RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517313.1

IGLVIV-65-201, Transcript of immunoglobulin lambda variable (IV)-65 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGLVIV-65, Length 360 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLVIV-65-201ENST00000517313 NISCHQ9Y2I1 1504 aa10.9□□□□□ -0.66
IGLVIV-65-201ENST00000517313 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
IGLVIV-65-201ENST00000517313 CHIC1Q5VXU3 224 aa9.86□□□□□ -0.83
IGLVIV-65-201ENST00000517313 ABCC9O60706 1549 aa9.79□□□□□ -0.84
IGLVIV-65-201ENST00000517313 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa9.75□□□□□ -0.85
IGLVIV-65-201ENST00000517313 DCAF8L2P0C7V8 631 aa9.36□□□□□ -0.91
IGLVIV-65-201ENST00000517313 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa9.26□□□□□ -0.93
IGLVIV-65-201ENST00000517313 NACADO15069 1562 aa9.16□□□□□ -0.94
IGLVIV-65-201ENST00000517313 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.95
IGLVIV-65-201ENST00000517313 UNC13AQ9UPW8 1703 aa9.12□□□□□ -0.95
IGLVIV-65-201ENST00000517313 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
IGLVIV-65-201ENST00000517313 SCRIBQ14160 1630 aa9.05□□□□□ -0.96
IGLVIV-65-201ENST00000517313 DNAJC5BQ9UF47 199 aa8.99□□□□□ -0.97
IGLVIV-65-201ENST00000517313 BICRAQ9NZM4 1560 aa8.97□□□□□ -0.97
IGLVIV-65-201ENST00000517313 MYO15BQ96JP2 1530 aa8.94□□□□□ -0.98
IGLVIV-65-201ENST00000517313 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa8.9□□□□□ -0.98
IGLVIV-65-201ENST00000517313 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa8.8□□□□□ -1
IGLVIV-65-201ENST00000517313 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa8.79□□□□□ -1
IGLVIV-65-201ENST00000517313 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
IGLVIV-65-201ENST00000517313 CECR2Q9BXF3 1484 aa8.74□□□□□ -1.01
IGLVIV-65-201ENST00000517313 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
IGLVIV-65-201ENST00000517313 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
IGLVIV-65-201ENST00000517313 SMARCA4P51532 1647 aa8.54□□□□□ -1.04
IGLVIV-65-201ENST00000517313 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
IGLVIV-65-201ENST00000517313 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa8.47□□□□□ -1.05
IGLVIV-65-201ENST00000517313 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
IGLVIV-65-201ENST00000517313 SMARCA2P51531 1590 aa8.46□□□□□ -1.06
IGLVIV-65-201ENST00000517313 MROH2BQ7Z745 1585 aa8.46□□□□□ -1.06
IGLVIV-65-201ENST00000517313 ERCC6Q03468 1493 aa8.45□□□□□ -1.06
IGLVIV-65-201ENST00000517313 NESP48681 1621 aa8.43□□□□□ -1.06
IGLVIV-65-201ENST00000517313 HMGXB3Q12766 1538 aa8.42□□□□□ -1.06
IGLVIV-65-201ENST00000517313 WIZO95785 1651 aa8.42□□□□□ -1.06
IGLVIV-65-201ENST00000517313 NCAPD3P42695 1498 aa8.41□□□□□ -1.06
IGLVIV-65-201ENST00000517313 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.35□□□□□ -1.07
IGLVIV-65-201ENST00000517313 PEG3Q9GZU2 1588 aa8.34□□□□□ -1.07
IGLVIV-65-201ENST00000517313 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.28□□□□□ -1.08
IGLVIV-65-201ENST00000517313 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
IGLVIV-65-201ENST00000517313 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
IGLVIV-65-201ENST00000517313 CUX2O14529 1486 aa8.26□□□□□ -1.09
IGLVIV-65-201ENST00000517313 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
IGLVIV-65-201ENST00000517313 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8.22□□□□□ -1.09
IGLVIV-65-201ENST00000517313 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.21□□□□□ -1.1
IGLVIV-65-201ENST00000517313 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.19□□□□□ -1.1
IGLVIV-65-201ENST00000517313 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.19□□□□□ -1.1
IGLVIV-65-201ENST00000517313 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.19□□□□□ -1.1
IGLVIV-65-201ENST00000517313 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
IGLVIV-65-201ENST00000517313 PRDM2Q13029 1718 aa8.16□□□□□ -1.1
IGLVIV-65-201ENST00000517313 CCDC88BA6NC98 1476 aa8.15□□□□□ -1.1
IGLVIV-65-201ENST00000517313 WDR62O43379 1518 aa8.14□□□□□ -1.11
IGLVIV-65-201ENST00000517313 CFTRP13569 1480 aa8.13□□□□□ -1.11
IGLVIV-65-201ENST00000517313 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.12□□□□□ -1.11
IGLVIV-65-201ENST00000517313 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
IGLVIV-65-201ENST00000517313 TRIM41Q8WV44 630 aa8.04□□□□□ -1.12
IGLVIV-65-201ENST00000517313 TOPBP1Q92547 1522 aa8.03□□□□□ -1.12
IGLVIV-65-201ENST00000517313 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
IGLVIV-65-201ENST00000517313 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
IGLVIV-65-201ENST00000517313 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.01□□□□□ -1.13
IGLVIV-65-201ENST00000517313 FOXD1Q16676 465 aa8□□□□□ -1.13
IGLVIV-65-201ENST00000517313 PLPPR3Q6T4P5 718 aa7.98□□□□□ -1.13
IGLVIV-65-201ENST00000517313 IFT140Q96RY7 1462 aa7.98□□□□□ -1.13
IGLVIV-65-201ENST00000517313 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.98□□□□□ -1.13
IGLVIV-65-201ENST00000517313 FBLN2P98095 1184 aa7.97□□□□□ -1.13
IGLVIV-65-201ENST00000517313 CHD1O14646 1710 aa7.97□□□□□ -1.13
IGLVIV-65-201ENST00000517313 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.13
IGLVIV-65-201ENST00000517313 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
IGLVIV-65-201ENST00000517313 FGD5Q6ZNL6 1462 aa7.95□□□□□ -1.14
IGLVIV-65-201ENST00000517313 CUX1P39880 1505 aa7.94□□□□□ -1.14
IGLVIV-65-201ENST00000517313 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
IGLVIV-65-201ENST00000517313 ABCC8Q09428 1581 aa7.93□□□□□ -1.14
IGLVIV-65-201ENST00000517313 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
IGLVIV-65-201ENST00000517313 OSCARQ8IYS5 282 aa7.91□□□□□ -1.14
IGLVIV-65-201ENST00000517313 SOGA1O94964 1423 aa7.91□□□□□ -1.14
IGLVIV-65-201ENST00000517313 PBRM1Q86U86 1689 aa7.91□□□□□ -1.14
IGLVIV-65-201ENST00000517313 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7.9□□□□□ -1.14
IGLVIV-65-201ENST00000517313 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa7.89□□□□□ -1.15
IGLVIV-65-201ENST00000517313 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa7.89□□□□□ -1.15
IGLVIV-65-201ENST00000517313 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa7.89□□□□□ -1.15
IGLVIV-65-201ENST00000517313 WDR97A6NE52 1622 aa7.89□□□□□ -1.15
IGLVIV-65-201ENST00000517313 SYNJ1O43426 1573 aa7.88□□□□□ -1.15
IGLVIV-65-201ENST00000517313 ARHGEF11O15085 1522 aa7.84□□□□□ -1.15
IGLVIV-65-201ENST00000517313 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
IGLVIV-65-201ENST00000517313 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP7.84□□□□□ -1.15
IGLVIV-65-201ENST00000517313 GRIN2BQ13224 1484 aa7.83□□□□□ -1.16
IGLVIV-65-201ENST00000517313 GAPVD1Q14C86 1478 aa7.83□□□□□ -1.16
IGLVIV-65-201ENST00000517313 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa7.83□□□□□ -1.16
IGLVIV-65-201ENST00000517313 TOP2BQ02880 1626 aa7.82□□□□□ -1.16
IGLVIV-65-201ENST00000517313 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa7.82□□□□□ -1.16
IGLVIV-65-201ENST00000517313 CYB5RLQ6IPT4 315 aa7.81□□□□□ -1.16
IGLVIV-65-201ENST00000517313 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
IGLVIV-65-201ENST00000517313 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.79□□□□□ -1.16
IGLVIV-65-201ENST00000517313 SYNJ2O15056 1496 aa7.79□□□□□ -1.16
IGLVIV-65-201ENST00000517313 ADAMTS12P58397 1594 aa7.79□□□□□ -1.16
IGLVIV-65-201ENST00000517313 ARAP1Q96P48 1450 aa7.78□□□□□ -1.16
IGLVIV-65-201ENST00000517313 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.77□□□□□ -1.17
IGLVIV-65-201ENST00000517313 TRHP20396 242 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
IGLVIV-65-201ENST00000517313 CEP170Q5SW79 1584 aa7.75□□□□□ -1.17
IGLVIV-65-201ENST00000517313 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
IGLVIV-65-201ENST00000517313 GRIN2AQ12879 1464 aa7.75□□□□□ -1.17
IGLVIV-65-201ENST00000517313 ERCC6L2Q5T890 1561 aa7.74□□□□□ -1.17
IGLVIV-65-201ENST00000517313 FHAD1B1AJZ9 1412 aa7.7□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 172.7 ms