RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527967.5

CDON-204, Transcript of cell adhesion associated, oncogene regulated, humanhuman

TSL 3

Gene CDON, Length 722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDON-204ENST00000527967 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.7■■■■■ 6.35
CDON-204ENST00000527967 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.5■■■■■ 5.35
CDON-204ENST00000527967 ABCC9O60706 1549 aa47.22■■■■■ 5.15
CDON-204ENST00000527967 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.61■■■■■ 4.89
CDON-204ENST00000527967 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.6■■■■■ 4.89
CDON-204ENST00000527967 NACADO15069 1562 aa45.57■■■■■ 4.89
CDON-204ENST00000527967 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.54■■■■■ 4.88
CDON-204ENST00000527967 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.41■■■■■ 4.86
CDON-204ENST00000527967 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.29■■■■■ 4.84
CDON-204ENST00000527967 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.44■■■■■ 4.71
CDON-204ENST00000527967 SCRIBQ14160 1630 aa44.25■■■■■ 4.67
CDON-204ENST00000527967 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.18■■■■■ 4.66
CDON-204ENST00000527967 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.14■■■■■ 4.66
CDON-204ENST00000527967 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.75■■■■■ 4.59
CDON-204ENST00000527967 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.12■■■■■ 4.49
CDON-204ENST00000527967 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.96■■■■■ 4.47
CDON-204ENST00000527967 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.72■■■■■ 4.43
CDON-204ENST00000527967 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.57■■■■■ 4.41
CDON-204ENST00000527967 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.37
CDON-204ENST00000527967 SMARCA4P51532 1647 aa42.37■■■■■ 4.37
CDON-204ENST00000527967 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.14■■■■■ 4.34
CDON-204ENST00000527967 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.11■■■■■ 4.33
CDON-204ENST00000527967 SMARCA2P51531 1590 aa42.07■■■■■ 4.33
CDON-204ENST00000527967 NCAPD3P42695 1498 aa42.05■■■■■ 4.32
CDON-204ENST00000527967 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.97■■■■■ 4.31
CDON-204ENST00000527967 HMGXB3Q12766 1538 aa41.85■■■■■ 4.29
CDON-204ENST00000527967 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
CDON-204ENST00000527967 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
CDON-204ENST00000527967 WIZO95785 1651 aa41.68■■■■■ 4.26
CDON-204ENST00000527967 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
CDON-204ENST00000527967 NESP48681 1621 aa40.93■■■■■ 4.14
CDON-204ENST00000527967 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
CDON-204ENST00000527967 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.89■■■■■ 4.14
CDON-204ENST00000527967 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.85■■■■■ 4.13
CDON-204ENST00000527967 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.81■■■■■ 4.12
CDON-204ENST00000527967 ERCC6Q03468 1493 aa40.7■■■■■ 4.11
CDON-204ENST00000527967 CFTRP13569 1480 aa40.65■■■■■ 4.1
CDON-204ENST00000527967 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.63■■■■■ 4.09
CDON-204ENST00000527967 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.42■■■■■ 4.06
CDON-204ENST00000527967 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.36■■■■■ 4.05
CDON-204ENST00000527967 PRDM2Q13029 1718 aa40.3■■■■■ 4.04
CDON-204ENST00000527967 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.29■■■■■ 4.04
CDON-204ENST00000527967 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
CDON-204ENST00000527967 CUX2O14529 1486 aa40.19■■■■■ 4.03
CDON-204ENST00000527967 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.18■■■■■ 4.02
CDON-204ENST00000527967 WDR62O43379 1518 aa40.02■■■■■ 4
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CDON-204ENST00000527967 TOPBP1Q92547 1522 aa39.75■■■■□ 3.95
CDON-204ENST00000527967 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.72■■■■□ 3.95
CDON-204ENST00000527967 CUX1P39880 1505 aa39.52■■■■□ 3.92
CDON-204ENST00000527967 IFT140Q96RY7 1462 aa39.44■■■■□ 3.9
CDON-204ENST00000527967 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.42■■■■□ 3.9
CDON-204ENST00000527967 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.39■■■■□ 3.9
CDON-204ENST00000527967 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.36■■■■□ 3.89
CDON-204ENST00000527967 SOGA1O94964 1423 aa39.29■■■■□ 3.88
CDON-204ENST00000527967 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
CDON-204ENST00000527967 TOP2BQ02880 1626 aa39.25■■■■□ 3.87
CDON-204ENST00000527967 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.24■■■■□ 3.87
CDON-204ENST00000527967 SYNJ1O43426 1573 aa39.24■■■■□ 3.87
CDON-204ENST00000527967 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.24■■■■□ 3.87
CDON-204ENST00000527967 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.21■■■■□ 3.87
CDON-204ENST00000527967 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
CDON-204ENST00000527967 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.04■■■■□ 3.84
CDON-204ENST00000527967 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.01■■■■□ 3.84
CDON-204ENST00000527967 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.01■■■■□ 3.84
CDON-204ENST00000527967 WDR97A6NE52 1622 aa39■■■■□ 3.83
CDON-204ENST00000527967 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.82■■■■□ 3.81
CDON-204ENST00000527967 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.8■■■■□ 3.8
CDON-204ENST00000527967 GRIN2BQ13224 1484 aa38.79■■■■□ 3.8
CDON-204ENST00000527967 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.68■■■■□ 3.78
CDON-204ENST00000527967 PBRM1Q86U86 1689 aa38.68■■■■□ 3.78
CDON-204ENST00000527967 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.67■■■■□ 3.78
CDON-204ENST00000527967 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.66■■■■□ 3.78
CDON-204ENST00000527967 TRIM41Q8WV44 630 aa38.64■■■■□ 3.78
CDON-204ENST00000527967 OSCARQ8IYS5 282 aa38.59■■■■□ 3.77
CDON-204ENST00000527967 KIF27Q86VH2 1401 aa38.55■■■■□ 3.76
CDON-204ENST00000527967 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.54■■■■□ 3.76
CDON-204ENST00000527967 FBLN2P98095 1184 aa38.53■■■■□ 3.76
CDON-204ENST00000527967 SYNJ2O15056 1496 aa38.5■■■■□ 3.75
CDON-204ENST00000527967 CHD1O14646 1710 aa38.49■■■■□ 3.75
CDON-204ENST00000527967 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.49■■■■□ 3.75
CDON-204ENST00000527967 ADAMTS12P58397 1594 aa38.4■■■■□ 3.74
CDON-204ENST00000527967 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.4■■■■□ 3.74
CDON-204ENST00000527967 IGF1RP08069 1367 aa38.37■■■■□ 3.73
CDON-204ENST00000527967 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.33■■■■□ 3.73
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CDON-204ENST00000527967 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.24■■■■□ 3.71
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CDON-204ENST00000527967 NUP160Q12769 1436 aa38.11■■■■□ 3.69
CDON-204ENST00000527967 CEP170Q5SW79 1584 aa38.06■■■■□ 3.68
CDON-204ENST00000527967 EEA1Q15075 1411 aa38■■■■□ 3.67
CDON-204ENST00000527967 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.95■■■■□ 3.67
CDON-204ENST00000527967 ARHGEF11O15085 1522 aa37.92■■■■□ 3.66
CDON-204ENST00000527967 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.91■■■■□ 3.66
CDON-204ENST00000527967 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.89■■■■□ 3.66
CDON-204ENST00000527967 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.89■■■■□ 3.66
CDON-204ENST00000527967 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.89■■■■□ 3.66
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