RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528558.1

CYHR1-207, Transcript of cysteine and histidine rich 1, humanhuman

TSL 2

Gene CYHR1, Length 907 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1-207ENST00000528558 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.13■■■■■ 6.42
CYHR1-207ENST00000528558 ABCC9O60706 1549 aa50.28■■■■■ 5.64
CYHR1-207ENST00000528558 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.77■■■■■ 5.56
CYHR1-207ENST00000528558 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.63■■■■■ 5.22
CYHR1-207ENST00000528558 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.57■■■■■ 5.21
CYHR1-207ENST00000528558 NACADO15069 1562 aa47.15■■■■■ 5.14
CYHR1-207ENST00000528558 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.69■■■■■ 5.06
CYHR1-207ENST00000528558 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.66■■■■■ 5.06
CYHR1-207ENST00000528558 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.53■■■■■ 5.04
CYHR1-207ENST00000528558 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.32■■■■■ 5.01
CYHR1-207ENST00000528558 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.24■■■■■ 4.99
CYHR1-207ENST00000528558 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.62■■■■■ 4.89
CYHR1-207ENST00000528558 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.61■■■■■ 4.89
CYHR1-207ENST00000528558 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.52■■■■■ 4.88
CYHR1-207ENST00000528558 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.4■■■■■ 4.86
CYHR1-207ENST00000528558 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.36■■■■■ 4.85
CYHR1-207ENST00000528558 SCRIBQ14160 1630 aa45.31■■■■■ 4.84
CYHR1-207ENST00000528558 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.18■■■■■ 4.82
CYHR1-207ENST00000528558 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.11■■■■■ 4.65
CYHR1-207ENST00000528558 CUX2O14529 1486 aa43.59■■■■■ 4.57
CYHR1-207ENST00000528558 NCAPD3P42695 1498 aa43.51■■■■■ 4.56
CYHR1-207ENST00000528558 ERCC6Q03468 1493 aa43.49■■■■■ 4.55
CYHR1-207ENST00000528558 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.32■■■■■ 4.52
CYHR1-207ENST00000528558 HMGXB3Q12766 1538 aa43.2■■■■■ 4.51
CYHR1-207ENST00000528558 SMARCA2P51531 1590 aa43.19■■■■■ 4.5
CYHR1-207ENST00000528558 SMARCA4P51532 1647 aa43.15■■■■■ 4.5
CYHR1-207ENST00000528558 NESP48681 1621 aa43.02■■■■■ 4.48
CYHR1-207ENST00000528558 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
CYHR1-207ENST00000528558 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
CYHR1-207ENST00000528558 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
CYHR1-207ENST00000528558 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.73■■■■■ 4.43
CYHR1-207ENST00000528558 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.66■■■■■ 4.42
CYHR1-207ENST00000528558 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.48■■■■■ 4.39
CYHR1-207ENST00000528558 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.47■■■■■ 4.39
CYHR1-207ENST00000528558 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.41■■■■■ 4.38
CYHR1-207ENST00000528558 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.15■■■■■ 4.34
CYHR1-207ENST00000528558 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.11■■■■■ 4.33
CYHR1-207ENST00000528558 WDR62O43379 1518 aa42.04■■■■■ 4.32
CYHR1-207ENST00000528558 TRIM41Q8WV44 630 aa41.99■■■■■ 4.31
CYHR1-207ENST00000528558 WIZO95785 1651 aa41.93■■■■■ 4.3
CYHR1-207ENST00000528558 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.84■■■■■ 4.29
CYHR1-207ENST00000528558 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.72■■■■■ 4.27
CYHR1-207ENST00000528558 CFTRP13569 1480 aa41.58■■■■■ 4.25
CYHR1-207ENST00000528558 OSCARQ8IYS5 282 aa41.42■■■■■ 4.22
CYHR1-207ENST00000528558 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
CYHR1-207ENST00000528558 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
CYHR1-207ENST00000528558 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
CYHR1-207ENST00000528558 PRDM2Q13029 1718 aa41.15■■■■■ 4.18
CYHR1-207ENST00000528558 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.03■■■■■ 4.16
CYHR1-207ENST00000528558 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.03■■■■■ 4.16
CYHR1-207ENST00000528558 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.03■■■■■ 4.16
CYHR1-207ENST00000528558 IFT140Q96RY7 1462 aa41.01■■■■■ 4.16
CYHR1-207ENST00000528558 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
CYHR1-207ENST00000528558 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.89■■■■■ 4.14
CYHR1-207ENST00000528558 TOPBP1Q92547 1522 aa40.87■■■■■ 4.13
CYHR1-207ENST00000528558 ARHGEF11O15085 1522 aa40.85■■■■■ 4.13
CYHR1-207ENST00000528558 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
CYHR1-207ENST00000528558 ABCC8Q09428 1581 aa40.72■■■■■ 4.11
CYHR1-207ENST00000528558 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.69■■■■■ 4.1
CYHR1-207ENST00000528558 CHD1O14646 1710 aa40.56■■■■■ 4.08
CYHR1-207ENST00000528558 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
CYHR1-207ENST00000528558 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.51■■■■■ 4.08
CYHR1-207ENST00000528558 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.49■■■■■ 4.07
CYHR1-207ENST00000528558 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.41■■■■■ 4.06
CYHR1-207ENST00000528558 ARAP1Q96P48 1450 aa40.41■■■■■ 4.06
CYHR1-207ENST00000528558 FBLN2P98095 1184 aa40.35■■■■■ 4.05
CYHR1-207ENST00000528558 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
CYHR1-207ENST00000528558 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.25■■■■■ 4.03
CYHR1-207ENST00000528558 SOGA1O94964 1423 aa40.17■■■■■ 4.02
CYHR1-207ENST00000528558 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
CYHR1-207ENST00000528558 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.14■■■■■ 4.02
CYHR1-207ENST00000528558 WDR97A6NE52 1622 aa40.13■■■■■ 4.01
CYHR1-207ENST00000528558 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.09■■■■■ 4.01
CYHR1-207ENST00000528558 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.08■■■■■ 4.01
CYHR1-207ENST00000528558 SYNJ1O43426 1573 aa40.01■■■■■ 4
CYHR1-207ENST00000528558 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40■■■■□ 3.99
CYHR1-207ENST00000528558 CUX1P39880 1505 aa39.96■■■■□ 3.99
CYHR1-207ENST00000528558 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
CYHR1-207ENST00000528558 GRIN2BQ13224 1484 aa39.94■■■■□ 3.98
CYHR1-207ENST00000528558 SYNJ2O15056 1496 aa39.88■■■■□ 3.97
CYHR1-207ENST00000528558 PBRM1Q86U86 1689 aa39.76■■■■□ 3.96
CYHR1-207ENST00000528558 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.7■■■■□ 3.95
CYHR1-207ENST00000528558 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.62■■■■□ 3.93
CYHR1-207ENST00000528558 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.6■■■■□ 3.93
CYHR1-207ENST00000528558 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
CYHR1-207ENST00000528558 GRIN2AQ12879 1464 aa39.43■■■■□ 3.9
CYHR1-207ENST00000528558 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.39■■■■□ 3.9
CYHR1-207ENST00000528558 ADAMTS12P58397 1594 aa39.38■■■■□ 3.89
CYHR1-207ENST00000528558 CEP170Q5SW79 1584 aa39.32■■■■□ 3.88
CYHR1-207ENST00000528558 NUP160Q12769 1436 aa39.31■■■■□ 3.88
CYHR1-207ENST00000528558 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.31■■■■□ 3.883e-6■■■■□ 26.3
CYHR1-207ENST00000528558 SHROOM2Q13796 1616 aa39.22■■■■□ 3.87
CYHR1-207ENST00000528558 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.18■■■■□ 3.86
CYHR1-207ENST00000528558 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.18■■■■□ 3.86
CYHR1-207ENST00000528558 TOP2BQ02880 1626 aa39.17■■■■□ 3.86
CYHR1-207ENST00000528558 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.09■■■■□ 3.85
CYHR1-207ENST00000528558 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.85
CYHR1-207ENST00000528558 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.98■■■■□ 3.83
CYHR1-207ENST00000528558 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.97■■■■□ 3.83
CYHR1-207ENST00000528558 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.84■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.2 ms