RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517982.1

PTDSS1-204, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTDSS1, Length 1,215 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-204ENST00000517982 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.89■■■□□ 2.54
PTDSS1-204ENST00000517982 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.19■■□□□ 1.94
PTDSS1-204ENST00000517982 ABCC9O60706 1549 aa26.22■■□□□ 1.79
PTDSS1-204ENST00000517982 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.83■■□□□ 1.73
PTDSS1-204ENST00000517982 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
PTDSS1-204ENST00000517982 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.58■■□□□ 1.69
PTDSS1-204ENST00000517982 NACADO15069 1562 aa25.52■■□□□ 1.68
PTDSS1-204ENST00000517982 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.51■■□□□ 1.67
PTDSS1-204ENST00000517982 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.44■■□□□ 1.66
PTDSS1-204ENST00000517982 SCRIBQ14160 1630 aa24.89■■□□□ 1.57
PTDSS1-204ENST00000517982 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.79■■□□□ 1.56
PTDSS1-204ENST00000517982 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.67■■□□□ 1.54
PTDSS1-204ENST00000517982 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.54
PTDSS1-204ENST00000517982 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.54■■□□□ 1.52
PTDSS1-204ENST00000517982 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.99■■□□□ 1.43
PTDSS1-204ENST00000517982 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PTDSS1-204ENST00000517982 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PTDSS1-204ENST00000517982 SMARCA4P51532 1647 aa23.84■■□□□ 1.41
PTDSS1-204ENST00000517982 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.79■■□□□ 1.4
PTDSS1-204ENST00000517982 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
PTDSS1-204ENST00000517982 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.69■■□□□ 1.38
PTDSS1-204ENST00000517982 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PTDSS1-204ENST00000517982 SMARCA2P51531 1590 aa23.65■■□□□ 1.38
PTDSS1-204ENST00000517982 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.62■■□□□ 1.37
PTDSS1-204ENST00000517982 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.58■■□□□ 1.37
PTDSS1-204ENST00000517982 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.58■■□□□ 1.37
PTDSS1-204ENST00000517982 NCAPD3P42695 1498 aa23.56■■□□□ 1.36
PTDSS1-204ENST00000517982 WIZO95785 1651 aa23.54■■□□□ 1.36
PTDSS1-204ENST00000517982 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PTDSS1-204ENST00000517982 HMGXB3Q12766 1538 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1-204ENST00000517982 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PTDSS1-204ENST00000517982 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.11■■□□□ 1.29
PTDSS1-204ENST00000517982 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.94■■□□□ 1.26
PTDSS1-204ENST00000517982 CFTRP13569 1480 aa22.85■■□□□ 1.25
PTDSS1-204ENST00000517982 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.84■■□□□ 1.25
PTDSS1-204ENST00000517982 NESP48681 1621 aa22.79■■□□□ 1.24
PTDSS1-204ENST00000517982 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.76■■□□□ 1.23
PTDSS1-204ENST00000517982 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.65■■□□□ 1.22
PTDSS1-204ENST00000517982 ERCC6Q03468 1493 aa22.64■■□□□ 1.21
PTDSS1-204ENST00000517982 PRDM2Q13029 1718 aa22.6■■□□□ 1.21
PTDSS1-204ENST00000517982 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.59■■□□□ 1.21
PTDSS1-204ENST00000517982 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.47■■□□□ 1.19
PTDSS1-204ENST00000517982 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.43■■□□□ 1.18
PTDSS1-204ENST00000517982 ABCC8Q09428 1581 aa22.42■■□□□ 1.18
PTDSS1-204ENST00000517982 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
PTDSS1-204ENST00000517982 TRIM41Q8WV44 630 aa22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-204ENST00000517982 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1-204ENST00000517982 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.32■■□□□ 1.16
PTDSS1-204ENST00000517982 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS1-204ENST00000517982 TOPBP1Q92547 1522 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS1-204ENST00000517982 CUX1P39880 1505 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS1-204ENST00000517982 WDR62O43379 1518 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-204ENST00000517982 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-204ENST00000517982 TOP2BQ02880 1626 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-204ENST00000517982 SYNJ1O43426 1573 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1-204ENST00000517982 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.2■■□□□ 1.14
PTDSS1-204ENST00000517982 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.18■■□□□ 1.14
PTDSS1-204ENST00000517982 CUX2O14529 1486 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-204ENST00000517982 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTDSS1-204ENST00000517982 SOGA1O94964 1423 aa22.14■■□□□ 1.14
PTDSS1-204ENST00000517982 IFT140Q96RY7 1462 aa22.09■■□□□ 1.13
PTDSS1-204ENST00000517982 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS1-204ENST00000517982 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.99■■□□□ 1.11
PTDSS1-204ENST00000517982 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-204ENST00000517982 KIF27Q86VH2 1401 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-204ENST00000517982 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-204ENST00000517982 WDR97A6NE52 1622 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-204ENST00000517982 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-204ENST00000517982 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-204ENST00000517982 EEA1Q15075 1411 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-204ENST00000517982 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
PTDSS1-204ENST00000517982 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PTDSS1-204ENST00000517982 GRIN2BQ13224 1484 aa21.81■■□□□ 1.08
PTDSS1-204ENST00000517982 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-204ENST00000517982 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-204ENST00000517982 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1-204ENST00000517982 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1-204ENST00000517982 IGF1RP08069 1367 aa21.76■■□□□ 1.07
PTDSS1-204ENST00000517982 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.75■■□□□ 1.07
PTDSS1-204ENST00000517982 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1-204ENST00000517982 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1-204ENST00000517982 PBRM1Q86U86 1689 aa21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1-204ENST00000517982 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1-204ENST00000517982 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1-204ENST00000517982 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.65■■□□□ 1.06
PTDSS1-204ENST00000517982 FBLN2P98095 1184 aa21.65■■□□□ 1.06
PTDSS1-204ENST00000517982 CUL7Q14999 1698 aa21.62■■□□□ 1.05
PTDSS1-204ENST00000517982 SYNJ2O15056 1496 aa21.59■■□□□ 1.05
PTDSS1-204ENST00000517982 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.58■■□□□ 1.05
PTDSS1-204ENST00000517982 PRXQ9BXM0 1461 aa21.58■■□□□ 1.04
PTDSS1-204ENST00000517982 ADAMTS12P58397 1594 aa21.56■■□□□ 1.04
PTDSS1-204ENST00000517982 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.53■■□□□ 1.04
PTDSS1-204ENST00000517982 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PTDSS1-204ENST00000517982 KIF21BO75037 1637 aa21.49■■□□□ 1.03
PTDSS1-204ENST00000517982 GOLGA3Q08378 1498 aa21.49■■□□□ 1.03
PTDSS1-204ENST00000517982 GRIN2AQ12879 1464 aa21.49■■□□□ 1.03
PTDSS1-204ENST00000517982 OSCARQ8IYS5 282 aa21.45■■□□□ 1.02
PTDSS1-204ENST00000517982 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.41■■□□□ 1.02
PTDSS1-204ENST00000517982 CHD1O14646 1710 aa21.39■■□□□ 1.01
PTDSS1-204ENST00000517982 NUP160Q12769 1436 aa21.37■■□□□ 1.01
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