RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524582.1

ZCCHC11-217, Transcript of Terminal uridylyltransferase 4, humanhuman

TSL 4

Gene ZCCHC11, Length 539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC11-217ENST00000524582 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.14■■■■■ 5.46
ZCCHC11-217ENST00000524582 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.9■■■■■ 4.62
ZCCHC11-217ENST00000524582 ABCC9O60706 1549 aa43.43■■■■■ 4.54
ZCCHC11-217ENST00000524582 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.54■■■■■ 4.24
ZCCHC11-217ENST00000524582 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.44■■■■■ 4.22
ZCCHC11-217ENST00000524582 NACADO15069 1562 aa41.36■■■■■ 4.21
ZCCHC11-217ENST00000524582 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.88■■■■■ 4.13
ZCCHC11-217ENST00000524582 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
ZCCHC11-217ENST00000524582 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.66■■■■■ 4.1
ZCCHC11-217ENST00000524582 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.57■■■■■ 4.08
ZCCHC11-217ENST00000524582 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.52■■■■■ 4.08
ZCCHC11-217ENST00000524582 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.26■■■■■ 4.04
ZCCHC11-217ENST00000524582 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.18■■■■■ 4.02
ZCCHC11-217ENST00000524582 SCRIBQ14160 1630 aa40.11■■■■■ 4.01
ZCCHC11-217ENST00000524582 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.72■■■■□ 3.95
ZCCHC11-217ENST00000524582 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.26■■■■□ 3.88
ZCCHC11-217ENST00000524582 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.24■■■■□ 3.87
ZCCHC11-217ENST00000524582 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.04■■■■□ 3.84
ZCCHC11-217ENST00000524582 SMARCA4P51532 1647 aa38.26■■■■□ 3.71
ZCCHC11-217ENST00000524582 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.14■■■■□ 3.7
ZCCHC11-217ENST00000524582 NCAPD3P42695 1498 aa38.13■■■■□ 3.69
ZCCHC11-217ENST00000524582 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.12■■■■□ 3.69
ZCCHC11-217ENST00000524582 SMARCA2P51531 1590 aa38.07■■■■□ 3.69
ZCCHC11-217ENST00000524582 HMGXB3Q12766 1538 aa37.92■■■■□ 3.66
ZCCHC11-217ENST00000524582 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.89■■■■□ 3.66
ZCCHC11-217ENST00000524582 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.84■■■■□ 3.65
ZCCHC11-217ENST00000524582 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.81■■■■□ 3.64
ZCCHC11-217ENST00000524582 WIZO95785 1651 aa37.52■■■■□ 3.6
ZCCHC11-217ENST00000524582 ERCC6Q03468 1493 aa37.49■■■■□ 3.59
ZCCHC11-217ENST00000524582 NESP48681 1621 aa37.43■■■■□ 3.58
ZCCHC11-217ENST00000524582 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
ZCCHC11-217ENST00000524582 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.25■■■■□ 3.55
ZCCHC11-217ENST00000524582 CUX2O14529 1486 aa37.14■■■■□ 3.54
ZCCHC11-217ENST00000524582 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
ZCCHC11-217ENST00000524582 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.03■■■■□ 3.52
ZCCHC11-217ENST00000524582 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.02■■■■□ 3.52
ZCCHC11-217ENST00000524582 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.02■■■■□ 3.52
ZCCHC11-217ENST00000524582 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
ZCCHC11-217ENST00000524582 CFTRP13569 1480 aa36.69■■■■□ 3.46
ZCCHC11-217ENST00000524582 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.66■■■■□ 3.46
ZCCHC11-217ENST00000524582 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.65■■■■□ 3.46
ZCCHC11-217ENST00000524582 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.64■■■■□ 3.46
ZCCHC11-217ENST00000524582 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.61■■■■□ 3.45
ZCCHC11-217ENST00000524582 WDR62O43379 1518 aa36.54■■■■□ 3.44
ZCCHC11-217ENST00000524582 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.51■■■■□ 3.44
ZCCHC11-217ENST00000524582 PRDM2Q13029 1718 aa36.5■■■■□ 3.43
ZCCHC11-217ENST00000524582 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
ZCCHC11-217ENST00000524582 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
ZCCHC11-217ENST00000524582 TOPBP1Q92547 1522 aa36■■■■□ 3.35
ZCCHC11-217ENST00000524582 ABCC8Q09428 1581 aa35.95■■■■□ 3.35
ZCCHC11-217ENST00000524582 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.93■■■■□ 3.34
ZCCHC11-217ENST00000524582 IFT140Q96RY7 1462 aa35.86■■■■□ 3.33
ZCCHC11-217ENST00000524582 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.31
ZCCHC11-217ENST00000524582 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
ZCCHC11-217ENST00000524582 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
ZCCHC11-217ENST00000524582 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
ZCCHC11-217ENST00000524582 OSCARQ8IYS5 282 aa35.59■■■■□ 3.29
ZCCHC11-217ENST00000524582 CUX1P39880 1505 aa35.57■■■■□ 3.28
ZCCHC11-217ENST00000524582 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.55■■■■□ 3.28
ZCCHC11-217ENST00000524582 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.54■■■■□ 3.28
ZCCHC11-217ENST00000524582 SOGA1O94964 1423 aa35.54■■■■□ 3.28
ZCCHC11-217ENST00000524582 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.53■■■■□ 3.281e-8■■■■■ 34.3
ZCCHC11-217ENST00000524582 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
ZCCHC11-217ENST00000524582 CHD1O14646 1710 aa35.32■■■■□ 3.24
ZCCHC11-217ENST00000524582 WDR97A6NE52 1622 aa35.28■■■■□ 3.24
ZCCHC11-217ENST00000524582 FBLN2P98095 1184 aa35.28■■■■□ 3.24
ZCCHC11-217ENST00000524582 TRIM41Q8WV44 630 aa35.28■■■■□ 3.24
ZCCHC11-217ENST00000524582 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.2■■■■□ 3.23
ZCCHC11-217ENST00000524582 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.18■■■■□ 3.22
ZCCHC11-217ENST00000524582 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.17■■■■□ 3.22
ZCCHC11-217ENST00000524582 TOP2BQ02880 1626 aa35.15■■■■□ 3.22
ZCCHC11-217ENST00000524582 SYNJ1O43426 1573 aa35.15■■■■□ 3.22
ZCCHC11-217ENST00000524582 GRIN2BQ13224 1484 aa35.15■■■■□ 3.22
ZCCHC11-217ENST00000524582 PBRM1Q86U86 1689 aa35.13■■■■□ 3.21
ZCCHC11-217ENST00000524582 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.12■■■■□ 3.21
ZCCHC11-217ENST00000524582 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.11■■■■□ 3.21
ZCCHC11-217ENST00000524582 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
ZCCHC11-217ENST00000524582 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.08■■■■□ 3.21
ZCCHC11-217ENST00000524582 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.08■■■■□ 3.21
ZCCHC11-217ENST00000524582 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.08■■■■□ 3.21
ZCCHC11-217ENST00000524582 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
ZCCHC11-217ENST00000524582 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.05■■■■□ 3.2
ZCCHC11-217ENST00000524582 ARHGEF11O15085 1522 aa34.99■■■■□ 3.19
ZCCHC11-217ENST00000524582 SYNJ2O15056 1496 aa34.97■■■■□ 3.19
ZCCHC11-217ENST00000524582 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.81■■■■□ 3.16
ZCCHC11-217ENST00000524582 ADAMTS12P58397 1594 aa34.76■■■■□ 3.16
ZCCHC11-217ENST00000524582 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.76■■■■□ 3.16
ZCCHC11-217ENST00000524582 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.71■■■■□ 3.15
ZCCHC11-217ENST00000524582 GRIN2AQ12879 1464 aa34.7■■■■□ 3.15
ZCCHC11-217ENST00000524582 ARAP1Q96P48 1450 aa34.67■■■■□ 3.14
ZCCHC11-217ENST00000524582 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.66■■■■□ 3.14
ZCCHC11-217ENST00000524582 CEP170Q5SW79 1584 aa34.56■■■■□ 3.12
ZCCHC11-217ENST00000524582 NUP160Q12769 1436 aa34.52■■■■□ 3.12
ZCCHC11-217ENST00000524582 KIF27Q86VH2 1401 aa34.5■■■■□ 3.11
ZCCHC11-217ENST00000524582 IGF1RP08069 1367 aa34.37■■■■□ 3.09
ZCCHC11-217ENST00000524582 CUL7Q14999 1698 aa34.36■■■■□ 3.09
ZCCHC11-217ENST00000524582 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.36■■■■□ 3.09
ZCCHC11-217ENST00000524582 SHROOM2Q13796 1616 aa34.33■■■■□ 3.09
ZCCHC11-217ENST00000524582 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
ZCCHC11-217ENST00000524582 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.25■■■■□ 3.07
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