RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520036.1

ACTBP6-201, Transcript of actin, beta pseudogene 6, humanhuman

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Gene ACTBP6, Length 1,090 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP6-201ENST00000520036 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTBP6-201ENST00000520036 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.04■□□□□ 0.64
ACTBP6-201ENST00000520036 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
ACTBP6-201ENST00000520036 ABCC9O60706 1549 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTBP6-201ENST00000520036 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
ACTBP6-201ENST00000520036 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTBP6-201ENST00000520036 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTBP6-201ENST00000520036 NACADO15069 1562 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTBP6-201ENST00000520036 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.79■□□□□ 0.44
ACTBP6-201ENST00000520036 DCAF8L2P0C7V8 631 aa17.79■□□□□ 0.44
ACTBP6-201ENST00000520036 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTBP6-201ENST00000520036 SCRIBQ14160 1630 aa17.28■□□□□ 0.36
ACTBP6-201ENST00000520036 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.23■□□□□ 0.35
ACTBP6-201ENST00000520036 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.21■□□□□ 0.35
ACTBP6-201ENST00000520036 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTBP6-201ENST00000520036 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.08■□□□□ 0.32
ACTBP6-201ENST00000520036 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
ACTBP6-201ENST00000520036 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
ACTBP6-201ENST00000520036 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTBP6-201ENST00000520036 SMARCA4P51532 1647 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTBP6-201ENST00000520036 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTBP6-201ENST00000520036 SMARCA2P51531 1590 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTBP6-201ENST00000520036 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTBP6-201ENST00000520036 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP6-201ENST00000520036 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
ACTBP6-201ENST00000520036 NCAPD3P42695 1498 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP6-201ENST00000520036 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP6-201ENST00000520036 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTBP6-201ENST00000520036 HMGXB3Q12766 1538 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTBP6-201ENST00000520036 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
ACTBP6-201ENST00000520036 WIZO95785 1651 aa16.33■□□□□ 0.2
ACTBP6-201ENST00000520036 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
ACTBP6-201ENST00000520036 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
ACTBP6-201ENST00000520036 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTBP6-201ENST00000520036 CADPSQ9ULU8 1353 aa16■□□□□ 0.15
ACTBP6-201ENST00000520036 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTBP6-201ENST00000520036 CFTRP13569 1480 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTBP6-201ENST00000520036 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTBP6-201ENST00000520036 NESP48681 1621 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTBP6-201ENST00000520036 PRDM2Q13029 1718 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTBP6-201ENST00000520036 ERCC6Q03468 1493 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTBP6-201ENST00000520036 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTBP6-201ENST00000520036 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.77■□□□□ 0.11
ACTBP6-201ENST00000520036 ABCC8Q09428 1581 aa15.69■□□□□ 0.1
ACTBP6-201ENST00000520036 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.67■□□□□ 0.1
ACTBP6-201ENST00000520036 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTBP6-201ENST00000520036 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
ACTBP6-201ENST00000520036 WDR62O43379 1518 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTBP6-201ENST00000520036 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ACTBP6-201ENST00000520036 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.58■□□□□ 0.08
ACTBP6-201ENST00000520036 CUX2O14529 1486 aa15.58■□□□□ 0.08
ACTBP6-201ENST00000520036 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.58■□□□□ 0.08
ACTBP6-201ENST00000520036 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
ACTBP6-201ENST00000520036 TOPBP1Q92547 1522 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTBP6-201ENST00000520036 CUX1P39880 1505 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTBP6-201ENST00000520036 TOP2BQ02880 1626 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTBP6-201ENST00000520036 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTBP6-201ENST00000520036 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
ACTBP6-201ENST00000520036 IFT140Q96RY7 1462 aa15.44■□□□□ 0.06
ACTBP6-201ENST00000520036 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.43■□□□□ 0.06
ACTBP6-201ENST00000520036 SYNJ1O43426 1573 aa15.43■□□□□ 0.06
ACTBP6-201ENST00000520036 SOGA1O94964 1423 aa15.41■□□□□ 0.06
ACTBP6-201ENST00000520036 TRIM41Q8WV44 630 aa15.4■□□□□ 0.06
ACTBP6-201ENST00000520036 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
ACTBP6-201ENST00000520036 WDR97A6NE52 1622 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTBP6-201ENST00000520036 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTBP6-201ENST00000520036 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
ACTBP6-201ENST00000520036 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.31■□□□□ 0.04
ACTBP6-201ENST00000520036 KIF27Q86VH2 1401 aa15.26■□□□□ 0.03
ACTBP6-201ENST00000520036 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
ACTBP6-201ENST00000520036 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
ACTBP6-201ENST00000520036 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.23■□□□□ 0.03
ACTBP6-201ENST00000520036 EEA1Q15075 1411 aa15.23■□□□□ 0.03
ACTBP6-201ENST00000520036 GRIN2BQ13224 1484 aa15.22■□□□□ 0.03
ACTBP6-201ENST00000520036 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.22■□□□□ 0.03
ACTBP6-201ENST00000520036 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.21■□□□□ 0.03
ACTBP6-201ENST00000520036 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
ACTBP6-201ENST00000520036 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.02
ACTBP6-201ENST00000520036 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTBP6-201ENST00000520036 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
ACTBP6-201ENST00000520036 IGF1RP08069 1367 aa15.12■□□□□ 0.01
ACTBP6-201ENST00000520036 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.1■□□□□ 0.01
ACTBP6-201ENST00000520036 PBRM1Q86U86 1689 aa15.09■□□□□ 0.01
ACTBP6-201ENST00000520036 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.09■□□□□ 0.01
ACTBP6-201ENST00000520036 CUL7Q14999 1698 aa15.09■□□□□ 0.01
ACTBP6-201ENST00000520036 SYNJ2O15056 1496 aa15.08■□□□□ 0.01
ACTBP6-201ENST00000520036 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.07■□□□□ 0
ACTBP6-201ENST00000520036 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.06■□□□□ 0
ACTBP6-201ENST00000520036 ADAMTS12P58397 1594 aa15.04■□□□□ -0
ACTBP6-201ENST00000520036 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.04■□□□□ -0
ACTBP6-201ENST00000520036 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
ACTBP6-201ENST00000520036 PRXQ9BXM0 1461 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTBP6-201ENST00000520036 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTBP6-201ENST00000520036 GRIN2AQ12879 1464 aa15□□□□□ -0.01
ACTBP6-201ENST00000520036 FBLN2P98095 1184 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTBP6-201ENST00000520036 OSCARQ8IYS5 282 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTBP6-201ENST00000520036 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTBP6-201ENST00000520036 KIF21BO75037 1637 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTBP6-201ENST00000520036 NUP160Q12769 1436 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTBP6-201ENST00000520036 CHD1O14646 1710 aa14.9□□□□□ -0.02
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