RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511258.5

NSD1-211, Transcript of nuclear receptor binding SET domain protein 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene NSD1, Length 809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD1-211ENST00000511258 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34■■■■□ 3.03
NSD1-211ENST00000511258 ABCC9O60706 1549 aa31.23■■■□□ 2.59
NSD1-211ENST00000511258 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.79■■■□□ 2.52
NSD1-211ENST00000511258 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.64■■■□□ 2.34
NSD1-211ENST00000511258 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.55■■■□□ 2.32
NSD1-211ENST00000511258 NACADO15069 1562 aa29.2■■■□□ 2.26
NSD1-211ENST00000511258 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.97■■■□□ 2.23
NSD1-211ENST00000511258 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.23
NSD1-211ENST00000511258 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.88■■■□□ 2.21
NSD1-211ENST00000511258 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.63■■■□□ 2.17
NSD1-211ENST00000511258 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.6■■■□□ 2.17
NSD1-211ENST00000511258 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.24■■■□□ 2.11
NSD1-211ENST00000511258 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.19■■■□□ 2.1
NSD1-211ENST00000511258 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.18■■■□□ 2.1
NSD1-211ENST00000511258 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
NSD1-211ENST00000511258 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.06■■■□□ 2.08
NSD1-211ENST00000511258 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
NSD1-211ENST00000511258 SCRIBQ14160 1630 aa28■■■□□ 2.07
NSD1-211ENST00000511258 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
NSD1-211ENST00000511258 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.64■■■□□ 2.02
NSD1-211ENST00000511258 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.21■■□□□ 1.95
NSD1-211ENST00000511258 CUX2O14529 1486 aa27.13■■□□□ 1.93
NSD1-211ENST00000511258 ERCC6Q03468 1493 aa27.04■■□□□ 1.92
NSD1-211ENST00000511258 NCAPD3P42695 1498 aa26.93■■□□□ 1.9
NSD1-211ENST00000511258 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.77■■□□□ 1.88
NSD1-211ENST00000511258 SMARCA2P51531 1590 aa26.72■■□□□ 1.87
NSD1-211ENST00000511258 HMGXB3Q12766 1538 aa26.7■■□□□ 1.87
NSD1-211ENST00000511258 NESP48681 1621 aa26.65■■□□□ 1.86
NSD1-211ENST00000511258 SMARCA4P51532 1647 aa26.65■■□□□ 1.86
NSD1-211ENST00000511258 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
NSD1-211ENST00000511258 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
NSD1-211ENST00000511258 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
NSD1-211ENST00000511258 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.45■■□□□ 1.82
NSD1-211ENST00000511258 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.37■■□□□ 1.81
NSD1-211ENST00000511258 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.36■■□□□ 1.81
NSD1-211ENST00000511258 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.31■■□□□ 1.8
NSD1-211ENST00000511258 TRIM41Q8WV44 630 aa26.28■■□□□ 1.8
NSD1-211ENST00000511258 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.18■■□□□ 1.78
NSD1-211ENST00000511258 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.1■■□□□ 1.77
NSD1-211ENST00000511258 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.09■■□□□ 1.77
NSD1-211ENST00000511258 WDR62O43379 1518 aa26.04■■□□□ 1.76
NSD1-211ENST00000511258 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.91■■□□□ 1.74
NSD1-211ENST00000511258 WIZO95785 1651 aa25.87■■□□□ 1.73
NSD1-211ENST00000511258 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.81■■□□□ 1.72
NSD1-211ENST00000511258 OSCARQ8IYS5 282 aa25.8■■□□□ 1.72
NSD1-211ENST00000511258 CFTRP13569 1480 aa25.68■■□□□ 1.7
NSD1-211ENST00000511258 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
NSD1-211ENST00000511258 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.53■■□□□ 1.68
NSD1-211ENST00000511258 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.53■■□□□ 1.68
NSD1-211ENST00000511258 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.53■■□□□ 1.68
NSD1-211ENST00000511258 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
NSD1-211ENST00000511258 PRDM2Q13029 1718 aa25.49■■□□□ 1.67
NSD1-211ENST00000511258 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
NSD1-211ENST00000511258 IFT140Q96RY7 1462 aa25.4■■□□□ 1.66
NSD1-211ENST00000511258 ARHGEF11O15085 1522 aa25.39■■□□□ 1.66
NSD1-211ENST00000511258 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
NSD1-211ENST00000511258 TOPBP1Q92547 1522 aa25.26■■□□□ 1.63
NSD1-211ENST00000511258 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
NSD1-211ENST00000511258 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.24■■□□□ 1.63
NSD1-211ENST00000511258 ABCC8Q09428 1581 aa25.22■■□□□ 1.63
NSD1-211ENST00000511258 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.21■■□□□ 1.63
NSD1-211ENST00000511258 CHD1O14646 1710 aa25.18■■□□□ 1.62
NSD1-211ENST00000511258 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
NSD1-211ENST00000511258 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.14■■□□□ 1.62
NSD1-211ENST00000511258 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.617e-6■■□□□ 12.2
NSD1-211ENST00000511258 FBLN2P98095 1184 aa25.08■■□□□ 1.61
NSD1-211ENST00000511258 ARAP1Q96P48 1450 aa25.08■■□□□ 1.6
NSD1-211ENST00000511258 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
NSD1-211ENST00000511258 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
NSD1-211ENST00000511258 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.88■■□□□ 1.57
NSD1-211ENST00000511258 SOGA1O94964 1423 aa24.86■■□□□ 1.57
NSD1-211ENST00000511258 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
NSD1-211ENST00000511258 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.83■■□□□ 1.57
NSD1-211ENST00000511258 WDR97A6NE52 1622 aa24.83■■□□□ 1.57
NSD1-211ENST00000511258 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.82■■□□□ 1.56
NSD1-211ENST00000511258 SYNJ1O43426 1573 aa24.82■■□□□ 1.56
NSD1-211ENST00000511258 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
NSD1-211ENST00000511258 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
NSD1-211ENST00000511258 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.75■■□□□ 1.55
NSD1-211ENST00000511258 GRIN2BQ13224 1484 aa24.7■■□□□ 1.55
NSD1-211ENST00000511258 SYNJ2O15056 1496 aa24.68■■□□□ 1.54
NSD1-211ENST00000511258 CUX1P39880 1505 aa24.63■■□□□ 1.53
NSD1-211ENST00000511258 PBRM1Q86U86 1689 aa24.62■■□□□ 1.53
NSD1-211ENST00000511258 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.62■■□□□ 1.53
NSD1-211ENST00000511258 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.46■■□□□ 1.51
NSD1-211ENST00000511258 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.43■■□□□ 1.5
NSD1-211ENST00000511258 GRIN2AQ12879 1464 aa24.38■■□□□ 1.49
NSD1-211ENST00000511258 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.38■■□□□ 1.49
NSD1-211ENST00000511258 CEP170Q5SW79 1584 aa24.34■■□□□ 1.49
NSD1-211ENST00000511258 ADAMTS12P58397 1594 aa24.32■■□□□ 1.48
NSD1-211ENST00000511258 NUP160Q12769 1436 aa24.29■■□□□ 1.48
NSD1-211ENST00000511258 SHROOM2Q13796 1616 aa24.27■■□□□ 1.48
NSD1-211ENST00000511258 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.26■■□□□ 1.47
NSD1-211ENST00000511258 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
NSD1-211ENST00000511258 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.21■■□□□ 1.47
NSD1-211ENST00000511258 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.15■■□□□ 1.46
NSD1-211ENST00000511258 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.14■■□□□ 1.45
NSD1-211ENST00000511258 TOP2BQ02880 1626 aa24.13■■□□□ 1.45
NSD1-211ENST00000511258 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
NSD1-211ENST00000511258 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
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