RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528519.1

EEF1D-222, Transcript of eukaryotic translation elongation factor 1 delta, human

TSL 3

Gene EEF1D, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EEF1D-222	ENST00000528519	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		40.27	■■■■■ 4.04
EEF1D-222	ENST00000528519	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.97	■■■■□ 3.35
EEF1D-222	ENST00000528519	ABCC9	O60706	1549 aa		35.84	■■■■□ 3.33
EEF1D-222	ENST00000528519	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		34.11	■■■■□ 3.05
EEF1D-222	ENST00000528519	NACAD	O15069	1562 aa		33.95	■■■■□ 3.03
EEF1D-222	ENST00000528519	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.84	■■■■□ 3.01
EEF1D-222	ENST00000528519	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		33.56	■■■□□ 2.96
EEF1D-222	ENST00000528519	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.53	■■■□□ 2.96
EEF1D-222	ENST00000528519	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.95
EEF1D-222	ENST00000528519	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		33.45	■■■□□ 2.94
EEF1D-222	ENST00000528519	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	33.44	■■■□□ 2.94
EEF1D-222	ENST00000528519	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		33.26	■■■□□ 2.92
EEF1D-222	ENST00000528519	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		33.23	■■■□□ 2.91
EEF1D-222	ENST00000528519	SCRIB	Q14160	1630 aa		32.88	■■■□□ 2.85
EEF1D-222	ENST00000528519	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.67	■■■□□ 2.82
EEF1D-222	ENST00000528519	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		32.37	■■■□□ 2.77
EEF1D-222	ENST00000528519	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
EEF1D-222	ENST00000528519	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		32.23	■■■□□ 2.75
EEF1D-222	ENST00000528519	NCAPD3	P42695	1498 aa		31.39	■■■□□ 2.62
EEF1D-222	ENST00000528519	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.38	■■■□□ 2.61
EEF1D-222	ENST00000528519	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.35	■■■□□ 2.61
EEF1D-222	ENST00000528519	SMARCA2	P51531	1590 aa		31.2	■■■□□ 2.58
EEF1D-222	ENST00000528519	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
EEF1D-222	ENST00000528519	HMGXB3	Q12766	1538 aa		31.16	■■■□□ 2.58
EEF1D-222	ENST00000528519	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		31.09	■■■□□ 2.57
EEF1D-222	ENST00000528519	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		31.05	■■■□□ 2.56
EEF1D-222	ENST00000528519	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	31.01	■■■□□ 2.56
EEF1D-222	ENST00000528519	NES	P48681	1621 aa		30.91	■■■□□ 2.54
EEF1D-222	ENST00000528519	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.84	■■■□□ 2.53
EEF1D-222	ENST00000528519	WIZ	O95785	1651 aa		30.71	■■■□□ 2.51
EEF1D-222	ENST00000528519	CUX2	O14529	1486 aa		30.71	■■■□□ 2.51
EEF1D-222	ENST00000528519	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.59	■■■□□ 2.49
EEF1D-222	ENST00000528519	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.52	■■■□□ 2.48
EEF1D-222	ENST00000528519	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	30.51	■■■□□ 2.47
EEF1D-222	ENST00000528519	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		30.48	■■■□□ 2.47
EEF1D-222	ENST00000528519	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		30.46	■■■□□ 2.47
EEF1D-222	ENST00000528519	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.44	■■■□□ 2.46
EEF1D-222	ENST00000528519	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		30.39	■■■□□ 2.45
EEF1D-222	ENST00000528519	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	30.3	■■■□□ 2.44
EEF1D-222	ENST00000528519	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		30.18	■■■□□ 2.42
EEF1D-222	ENST00000528519	CFTR	P13569	1480 aa		30.16	■■■□□ 2.42
EEF1D-222	ENST00000528519	WDR62	O43379	1518 aa		30.12	■■■□□ 2.41
EEF1D-222	ENST00000528519	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		30.1	■■■□□ 2.41
EEF1D-222	ENST00000528519	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		30.07	■■■□□ 2.4
EEF1D-222	ENST00000528519	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.99	■■■□□ 2.39
EEF1D-222	ENST00000528519	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.9	■■■□□ 2.38
EEF1D-222	ENST00000528519	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.8	■■■□□ 2.36
EEF1D-222	ENST00000528519	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.57	■■■□□ 2.32
EEF1D-222	ENST00000528519	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.51	■■■□□ 2.32
EEF1D-222	ENST00000528519	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.48	■■■□□ 2.31
EEF1D-222	ENST00000528519	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.46	■■■□□ 2.31
EEF1D-222	ENST00000528519	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.39	■■■□□ 2.3
EEF1D-222	ENST00000528519	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.34	■■■□□ 2.29
EEF1D-222	ENST00000528519	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.31	■■■□□ 2.28
EEF1D-222	ENST00000528519	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.3	■■■□□ 2.28
EEF1D-222	ENST00000528519	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	29.3	■■■□□ 2.28
EEF1D-222	ENST00000528519	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	29.29	■■■□□ 2.28
EEF1D-222	ENST00000528519	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	29.24	■■■□□ 2.27	8e-7	■□□□□ 11.3
EEF1D-222	ENST00000528519	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.23	■■■□□ 2.27
EEF1D-222	ENST00000528519	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		29.23	■■■□□ 2.27
EEF1D-222	ENST00000528519	CUX1	P39880	1505 aa		29.19	■■■□□ 2.26
EEF1D-222	ENST00000528519	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		29.15	■■■□□ 2.26
EEF1D-222	ENST00000528519	SOGA1	O94964	1423 aa		29.11	■■■□□ 2.25
EEF1D-222	ENST00000528519	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
EEF1D-222	ENST00000528519	CHD1	O14646	1710 aa		29.03	■■■□□ 2.24
EEF1D-222	ENST00000528519	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		29.01	■■■□□ 2.23
EEF1D-222	ENST00000528519	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		29.01	■■■□□ 2.23
EEF1D-222	ENST00000528519	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		29.01	■■■□□ 2.23
EEF1D-222	ENST00000528519	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.94	■■■□□ 2.22
EEF1D-222	ENST00000528519	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.93	■■■□□ 2.22
EEF1D-222	ENST00000528519	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.93	■■■□□ 2.22
EEF1D-222	ENST00000528519	FBLN2	P98095	1184 aa		28.91	■■■□□ 2.22
EEF1D-222	ENST00000528519	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.84	■■■□□ 2.21
EEF1D-222	ENST00000528519	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.8	■■■□□ 2.2
EEF1D-222	ENST00000528519	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
EEF1D-222	ENST00000528519	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.78	■■■□□ 2.2
EEF1D-222	ENST00000528519	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.77	■■■□□ 2.2
EEF1D-222	ENST00000528519	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.76	■■■□□ 2.2
EEF1D-222	ENST00000528519	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.75	■■■□□ 2.19
EEF1D-222	ENST00000528519	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.74	■■■□□ 2.19
EEF1D-222	ENST00000528519	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.73	■■■□□ 2.19
EEF1D-222	ENST00000528519	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.73	■■■□□ 2.19
EEF1D-222	ENST00000528519	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.72	■■■□□ 2.19
EEF1D-222	ENST00000528519	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.72	■■■□□ 2.19
EEF1D-222	ENST00000528519	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
EEF1D-222	ENST00000528519	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.71	■■■□□ 2.19
EEF1D-222	ENST00000528519	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.68	■■■□□ 2.18
EEF1D-222	ENST00000528519	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.53	■■■□□ 2.16
EEF1D-222	ENST00000528519	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.49	■■■□□ 2.15
EEF1D-222	ENST00000528519	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.43	■■■□□ 2.14
EEF1D-222	ENST00000528519	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.41	■■■□□ 2.14
EEF1D-222	ENST00000528519	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.41	■■■□□ 2.14
EEF1D-222	ENST00000528519	NUP160	Q12769	1436 aa		28.41	■■■□□ 2.14
EEF1D-222	ENST00000528519	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		28.38	■■■□□ 2.13
EEF1D-222	ENST00000528519	SHROOM2	Q13796	1616 aa		28.25	■■■□□ 2.11
EEF1D-222	ENST00000528519	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
EEF1D-222	ENST00000528519	IGF1R	P08069	1367 aa		28.16	■■■□□ 2.1
EEF1D-222	ENST00000528519	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		28.13	■■■□□ 2.09
EEF1D-222	ENST00000528519	KIF27	Q86VH2	1401 aa		28.12	■■■□□ 2.09
EEF1D-222	ENST00000528519	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09

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