RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530281.5

AKIP1-209, Transcript of A-kinase interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene AKIP1, Length 469 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1-209ENST00000530281 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.94■■■■■ 4.63
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AKIP1-209ENST00000530281 SMARCA2P51531 1590 aa34.02■■■■□ 3.04
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AKIP1-209ENST00000530281 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.64■■■□□ 2.82
AKIP1-209ENST00000530281 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.64■■■□□ 2.82
AKIP1-209ENST00000530281 PRDM2Q13029 1718 aa32.57■■■□□ 2.8
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AKIP1-209ENST00000530281 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.5■■■□□ 2.63
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AKIP1-209ENST00000530281 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.47■■■□□ 2.63
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AKIP1-209ENST00000530281 GRIN2BQ13224 1484 aa31.35■■■□□ 2.61
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AKIP1-209ENST00000530281 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.31■■■□□ 2.6
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AKIP1-209ENST00000530281 ARHGEF11O15085 1522 aa31.03■■■□□ 2.56
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AKIP1-209ENST00000530281 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.68■■■□□ 2.5
AKIP1-209ENST00000530281 SHROOM2Q13796 1616 aa30.62■■■□□ 2.49
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AKIP1-209ENST00000530281 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.47■■■□□ 2.47
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