RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530474.5

TSTA3-212, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 823 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-212ENST00000530474 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.37■■■□□ 2.45
TSTA3-212ENST00000530474 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.75■■□□□ 1.87
TSTA3-212ENST00000530474 ABCC9O60706 1549 aa25.94■■□□□ 1.74
TSTA3-212ENST00000530474 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
TSTA3-212ENST00000530474 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.28■■□□□ 1.64
TSTA3-212ENST00000530474 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-212ENST00000530474 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.17■■□□□ 1.62
TSTA3-212ENST00000530474 NACADO15069 1562 aa25.1■■□□□ 1.61
TSTA3-212ENST00000530474 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.96■■□□□ 1.59
TSTA3-212ENST00000530474 SCRIBQ14160 1630 aa24.35■■□□□ 1.49
TSTA3-212ENST00000530474 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.34■■□□□ 1.49
TSTA3-212ENST00000530474 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.29■■□□□ 1.48
TSTA3-212ENST00000530474 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.476e-9■□□□□ 10.6
TSTA3-212ENST00000530474 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.16■■□□□ 1.46
TSTA3-212ENST00000530474 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.08■■□□□ 1.45
TSTA3-212ENST00000530474 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TSTA3-212ENST00000530474 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TSTA3-212ENST00000530474 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.48■■□□□ 1.35
TSTA3-212ENST00000530474 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.48■■□□□ 1.35
TSTA3-212ENST00000530474 SMARCA4P51532 1647 aa23.39■■□□□ 1.33
TSTA3-212ENST00000530474 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TSTA3-212ENST00000530474 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.32■■□□□ 1.32
TSTA3-212ENST00000530474 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
TSTA3-212ENST00000530474 SMARCA2P51531 1590 aa23.27■■□□□ 1.32
TSTA3-212ENST00000530474 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.2■■□□□ 1.3
TSTA3-212ENST00000530474 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.17■■□□□ 1.3
TSTA3-212ENST00000530474 NCAPD3P42695 1498 aa23.13■■□□□ 1.29
TSTA3-212ENST00000530474 WIZO95785 1651 aa23.08■■□□□ 1.29
TSTA3-212ENST00000530474 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
TSTA3-212ENST00000530474 HMGXB3Q12766 1538 aa23.03■■□□□ 1.28
TSTA3-212ENST00000530474 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TSTA3-212ENST00000530474 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.7■■□□□ 1.22
TSTA3-212ENST00000530474 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.51■■□□□ 1.19
TSTA3-212ENST00000530474 CFTRP13569 1480 aa22.45■■□□□ 1.18
TSTA3-212ENST00000530474 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-212ENST00000530474 NESP48681 1621 aa22.39■■□□□ 1.18
TSTA3-212ENST00000530474 ERCC6Q03468 1493 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-212ENST00000530474 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.35■■□□□ 1.17
TSTA3-212ENST00000530474 CUX2O14529 1486 aa22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-212ENST00000530474 PRDM2Q13029 1718 aa22.23■■□□□ 1.15
TSTA3-212ENST00000530474 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.19■■□□□ 1.14
TSTA3-212ENST00000530474 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.14■■□□□ 1.13
TSTA3-212ENST00000530474 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.13■■□□□ 1.13
TSTA3-212ENST00000530474 ABCC8Q09428 1581 aa22.12■■□□□ 1.13
TSTA3-212ENST00000530474 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-212ENST00000530474 TRIM41Q8WV44 630 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-212ENST00000530474 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-212ENST00000530474 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-212ENST00000530474 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-212ENST00000530474 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-212ENST00000530474 TOP2BQ02880 1626 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-212ENST00000530474 WDR62O43379 1518 aa21.89■■□□□ 1.09
TSTA3-212ENST00000530474 TOPBP1Q92547 1522 aa21.87■■□□□ 1.09
TSTA3-212ENST00000530474 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.87■■□□□ 1.09
TSTA3-212ENST00000530474 CUX1P39880 1505 aa21.85■■□□□ 1.09
TSTA3-212ENST00000530474 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.84■■□□□ 1.09
TSTA3-212ENST00000530474 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
TSTA3-212ENST00000530474 SYNJ1O43426 1573 aa21.81■■□□□ 1.08
TSTA3-212ENST00000530474 SOGA1O94964 1423 aa21.74■■□□□ 1.07
TSTA3-212ENST00000530474 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.74■■□□□ 1.07
TSTA3-212ENST00000530474 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-212ENST00000530474 EEA1Q15075 1411 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-212ENST00000530474 IFT140Q96RY7 1462 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-212ENST00000530474 KIF27Q86VH2 1401 aa21.64■■□□□ 1.06
TSTA3-212ENST00000530474 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.62■■□□□ 1.05
TSTA3-212ENST00000530474 WDR97A6NE52 1622 aa21.58■■□□□ 1.04
TSTA3-212ENST00000530474 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.57■■□□□ 1.04
TSTA3-212ENST00000530474 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.53■■□□□ 1.04
TSTA3-212ENST00000530474 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TSTA3-212ENST00000530474 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.47■■□□□ 1.03
TSTA3-212ENST00000530474 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TSTA3-212ENST00000530474 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TSTA3-212ENST00000530474 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-212ENST00000530474 GRIN2BQ13224 1484 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-212ENST00000530474 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-212ENST00000530474 IGF1RP08069 1367 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-212ENST00000530474 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.014e-8■■■■■ 34.1
TSTA3-212ENST00000530474 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.38■■□□□ 1.01
TSTA3-212ENST00000530474 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.35■■□□□ 1.01
TSTA3-212ENST00000530474 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.34■■□□□ 1.01
TSTA3-212ENST00000530474 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
TSTA3-212ENST00000530474 CUL7Q14999 1698 aa21.31■■□□□ 1
TSTA3-212ENST00000530474 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
TSTA3-212ENST00000530474 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.29■■□□□ 1
TSTA3-212ENST00000530474 OSCARQ8IYS5 282 aa21.28■■□□□ 1
TSTA3-212ENST00000530474 PRXQ9BXM0 1461 aa21.26■□□□□ 0.99
TSTA3-212ENST00000530474 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.26■□□□□ 0.99
TSTA3-212ENST00000530474 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
TSTA3-212ENST00000530474 PBRM1Q86U86 1689 aa21.24■□□□□ 0.99
TSTA3-212ENST00000530474 KIF21BO75037 1637 aa21.24■□□□□ 0.99
TSTA3-212ENST00000530474 GOLGA3Q08378 1498 aa21.24■□□□□ 0.99
TSTA3-212ENST00000530474 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
TSTA3-212ENST00000530474 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.2■□□□□ 0.98
TSTA3-212ENST00000530474 SYNJ2O15056 1496 aa21.19■□□□□ 0.98
TSTA3-212ENST00000530474 FBLN2P98095 1184 aa21.16■□□□□ 0.98
TSTA3-212ENST00000530474 ADAMTS12P58397 1594 aa21.14■□□□□ 0.98
TSTA3-212ENST00000530474 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.1■□□□□ 0.97
TSTA3-212ENST00000530474 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.1■□□□□ 0.97
TSTA3-212ENST00000530474 CHD1O14646 1710 aa21.09■□□□□ 0.97
TSTA3-212ENST00000530474 GRIN2AQ12879 1464 aa21.07■□□□□ 0.96
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