RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530750.5

TM7SF2-218, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 2, humanhuman

TSL 5

Gene TM7SF2, Length 365 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF2-218ENST00000530750 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.97■■■■■ 5.43
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TM7SF2-218ENST00000530750 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.31■■■■■ 4.2
TM7SF2-218ENST00000530750 NACADO15069 1562 aa41.16■■■■■ 4.18
TM7SF2-218ENST00000530750 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.94■■■■■ 4.14
TM7SF2-218ENST00000530750 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.77■■■■■ 4.12
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TM7SF2-218ENST00000530750 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.47■■■■■ 4.07
TM7SF2-218ENST00000530750 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.21■■■■■ 4.03
TM7SF2-218ENST00000530750 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.15■■■■■ 4.02
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TM7SF2-218ENST00000530750 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.61■■■■□ 3.93
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TM7SF2-218ENST00000530750 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.03■■■■□ 3.84
TM7SF2-218ENST00000530750 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.8■■■■□ 3.8
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TM7SF2-218ENST00000530750 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.96■■■■□ 3.67
TM7SF2-218ENST00000530750 SMARCA2P51531 1590 aa37.89■■■■□ 3.66
TM7SF2-218ENST00000530750 HMGXB3Q12766 1538 aa37.81■■■■□ 3.64
TM7SF2-218ENST00000530750 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.77■■■■□ 3.64
TM7SF2-218ENST00000530750 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.73■■■■□ 3.63
TM7SF2-218ENST00000530750 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
TM7SF2-218ENST00000530750 WIZO95785 1651 aa37.36■■■■□ 3.57
TM7SF2-218ENST00000530750 NESP48681 1621 aa37.27■■■■□ 3.56
TM7SF2-218ENST00000530750 ERCC6Q03468 1493 aa37.2■■■■□ 3.54
TM7SF2-218ENST00000530750 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
TM7SF2-218ENST00000530750 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.05■■■■□ 3.52
TM7SF2-218ENST00000530750 CUX2O14529 1486 aa36.94■■■■□ 3.5
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TM7SF2-218ENST00000530750 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.84■■■■□ 3.49
TM7SF2-218ENST00000530750 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
TM7SF2-218ENST00000530750 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.82■■■■□ 3.49
TM7SF2-218ENST00000530750 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.76■■■■□ 3.47
TM7SF2-218ENST00000530750 CFTRP13569 1480 aa36.56■■■■□ 3.44
TM7SF2-218ENST00000530750 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.49■■■■□ 3.43
TM7SF2-218ENST00000530750 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.45■■■■□ 3.43
TM7SF2-218ENST00000530750 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.45■■■■□ 3.43
TM7SF2-218ENST00000530750 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.45■■■■□ 3.43
TM7SF2-218ENST00000530750 WDR62O43379 1518 aa36.41■■■■□ 3.42
TM7SF2-218ENST00000530750 PRDM2Q13029 1718 aa36.32■■■■□ 3.4
TM7SF2-218ENST00000530750 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.18■■■■□ 3.38
TM7SF2-218ENST00000530750 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
TM7SF2-218ENST00000530750 TOPBP1Q92547 1522 aa35.85■■■■□ 3.33
TM7SF2-218ENST00000530750 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
TM7SF2-218ENST00000530750 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.78■■■■□ 3.32
TM7SF2-218ENST00000530750 ABCC8Q09428 1581 aa35.71■■■■□ 3.31
TM7SF2-218ENST00000530750 IFT140Q96RY7 1462 aa35.67■■■■□ 3.3
TM7SF2-218ENST00000530750 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
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TM7SF2-218ENST00000530750 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
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TM7SF2-218ENST00000530750 CUX1P39880 1505 aa35.47■■■■□ 3.27
TM7SF2-218ENST00000530750 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.39■■■■□ 3.26
TM7SF2-218ENST00000530750 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.37■■■■□ 3.25
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TM7SF2-218ENST00000530750 OSCARQ8IYS5 282 aa35.22■■■■□ 3.23
TM7SF2-218ENST00000530750 WDR97A6NE52 1622 aa35.17■■■■□ 3.22
TM7SF2-218ENST00000530750 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
TM7SF2-218ENST00000530750 CHD1O14646 1710 aa35.12■■■■□ 3.21
TM7SF2-218ENST00000530750 SYNJ1O43426 1573 aa35.06■■■■□ 3.2
TM7SF2-218ENST00000530750 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.05■■■■□ 3.2
TM7SF2-218ENST00000530750 TOP2BQ02880 1626 aa35.03■■■■□ 3.2
TM7SF2-218ENST00000530750 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.03■■■■□ 3.25e-6■■■■■ 29.2
TM7SF2-218ENST00000530750 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.03■■■■□ 3.2
TM7SF2-218ENST00000530750 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35■■■■□ 3.19
TM7SF2-218ENST00000530750 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.96■■■■□ 3.19
TM7SF2-218ENST00000530750 GRIN2BQ13224 1484 aa34.96■■■■□ 3.19
TM7SF2-218ENST00000530750 PBRM1Q86U86 1689 aa34.95■■■■□ 3.19
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TM7SF2-218ENST00000530750 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.88■■■■□ 3.17
TM7SF2-218ENST00000530750 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.88■■■■□ 3.17
TM7SF2-218ENST00000530750 TRIM41Q8WV44 630 aa34.87■■■■□ 3.17
TM7SF2-218ENST00000530750 ARHGEF11O15085 1522 aa34.82■■■■□ 3.16
TM7SF2-218ENST00000530750 SYNJ2O15056 1496 aa34.79■■■■□ 3.16
TM7SF2-218ENST00000530750 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.71■■■■□ 3.15
TM7SF2-218ENST00000530750 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
TM7SF2-218ENST00000530750 ADAMTS12P58397 1594 aa34.66■■■■□ 3.14
TM7SF2-218ENST00000530750 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.55■■■■□ 3.12
TM7SF2-218ENST00000530750 GRIN2AQ12879 1464 aa34.55■■■■□ 3.12
TM7SF2-218ENST00000530750 ARAP1Q96P48 1450 aa34.53■■■■□ 3.12
TM7SF2-218ENST00000530750 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.48■■■■□ 3.11
TM7SF2-218ENST00000530750 CEP170Q5SW79 1584 aa34.45■■■■□ 3.1
TM7SF2-218ENST00000530750 NUP160Q12769 1436 aa34.4■■■■□ 3.1
TM7SF2-218ENST00000530750 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.4■■■■□ 3.1
TM7SF2-218ENST00000530750 KIF27Q86VH2 1401 aa34.3■■■■□ 3.08
TM7SF2-218ENST00000530750 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.24■■■■□ 3.07
TM7SF2-218ENST00000530750 SHROOM2Q13796 1616 aa34.22■■■■□ 3.07
TM7SF2-218ENST00000530750 CUL7Q14999 1698 aa34.2■■■■□ 3.07
TM7SF2-218ENST00000530750 IGF1RP08069 1367 aa34.19■■■■□ 3.06
TM7SF2-218ENST00000530750 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.18■■■■□ 3.06
TM7SF2-218ENST00000530750 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
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