
TRNP1-202ENST00000531285 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.52■■■■■ 4.88
TRNP1-202ENST00000531285 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.51■■■■■ 4.88
TRNP1-202ENST00000531285 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.27■■■■■ 4.84
TRNP1-202ENST00000531285 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.15■■■■■ 4.82
TRNP1-202ENST00000531285 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.75■■■■■ 4.75
TRNP1-202ENST00000531285 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.6■■■■■ 4.73
TRNP1-202ENST00000531285 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.43■■■■■ 4.7
TRNP1-202ENST00000531285 SCRIBQ14160 1630 aa44.37■■■■■ 4.69
TRNP1-202ENST00000531285 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.24■■■■■ 4.67
TRNP1-202ENST00000531285 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.12■■■■■ 4.65
TRNP1-202ENST00000531285 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
TRNP1-202ENST00000531285 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.57■■■■■ 4.41
TRNP1-202ENST00000531285 NCAPD3P42695 1498 aa42.49■■■■■ 4.39
TRNP1-202ENST00000531285 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.35■■■■■ 4.37
TRNP1-202ENST00000531285 ERCC6Q03468 1493 aa42.3■■■■■ 4.36
TRNP1-202ENST00000531285 CUX2O14529 1486 aa42.29■■■■■ 4.36
TRNP1-202ENST00000531285 SMARCA4P51532 1647 aa42.28■■■■■ 4.36
TRNP1-202ENST00000531285 SMARCA2P51531 1590 aa42.22■■■■■ 4.35
TRNP1-202ENST00000531285 HMGXB3Q12766 1538 aa42.19■■■■■ 4.34
TRNP1-202ENST00000531285 NESP48681 1621 aa41.99■■■■■ 4.31
TRNP1-202ENST00000531285 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
TRNP1-202ENST00000531285 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
TRNP1-202ENST00000531285 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.83■■■■■ 4.29
TRNP1-202ENST00000531285 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.67■■■■■ 4.26
TRNP1-202ENST00000531285 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
TRNP1-202ENST00000531285 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.63■■■■■ 4.25
TRNP1-202ENST00000531285 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.5■■■■■ 4.23
TRNP1-202ENST00000531285 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.35■■■■■ 4.21
TRNP1-202ENST00000531285 WIZO95785 1651 aa41.2■■■■■ 4.19
TRNP1-202ENST00000531285 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.18■■■■■ 4.18
TRNP1-202ENST00000531285 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.06■■■■■ 4.16
TRNP1-202ENST00000531285 WDR62O43379 1518 aa40.98■■■■■ 4.15
TRNP1-202ENST00000531285 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.83■■■■■ 4.13
TRNP1-202ENST00000531285 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.76■■■■■ 4.12
TRNP1-202ENST00000531285 CFTRP13569 1480 aa40.67■■■■■ 4.1
TRNP1-202ENST00000531285 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
TRNP1-202ENST00000531285 TRIM41Q8WV44 630 aa40.65■■■■■ 4.1
TRNP1-202ENST00000531285 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
TRNP1-202ENST00000531285 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
TRNP1-202ENST00000531285 PRDM2Q13029 1718 aa40.36■■■■■ 4.05
TRNP1-202ENST00000531285 OSCARQ8IYS5 282 aa40.27■■■■■ 4.04
TRNP1-202ENST00000531285 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.14■■■■■ 4.02
TRNP1-202ENST00000531285 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.01■■■■□ 3.99
TRNP1-202ENST00000531285 IFT140Q96RY7 1462 aa40■■■■□ 3.99
TRNP1-202ENST00000531285 TOPBP1Q92547 1522 aa39.96■■■■□ 3.99
TRNP1-202ENST00000531285 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.88■■■■□ 3.97
TRNP1-202ENST00000531285 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.88■■■■□ 3.97
TRNP1-202ENST00000531285 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.88■■■■□ 3.97
TRNP1-202ENST00000531285 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
TRNP1-202ENST00000531285 ABCC8Q09428 1581 aa39.8■■■■□ 3.96
TRNP1-202ENST00000531285 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.8■■■■□ 3.96
TRNP1-202ENST00000531285 ARHGEF11O15085 1522 aa39.7■■■■□ 3.95
TRNP1-202ENST00000531285 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
TRNP1-202ENST00000531285 CHD1O14646 1710 aa39.61■■■■□ 3.93
TRNP1-202ENST00000531285 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.6■■■■□ 3.931e-7■■■□□ 16.7
TRNP1-202ENST00000531285 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
TRNP1-202ENST00000531285 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.41■■■■□ 3.9
TRNP1-202ENST00000531285 FBLN2P98095 1184 aa39.39■■■■□ 3.9
TRNP1-202ENST00000531285 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.38■■■■□ 3.89
TRNP1-202ENST00000531285 SOGA1O94964 1423 aa39.31■■■■□ 3.88
TRNP1-202ENST00000531285 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
TRNP1-202ENST00000531285 ARAP1Q96P48 1450 aa39.29■■■■□ 3.88
TRNP1-202ENST00000531285 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.25■■■■□ 3.87
TRNP1-202ENST00000531285 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.2■■■■□ 3.87
TRNP1-202ENST00000531285 WDR97A6NE52 1622 aa39.19■■■■□ 3.86
TRNP1-202ENST00000531285 CUX1P39880 1505 aa39.17■■■■□ 3.86
TRNP1-202ENST00000531285 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.08■■■■□ 3.85
TRNP1-202ENST00000531285 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
TRNP1-202ENST00000531285 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
TRNP1-202ENST00000531285 SYNJ1O43426 1573 aa39.03■■■■□ 3.84
TRNP1-202ENST00000531285 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.02■■■■□ 3.84
TRNP1-202ENST00000531285 GRIN2BQ13224 1484 aa39.02■■■■□ 3.84
TRNP1-202ENST00000531285 PBRM1Q86U86 1689 aa38.95■■■■□ 3.83
TRNP1-202ENST00000531285 SYNJ2O15056 1496 aa38.93■■■■□ 3.82
TRNP1-202ENST00000531285 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.85■■■■□ 3.81
TRNP1-202ENST00000531285 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.78■■■■□ 3.8
TRNP1-202ENST00000531285 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.76■■■■□ 3.8
TRNP1-202ENST00000531285 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
TRNP1-202ENST00000531285 GRIN2AQ12879 1464 aa38.54■■■■□ 3.76
TRNP1-202ENST00000531285 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.53■■■■□ 3.76
TRNP1-202ENST00000531285 ADAMTS12P58397 1594 aa38.51■■■■□ 3.76
TRNP1-202ENST00000531285 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.49■■■■□ 3.75
TRNP1-202ENST00000531285 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.48■■■■□ 3.75
TRNP1-202ENST00000531285 TOP2BQ02880 1626 aa38.47■■■■□ 3.75
TRNP1-202ENST00000531285 CEP170Q5SW79 1584 aa38.44■■■■□ 3.74
TRNP1-202ENST00000531285 NUP160Q12769 1436 aa38.4■■■■□ 3.74
TRNP1-202ENST00000531285 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.33■■■■□ 3.73
TRNP1-202ENST00000531285 SHROOM2Q13796 1616 aa38.31■■■■□ 3.72
TRNP1-202ENST00000531285 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.28■■■■□ 3.72
TRNP1-202ENST00000531285 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.13■■■■□ 3.69
TRNP1-202ENST00000531285 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.06■■■■□ 3.68
TRNP1-202ENST00000531285 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.01■■■■□ 3.67
TRNP1-202ENST00000531285 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.99■■■■□ 3.67
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