RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525811.5

GMDS-AS1-204, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 539 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-204ENST00000525811 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.4■■□□□ 1.18
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GMDS-AS1-204ENST00000525811 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.32■□□□□ 0.84
GMDS-AS1-204ENST00000525811 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.14■□□□□ 0.81
GMDS-AS1-204ENST00000525811 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
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GMDS-AS1-204ENST00000525811 CECR2Q9BXF3 1484 aa19.66■□□□□ 0.74
GMDS-AS1-204ENST00000525811 BICRAQ9NZM4 1560 aa19.61■□□□□ 0.73
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.57■□□□□ 0.72
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GMDS-AS1-204ENST00000525811 CUX2O14529 1486 aa19.1■□□□□ 0.65
GMDS-AS1-204ENST00000525811 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.97■□□□□ 0.63
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GMDS-AS1-204ENST00000525811 NCAPD3P42695 1498 aa18.16■□□□□ 0.5
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GMDS-AS1-204ENST00000525811 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.03■□□□□ 0.48
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GMDS-AS1-204ENST00000525811 WDR62O43379 1518 aa17.84■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ARHGEF11O15085 1522 aa17.82■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-204ENST00000525811 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SMARCA4P51532 1647 aa17.76■□□□□ 0.43
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CYB5RLQ6IPT4 315 aa17.75■□□□□ 0.43
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ARAP1Q96P48 1450 aa17.58■□□□□ 0.41
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.58■□□□□ 0.4
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.57■□□□□ 0.4
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GMDS-AS1-204ENST00000525811 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.44■□□□□ 0.38
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.43■□□□□ 0.38
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GMDS-AS1-204ENST00000525811 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
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GMDS-AS1-204ENST00000525811 WIZO95785 1651 aa17.08■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-204ENST00000525811 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.05■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.05■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-204ENST00000525811 PRDM2Q13029 1718 aa17.01■□□□□ 0.31
GMDS-AS1-204ENST00000525811 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa17■□□□□ 0.31
GMDS-AS1-204ENST00000525811 TOPBP1Q92547 1522 aa17■□□□□ 0.31
GMDS-AS1-204ENST00000525811 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.96■□□□□ 0.31
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SYNJ1O43426 1573 aa16.94■□□□□ 0.3
GMDS-AS1-204ENST00000525811 KIF13AQ9H1H9 1805 aa16.93■□□□□ 0.3
GMDS-AS1-204ENST00000525811 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.87■□□□□ 0.29
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.84■□□□□ 0.29
GMDS-AS1-204ENST00000525811 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.84■□□□□ 0.29
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GMDS-AS1-204ENST00000525811 HECW2Q9P2P5 1572 aa16.81■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ABCC8Q09428 1581 aa16.79■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-204ENST00000525811 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-204ENST00000525811 FBXO41Q8TF61 875 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-204ENST00000525811 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-204ENST00000525811 KDM6BO15054 1643 aa16.75■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-204ENST00000525811 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.74■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-204ENST00000525811 LMTK3Q96Q04 1460 aa16.73■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-204ENST00000525811 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-204ENST00000525811 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SYNJ2O15056 1496 aa16.68■□□□□ 0.26
GMDS-AS1-204ENST00000525811 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.66■□□□□ 0.26
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ADGRL1O94910 1474 aa16.66■□□□□ 0.26
GMDS-AS1-204ENST00000525811 TSPOAP1O95153 1857 aa16.63■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SOGA1O94964 1423 aa16.62■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-204ENST00000525811 WDR97A6NE52 1622 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-204ENST00000525811 GRIN2BQ13224 1484 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.6■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CEP170Q5SW79 1584 aa16.58■□□□□ 0.24
GMDS-AS1-204ENST00000525811 DIP2BQ9P265 1576 aa16.58■□□□□ 0.24
GMDS-AS1-204ENST00000525811 PBRM1Q86U86 1689 aa16.57■□□□□ 0.24
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SOCS7O14512 581 aa16.57■□□□□ 0.24
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ILDR2Q71H61 639 aa16.54■□□□□ 0.24
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.54■□□□□ 0.24
GMDS-AS1-204ENST00000525811 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.5■□□□□ 0.23
GMDS-AS1-204ENST00000525811 MAPKBP1O60336 1514 aa16.45■□□□□ 0.22
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