RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529414.5

TM7SF2-215, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 2, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF2, Length 749 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF2-215ENST00000529414 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.61■■■■■ 5.85
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TM7SF2-215ENST00000529414 ABCC9O60706 1549 aa44.67■■■■■ 4.74
TM7SF2-215ENST00000529414 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.12■■■■■ 4.49
TM7SF2-215ENST00000529414 NACADO15069 1562 aa43.12■■■■■ 4.49
TM7SF2-215ENST00000529414 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.09■■■■■ 4.49
TM7SF2-215ENST00000529414 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
TM7SF2-215ENST00000529414 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.94■■■■■ 4.46
TM7SF2-215ENST00000529414 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.77■■■■■ 4.44
TM7SF2-215ENST00000529414 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.04■■■■■ 4.32
TM7SF2-215ENST00000529414 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.78■■■■■ 4.28
TM7SF2-215ENST00000529414 SCRIBQ14160 1630 aa41.75■■■■■ 4.27
TM7SF2-215ENST00000529414 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.72■■■■■ 4.27
TM7SF2-215ENST00000529414 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.45■■■■■ 4.23
TM7SF2-215ENST00000529414 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.88■■■■■ 4.13
TM7SF2-215ENST00000529414 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
TM7SF2-215ENST00000529414 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.44■■■■■ 4.06
TM7SF2-215ENST00000529414 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.18■■■■■ 4.02
TM7SF2-215ENST00000529414 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.02■■■■■ 4
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TM7SF2-215ENST00000529414 SMARCA2P51531 1590 aa39.79■■■■□ 3.96
TM7SF2-215ENST00000529414 NCAPD3P42695 1498 aa39.78■■■■□ 3.96
TM7SF2-215ENST00000529414 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.76■■■■□ 3.96
TM7SF2-215ENST00000529414 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.72■■■■□ 3.95
TM7SF2-215ENST00000529414 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.66■■■■□ 3.94
TM7SF2-215ENST00000529414 HMGXB3Q12766 1538 aa39.57■■■■□ 3.93
TM7SF2-215ENST00000529414 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
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TM7SF2-215ENST00000529414 WIZO95785 1651 aa39.29■■■■□ 3.88
TM7SF2-215ENST00000529414 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.94■■■■□ 3.82
TM7SF2-215ENST00000529414 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.71■■■■□ 3.79
TM7SF2-215ENST00000529414 NESP48681 1621 aa38.67■■■■□ 3.78
TM7SF2-215ENST00000529414 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.62■■■■□ 3.77
TM7SF2-215ENST00000529414 ERCC6Q03468 1493 aa38.57■■■■□ 3.76
TM7SF2-215ENST00000529414 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.48■■■■□ 3.75
TM7SF2-215ENST00000529414 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.47■■■■□ 3.75
TM7SF2-215ENST00000529414 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
TM7SF2-215ENST00000529414 CFTRP13569 1480 aa38.41■■■■□ 3.74
TM7SF2-215ENST00000529414 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.23■■■■□ 3.71
TM7SF2-215ENST00000529414 CUX2O14529 1486 aa38.15■■■■□ 3.7
TM7SF2-215ENST00000529414 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.14■■■■□ 3.7
TM7SF2-215ENST00000529414 PRDM2Q13029 1718 aa38.1■■■■□ 3.69
TM7SF2-215ENST00000529414 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.09■■■■□ 3.69
TM7SF2-215ENST00000529414 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
TM7SF2-215ENST00000529414 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.02■■■■□ 3.68
TM7SF2-215ENST00000529414 WDR62O43379 1518 aa37.87■■■■□ 3.65
TM7SF2-215ENST00000529414 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
TM7SF2-215ENST00000529414 ABCC8Q09428 1581 aa37.66■■■■□ 3.62
TM7SF2-215ENST00000529414 TOPBP1Q92547 1522 aa37.53■■■■□ 3.6
TM7SF2-215ENST00000529414 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.51■■■■□ 3.6
TM7SF2-215ENST00000529414 IFT140Q96RY7 1462 aa37.32■■■■□ 3.56
TM7SF2-215ENST00000529414 CUX1P39880 1505 aa37.26■■■■□ 3.55
TM7SF2-215ENST00000529414 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
TM7SF2-215ENST00000529414 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.13■■■■□ 3.54
TM7SF2-215ENST00000529414 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.13■■■■□ 3.535e-6■■■■■ 29.2
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TM7SF2-215ENST00000529414 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
TM7SF2-215ENST00000529414 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
TM7SF2-215ENST00000529414 TOP2BQ02880 1626 aa37.03■■■■□ 3.52
TM7SF2-215ENST00000529414 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.01■■■■□ 3.52
TM7SF2-215ENST00000529414 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37■■■■□ 3.51
TM7SF2-215ENST00000529414 SYNJ1O43426 1573 aa36.95■■■■□ 3.51
TM7SF2-215ENST00000529414 WDR97A6NE52 1622 aa36.92■■■■□ 3.5
TM7SF2-215ENST00000529414 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
TM7SF2-215ENST00000529414 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.88■■■■□ 3.58e-6■■■■□ 23.2
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TM7SF2-215ENST00000529414 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
TM7SF2-215ENST00000529414 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.83■■■■□ 3.49
TM7SF2-215ENST00000529414 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.69■■■■□ 3.46
TM7SF2-215ENST00000529414 GRIN2BQ13224 1484 aa36.67■■■■□ 3.46
TM7SF2-215ENST00000529414 OSCARQ8IYS5 282 aa36.65■■■■□ 3.46
TM7SF2-215ENST00000529414 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.62■■■■□ 3.45
TM7SF2-215ENST00000529414 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.45
TM7SF2-215ENST00000529414 PBRM1Q86U86 1689 aa36.54■■■■□ 3.44
TM7SF2-215ENST00000529414 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.53■■■■□ 3.44
TM7SF2-215ENST00000529414 FBLN2P98095 1184 aa36.47■■■■□ 3.43
TM7SF2-215ENST00000529414 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
TM7SF2-215ENST00000529414 CHD1O14646 1710 aa36.42■■■■□ 3.42
TM7SF2-215ENST00000529414 SYNJ2O15056 1496 aa36.42■■■■□ 3.42
TM7SF2-215ENST00000529414 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.41■■■■□ 3.42
TM7SF2-215ENST00000529414 KIF27Q86VH2 1401 aa36.38■■■■□ 3.41
TM7SF2-215ENST00000529414 TRIM41Q8WV44 630 aa36.38■■■■□ 3.41
TM7SF2-215ENST00000529414 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.28■■■■□ 3.4
TM7SF2-215ENST00000529414 ADAMTS12P58397 1594 aa36.25■■■■□ 3.39
TM7SF2-215ENST00000529414 IGF1RP08069 1367 aa36.18■■■■□ 3.38
TM7SF2-215ENST00000529414 GRIN2AQ12879 1464 aa36.17■■■■□ 3.38
TM7SF2-215ENST00000529414 CUL7Q14999 1698 aa36.1■■■■□ 3.37
TM7SF2-215ENST00000529414 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.05■■■■□ 3.36
TM7SF2-215ENST00000529414 NUP160Q12769 1436 aa36■■■■□ 3.35
TM7SF2-215ENST00000529414 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36■■■■□ 3.35
TM7SF2-215ENST00000529414 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.95■■■■□ 3.35
TM7SF2-215ENST00000529414 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.94■■■■□ 3.34
TM7SF2-215ENST00000529414 ARHGEF11O15085 1522 aa35.93■■■■□ 3.34
TM7SF2-215ENST00000529414 CEP170Q5SW79 1584 aa35.93■■■■□ 3.34
TM7SF2-215ENST00000529414 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.91■■■■□ 3.34
TM7SF2-215ENST00000529414 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.91■■■■□ 3.34
TM7SF2-215ENST00000529414 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.91■■■■□ 3.34
TM7SF2-215ENST00000529414 EEA1Q15075 1411 aa35.8■■■■□ 3.32
TM7SF2-215ENST00000529414 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.79■■■■□ 3.32
TM7SF2-215ENST00000529414 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.73■■■■□ 3.31
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