RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514296.5

POLK-216, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 5

Gene POLK, Length 1,536 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-216ENST00000514296 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.71■■■□□ 2.83
POLK-216ENST00000514296 ABCC9O60706 1549 aa29.64■■■□□ 2.34
POLK-216ENST00000514296 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.42■■■□□ 2.3
POLK-216ENST00000514296 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.07■■■□□ 2.08
POLK-216ENST00000514296 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.92■■■□□ 2.06
POLK-216ENST00000514296 NACADO15069 1562 aa27.8■■■□□ 2.04
POLK-216ENST00000514296 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.74■■■□□ 2.03
POLK-216ENST00000514296 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.57■■■□□ 2
POLK-216ENST00000514296 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.56■■■□□ 2
POLK-216ENST00000514296 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.32■■□□□ 1.96
POLK-216ENST00000514296 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.3■■□□□ 1.96
POLK-216ENST00000514296 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
POLK-216ENST00000514296 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.93■■□□□ 1.9
POLK-216ENST00000514296 SCRIBQ14160 1630 aa26.9■■□□□ 1.9
POLK-216ENST00000514296 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.77■■□□□ 1.88
POLK-216ENST00000514296 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.74■■□□□ 1.87
POLK-216ENST00000514296 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.66■■□□□ 1.86
POLK-216ENST00000514296 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
POLK-216ENST00000514296 NCAPD3P42695 1498 aa25.66■■□□□ 1.7
POLK-216ENST00000514296 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.65■■□□□ 1.7
POLK-216ENST00000514296 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.61■■□□□ 1.69
POLK-216ENST00000514296 SMARCA4P51532 1647 aa25.59■■□□□ 1.69
POLK-216ENST00000514296 ERCC6Q03468 1493 aa25.56■■□□□ 1.68
POLK-216ENST00000514296 SMARCA2P51531 1590 aa25.51■■□□□ 1.67
POLK-216ENST00000514296 CUX2O14529 1486 aa25.5■■□□□ 1.67
POLK-216ENST00000514296 HMGXB3Q12766 1538 aa25.49■■□□□ 1.67
POLK-216ENST00000514296 NESP48681 1621 aa25.44■■□□□ 1.66
POLK-216ENST00000514296 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
POLK-216ENST00000514296 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
POLK-216ENST00000514296 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.27■■□□□ 1.64
POLK-216ENST00000514296 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.26■■□□□ 1.63
POLK-216ENST00000514296 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
POLK-216ENST00000514296 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.14■■□□□ 1.61
POLK-216ENST00000514296 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.13■■□□□ 1.61
POLK-216ENST00000514296 WIZO95785 1651 aa24.99■■□□□ 1.59
POLK-216ENST00000514296 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.96■■□□□ 1.59
POLK-216ENST00000514296 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.89■■□□□ 1.57
POLK-216ENST00000514296 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.81■■□□□ 1.56
POLK-216ENST00000514296 WDR62O43379 1518 aa24.76■■□□□ 1.55
POLK-216ENST00000514296 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.69■■□□□ 1.54
POLK-216ENST00000514296 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.65■■□□□ 1.54
POLK-216ENST00000514296 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
POLK-216ENST00000514296 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
POLK-216ENST00000514296 TRIM41Q8WV44 630 aa24.58■■□□□ 1.53
POLK-216ENST00000514296 CFTRP13569 1480 aa24.58■■□□□ 1.53
POLK-216ENST00000514296 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
POLK-216ENST00000514296 PRDM2Q13029 1718 aa24.42■■□□□ 1.5
POLK-216ENST00000514296 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.32■■□□□ 1.48
POLK-216ENST00000514296 OSCARQ8IYS5 282 aa24.3■■□□□ 1.48
POLK-216ENST00000514296 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
POLK-216ENST00000514296 TOPBP1Q92547 1522 aa24.18■■□□□ 1.46
POLK-216ENST00000514296 IFT140Q96RY7 1462 aa24.17■■□□□ 1.46
POLK-216ENST00000514296 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.11■■□□□ 1.45
POLK-216ENST00000514296 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.11■■□□□ 1.45
POLK-216ENST00000514296 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.11■■□□□ 1.45
POLK-216ENST00000514296 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
POLK-216ENST00000514296 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.07■■□□□ 1.44
POLK-216ENST00000514296 ABCC8Q09428 1581 aa24.01■■□□□ 1.43
POLK-216ENST00000514296 ARHGEF11O15085 1522 aa23.99■■□□□ 1.43
POLK-216ENST00000514296 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
POLK-216ENST00000514296 CHD1O14646 1710 aa23.98■■□□□ 1.43
POLK-216ENST00000514296 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.432e-6■■■■■ 26.9
POLK-216ENST00000514296 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
POLK-216ENST00000514296 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.89■■□□□ 1.41
POLK-216ENST00000514296 FBLN2P98095 1184 aa23.84■■□□□ 1.41
POLK-216ENST00000514296 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.8■■□□□ 1.4
POLK-216ENST00000514296 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
POLK-216ENST00000514296 SOGA1O94964 1423 aa23.78■■□□□ 1.4
POLK-216ENST00000514296 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.78■■□□□ 1.4
POLK-216ENST00000514296 ARAP1Q96P48 1450 aa23.76■■□□□ 1.39
POLK-216ENST00000514296 CUX1P39880 1505 aa23.74■■□□□ 1.39
POLK-216ENST00000514296 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.73■■□□□ 1.39
POLK-216ENST00000514296 WDR97A6NE52 1622 aa23.64■■□□□ 1.37
POLK-216ENST00000514296 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.63■■□□□ 1.37
POLK-216ENST00000514296 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
POLK-216ENST00000514296 GRIN2BQ13224 1484 aa23.59■■□□□ 1.37
POLK-216ENST00000514296 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
POLK-216ENST00000514296 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
POLK-216ENST00000514296 PBRM1Q86U86 1689 aa23.59■■□□□ 1.37
POLK-216ENST00000514296 SYNJ1O43426 1573 aa23.58■■□□□ 1.37
POLK-216ENST00000514296 SYNJ2O15056 1496 aa23.52■■□□□ 1.36
POLK-216ENST00000514296 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
POLK-216ENST00000514296 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.5■■□□□ 1.35
POLK-216ENST00000514296 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
POLK-216ENST00000514296 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.47■■□□□ 1.35
POLK-216ENST00000514296 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.44■■□□□ 1.34
POLK-216ENST00000514296 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.33■■□□□ 1.33
POLK-216ENST00000514296 ADAMTS12P58397 1594 aa23.32■■□□□ 1.32
POLK-216ENST00000514296 GRIN2AQ12879 1464 aa23.31■■□□□ 1.32
POLK-216ENST00000514296 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.31■■□□□ 1.32
POLK-216ENST00000514296 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
POLK-216ENST00000514296 TOP2BQ02880 1626 aa23.29■■□□□ 1.32
POLK-216ENST00000514296 CEP170Q5SW79 1584 aa23.28■■□□□ 1.32
POLK-216ENST00000514296 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.23■■□□□ 1.31
POLK-216ENST00000514296 NUP160Q12769 1436 aa23.21■■□□□ 1.31
POLK-216ENST00000514296 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.17■■□□□ 1.3
POLK-216ENST00000514296 SHROOM2Q13796 1616 aa23.16■■□□□ 1.3
POLK-216ENST00000514296 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.13■■□□□ 1.29
POLK-216ENST00000514296 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
POLK-216ENST00000514296 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23■■□□□ 1.27
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