RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528128.2

TTYH2-204, Transcript of tweety family member 2, humanhuman

TSL 4

Gene TTYH2, Length 532 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH2-204ENST00000528128 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.83■■■□□ 2.69
TTYH2-204ENST00000528128 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.59■■■□□ 2.17
TTYH2-204ENST00000528128 ABCC9O60706 1549 aa28.13■■■□□ 2.09
TTYH2-204ENST00000528128 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.03■■□□□ 1.92
TTYH2-204ENST00000528128 NACADO15069 1562 aa26.91■■□□□ 1.9
TTYH2-204ENST00000528128 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.65■■□□□ 1.86
TTYH2-204ENST00000528128 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.6■■□□□ 1.85
TTYH2-204ENST00000528128 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.45■■□□□ 1.83
TTYH2-204ENST00000528128 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
TTYH2-204ENST00000528128 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.39■■□□□ 1.82
TTYH2-204ENST00000528128 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.15■■□□□ 1.78
TTYH2-204ENST00000528128 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.15■■□□□ 1.78
TTYH2-204ENST00000528128 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.03■■□□□ 1.76
TTYH2-204ENST00000528128 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.98■■□□□ 1.75
TTYH2-204ENST00000528128 SCRIBQ14160 1630 aa25.93■■□□□ 1.74
TTYH2-204ENST00000528128 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
TTYH2-204ENST00000528128 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.51■■□□□ 1.67
TTYH2-204ENST00000528128 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.36■■□□□ 1.65
TTYH2-204ENST00000528128 SMARCA4P51532 1647 aa24.81■■□□□ 1.56
TTYH2-204ENST00000528128 NCAPD3P42695 1498 aa24.77■■□□□ 1.56
TTYH2-204ENST00000528128 SMARCA2P51531 1590 aa24.75■■□□□ 1.55
TTYH2-204ENST00000528128 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TTYH2-204ENST00000528128 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.71■■□□□ 1.55
TTYH2-204ENST00000528128 HMGXB3Q12766 1538 aa24.68■■□□□ 1.54
TTYH2-204ENST00000528128 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.6■■□□□ 1.53
TTYH2-204ENST00000528128 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
TTYH2-204ENST00000528128 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.47■■□□□ 1.51
TTYH2-204ENST00000528128 ERCC6Q03468 1493 aa24.33■■□□□ 1.49
TTYH2-204ENST00000528128 CUX2O14529 1486 aa24.26■■□□□ 1.47
TTYH2-204ENST00000528128 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.24■■□□□ 1.47
TTYH2-204ENST00000528128 WIZO95785 1651 aa24.24■■□□□ 1.47
TTYH2-204ENST00000528128 NESP48681 1621 aa24.22■■□□□ 1.47
TTYH2-204ENST00000528128 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
TTYH2-204ENST00000528128 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.05■■□□□ 1.44
TTYH2-204ENST00000528128 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.05■■□□□ 1.44
TTYH2-204ENST00000528128 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
TTYH2-204ENST00000528128 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.01■■□□□ 1.43
TTYH2-204ENST00000528128 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
TTYH2-204ENST00000528128 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.82■■□□□ 1.4
TTYH2-204ENST00000528128 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.82■■□□□ 1.4
TTYH2-204ENST00000528128 CFTRP13569 1480 aa23.81■■□□□ 1.4
TTYH2-204ENST00000528128 PRDM2Q13029 1718 aa23.79■■□□□ 1.4
TTYH2-204ENST00000528128 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.78■■□□□ 1.4
TTYH2-204ENST00000528128 WDR62O43379 1518 aa23.78■■□□□ 1.4
TTYH2-204ENST00000528128 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.75■■□□□ 1.39
TTYH2-204ENST00000528128 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.63■■□□□ 1.37
TTYH2-204ENST00000528128 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TTYH2-204ENST00000528128 ABCC8Q09428 1581 aa23.38■■□□□ 1.33
TTYH2-204ENST00000528128 TOPBP1Q92547 1522 aa23.33■■□□□ 1.33
TTYH2-204ENST00000528128 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.32■■□□□ 1.32
TTYH2-204ENST00000528128 IFT140Q96RY7 1462 aa23.3■■□□□ 1.32
TTYH2-204ENST00000528128 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
TTYH2-204ENST00000528128 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
TTYH2-204ENST00000528128 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
TTYH2-204ENST00000528128 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
TTYH2-204ENST00000528128 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
TTYH2-204ENST00000528128 OSCARQ8IYS5 282 aa23.1■■□□□ 1.29
TTYH2-204ENST00000528128 WDR97A6NE52 1622 aa23.04■■□□□ 1.28
TTYH2-204ENST00000528128 CUX1P39880 1505 aa23■■□□□ 1.27
TTYH2-204ENST00000528128 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.99■■□□□ 1.27
TTYH2-204ENST00000528128 SOGA1O94964 1423 aa22.97■■□□□ 1.27
TTYH2-204ENST00000528128 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
TTYH2-204ENST00000528128 CHD1O14646 1710 aa22.95■■□□□ 1.26
TTYH2-204ENST00000528128 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.95■■□□□ 1.26
TTYH2-204ENST00000528128 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
TTYH2-204ENST00000528128 TRIM41Q8WV44 630 aa22.84■■□□□ 1.25
TTYH2-204ENST00000528128 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.82■■□□□ 1.24
TTYH2-204ENST00000528128 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.82■■□□□ 1.24
TTYH2-204ENST00000528128 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.82■■□□□ 1.24
TTYH2-204ENST00000528128 PBRM1Q86U86 1689 aa22.81■■□□□ 1.24
TTYH2-204ENST00000528128 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
TTYH2-204ENST00000528128 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.8■■□□□ 1.24
TTYH2-204ENST00000528128 GRIN2BQ13224 1484 aa22.79■■□□□ 1.24
TTYH2-204ENST00000528128 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.79■■□□□ 1.24
TTYH2-204ENST00000528128 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.78■■□□□ 1.24
TTYH2-204ENST00000528128 TOP2BQ02880 1626 aa22.77■■□□□ 1.24
TTYH2-204ENST00000528128 ARHGEF11O15085 1522 aa22.77■■□□□ 1.24
TTYH2-204ENST00000528128 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.75■■□□□ 1.23
TTYH2-204ENST00000528128 FBLN2P98095 1184 aa22.74■■□□□ 1.23
TTYH2-204ENST00000528128 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.73■■□□□ 1.23
TTYH2-204ENST00000528128 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
TTYH2-204ENST00000528128 SYNJ1O43426 1573 aa22.71■■□□□ 1.23
TTYH2-204ENST00000528128 SYNJ2O15056 1496 aa22.7■■□□□ 1.22
TTYH2-204ENST00000528128 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TTYH2-204ENST00000528128 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.64■■□□□ 1.21
TTYH2-204ENST00000528128 ADAMTS12P58397 1594 aa22.55■■□□□ 1.2
TTYH2-204ENST00000528128 ARAP1Q96P48 1450 aa22.54■■□□□ 1.2
TTYH2-204ENST00000528128 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.53■■□□□ 1.2
TTYH2-204ENST00000528128 GRIN2AQ12879 1464 aa22.5■■□□□ 1.19
TTYH2-204ENST00000528128 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.48■■□□□ 1.19
TTYH2-204ENST00000528128 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.47■■□□□ 1.19
TTYH2-204ENST00000528128 NUP160Q12769 1436 aa22.41■■□□□ 1.18
TTYH2-204ENST00000528128 CEP170Q5SW79 1584 aa22.39■■□□□ 1.18
TTYH2-204ENST00000528128 SHROOM2Q13796 1616 aa22.34■■□□□ 1.17
TTYH2-204ENST00000528128 KIF27Q86VH2 1401 aa22.31■■□□□ 1.16
TTYH2-204ENST00000528128 CUL7Q14999 1698 aa22.3■■□□□ 1.16
TTYH2-204ENST00000528128 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.23■■□□□ 1.15
TTYH2-204ENST00000528128 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.22■■□□□ 1.15
TTYH2-204ENST00000528128 IGF1RP08069 1367 aa22.19■■□□□ 1.14
TTYH2-204ENST00000528128 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms