RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529490.5

MVB12A-210, Transcript of multivesicular body subunit 12A, humanhuman

TSL 4

Gene MVB12A, Length 480 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12A-210ENST00000529490 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.87■■■■□ 3.65
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MVB12A-210ENST00000529490 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.95■■■□□ 2.71
MVB12A-210ENST00000529490 NACADO15069 1562 aa31.85■■■□□ 2.69
MVB12A-210ENST00000529490 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.59■■■□□ 2.65
MVB12A-210ENST00000529490 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.53■■■□□ 2.64
MVB12A-210ENST00000529490 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
MVB12A-210ENST00000529490 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.35■■■□□ 2.61
MVB12A-210ENST00000529490 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.33■■■□□ 2.61
MVB12A-210ENST00000529490 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.15■■■□□ 2.58
MVB12A-210ENST00000529490 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.12■■■□□ 2.57
MVB12A-210ENST00000529490 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.08■■■□□ 2.57
MVB12A-210ENST00000529490 SCRIBQ14160 1630 aa30.82■■■□□ 2.52
MVB12A-210ENST00000529490 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.68■■■□□ 2.5
MVB12A-210ENST00000529490 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
MVB12A-210ENST00000529490 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.24■■■□□ 2.43
MVB12A-210ENST00000529490 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.05■■■□□ 2.4
MVB12A-210ENST00000529490 SMARCA4P51532 1647 aa29.47■■■□□ 2.31
MVB12A-210ENST00000529490 NCAPD3P42695 1498 aa29.42■■■□□ 2.3
MVB12A-210ENST00000529490 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.39■■■□□ 2.3
MVB12A-210ENST00000529490 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
MVB12A-210ENST00000529490 SMARCA2P51531 1590 aa29.28■■■□□ 2.28
MVB12A-210ENST00000529490 HMGXB3Q12766 1538 aa29.25■■■□□ 2.27
MVB12A-210ENST00000529490 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.22■■■□□ 2.27
MVB12A-210ENST00000529490 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.22■■■□□ 2.27
MVB12A-210ENST00000529490 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
MVB12A-210ENST00000529490 NESP48681 1621 aa28.87■■■□□ 2.21
MVB12A-210ENST00000529490 WIZO95785 1651 aa28.86■■■□□ 2.21
MVB12A-210ENST00000529490 ERCC6Q03468 1493 aa28.73■■■□□ 2.19
MVB12A-210ENST00000529490 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
MVB12A-210ENST00000529490 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.67■■■□□ 2.18
MVB12A-210ENST00000529490 CUX2O14529 1486 aa28.65■■■□□ 2.18
MVB12A-210ENST00000529490 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.62■■■□□ 2.17
MVB12A-210ENST00000529490 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
MVB12A-210ENST00000529490 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
MVB12A-210ENST00000529490 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.5■■■□□ 2.15
MVB12A-210ENST00000529490 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.5■■■□□ 2.15
MVB12A-210ENST00000529490 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.42■■■□□ 2.14
MVB12A-210ENST00000529490 CFTRP13569 1480 aa28.31■■■□□ 2.12
MVB12A-210ENST00000529490 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.23■■■□□ 2.11
MVB12A-210ENST00000529490 WDR62O43379 1518 aa28.21■■■□□ 2.11
MVB12A-210ENST00000529490 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.19■■■□□ 2.1
MVB12A-210ENST00000529490 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.17■■■□□ 2.1
MVB12A-210ENST00000529490 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.16■■■□□ 2.1
MVB12A-210ENST00000529490 PRDM2Q13029 1718 aa28.05■■■□□ 2.08
MVB12A-210ENST00000529490 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
MVB12A-210ENST00000529490 TOPBP1Q92547 1522 aa27.73■■■□□ 2.03
MVB12A-210ENST00000529490 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.65■■■□□ 2.02
MVB12A-210ENST00000529490 IFT140Q96RY7 1462 aa27.6■■■□□ 2.01
MVB12A-210ENST00000529490 ABCC8Q09428 1581 aa27.6■■■□□ 2.01
MVB12A-210ENST00000529490 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
MVB12A-210ENST00000529490 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
MVB12A-210ENST00000529490 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
MVB12A-210ENST00000529490 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
MVB12A-210ENST00000529490 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
MVB12A-210ENST00000529490 CUX1P39880 1505 aa27.42■■□□□ 1.98
MVB12A-210ENST00000529490 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.35■■□□□ 1.97
MVB12A-210ENST00000529490 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.34■■□□□ 1.97
MVB12A-210ENST00000529490 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.96
MVB12A-210ENST00000529490 SOGA1O94964 1423 aa27.27■■□□□ 1.96
MVB12A-210ENST00000529490 OSCARQ8IYS5 282 aa27.27■■□□□ 1.96
MVB12A-210ENST00000529490 WDR97A6NE52 1622 aa27.22■■□□□ 1.95
MVB12A-210ENST00000529490 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
MVB12A-210ENST00000529490 CHD1O14646 1710 aa27.16■■□□□ 1.94
MVB12A-210ENST00000529490 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.08■■□□□ 1.93
MVB12A-210ENST00000529490 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.08■■□□□ 1.93
MVB12A-210ENST00000529490 SYNJ1O43426 1573 aa27.07■■□□□ 1.92
MVB12A-210ENST00000529490 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.06■■□□□ 1.92
MVB12A-210ENST00000529490 TOP2BQ02880 1626 aa27.05■■□□□ 1.92
MVB12A-210ENST00000529490 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.04■■□□□ 1.92
MVB12A-210ENST00000529490 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.04■■□□□ 1.92
MVB12A-210ENST00000529490 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.04■■□□□ 1.92
MVB12A-210ENST00000529490 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.04■■□□□ 1.92
MVB12A-210ENST00000529490 GRIN2BQ13224 1484 aa27.02■■□□□ 1.92
MVB12A-210ENST00000529490 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.02■■□□□ 1.92
MVB12A-210ENST00000529490 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
MVB12A-210ENST00000529490 PBRM1Q86U86 1689 aa26.99■■□□□ 1.91
MVB12A-210ENST00000529490 TRIM41Q8WV44 630 aa26.99■■□□□ 1.91
MVB12A-210ENST00000529490 ARHGEF11O15085 1522 aa26.99■■□□□ 1.91
MVB12A-210ENST00000529490 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.97■■□□□ 1.91
MVB12A-210ENST00000529490 SYNJ2O15056 1496 aa26.91■■□□□ 1.9
MVB12A-210ENST00000529490 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.9■■□□□ 1.9
MVB12A-210ENST00000529490 FBLN2P98095 1184 aa26.9■■□□□ 1.9
MVB12A-210ENST00000529490 ADAMTS12P58397 1594 aa26.8■■□□□ 1.88
MVB12A-210ENST00000529490 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
MVB12A-210ENST00000529490 ARAP1Q96P48 1450 aa26.78■■□□□ 1.88
MVB12A-210ENST00000529490 GRIN2AQ12879 1464 aa26.71■■□□□ 1.87
MVB12A-210ENST00000529490 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.7■■□□□ 1.87
MVB12A-210ENST00000529490 CEP170Q5SW79 1584 aa26.65■■□□□ 1.86
MVB12A-210ENST00000529490 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.65■■□□□ 1.86
MVB12A-210ENST00000529490 NUP160Q12769 1436 aa26.65■■□□□ 1.86
MVB12A-210ENST00000529490 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.62■■□□□ 1.85
MVB12A-210ENST00000529490 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.53■■□□□ 1.84
MVB12A-210ENST00000529490 SHROOM2Q13796 1616 aa26.51■■□□□ 1.83
MVB12A-210ENST00000529490 IGF1RP08069 1367 aa26.45■■□□□ 1.82
MVB12A-210ENST00000529490 KIF27Q86VH2 1401 aa26.44■■□□□ 1.82
MVB12A-210ENST00000529490 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.42■■□□□ 1.82
MVB12A-210ENST00000529490 CUL7Q14999 1698 aa26.38■■□□□ 1.81
MVB12A-210ENST00000529490 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
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