RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520999.6

TSPAN18-209, Transcript of tetraspanin 18, humanhuman

TSL 5

Gene TSPAN18, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TSPAN18-209ENST00000520999 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.73■■■□□ 2.83
TSPAN18-209ENST00000520999 SMARCA4P51532 1647 aa32.73■■■□□ 2.83
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TSPAN18-209ENST00000520999 SMARCA2P51531 1590 aa32.44■■■□□ 2.78
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TSPAN18-209ENST00000520999 NCAPD3P42695 1498 aa32.32■■■□□ 2.76
TSPAN18-209ENST00000520999 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.21■■■□□ 2.75
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TSPAN18-209ENST00000520999 NESP48681 1621 aa31.02■■■□□ 2.56
TSPAN18-209ENST00000520999 PRDM2Q13029 1718 aa31.01■■■□□ 2.55
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TSPAN18-209ENST00000520999 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.83■■■□□ 2.53
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TSPAN18-209ENST00000520999 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.59■■■□□ 2.49
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TSPAN18-209ENST00000520999 WDR97A6NE52 1622 aa30.08■■■□□ 2.41
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TSPAN18-209ENST00000520999 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.73■■■□□ 2.35
TSPAN18-209ENST00000520999 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.71■■■□□ 2.35
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TSPAN18-209ENST00000520999 NUP160Q12769 1436 aa29.32■■■□□ 2.28
TSPAN18-209ENST00000520999 FBLN2P98095 1184 aa29.3■■■□□ 2.28
TSPAN18-209ENST00000520999 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.3■■■□□ 2.28
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