RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510310.1

SEC31A-231, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, human

TSL 4

Gene SEC31A, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEC31A-231	ENST00000510310	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		57.76	■■■■■ 6.84
SEC31A-231	ENST00000510310	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		51.02	■■■■■ 5.76
SEC31A-231	ENST00000510310	ABCC9	O60706	1549 aa		49.63	■■■■■ 5.54
SEC31A-231	ENST00000510310	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	48.33	■■■■■ 5.33
SEC31A-231	ENST00000510310	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		47.88	■■■■■ 5.26
SEC31A-231	ENST00000510310	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.85	■■■■■ 5.25
SEC31A-231	ENST00000510310	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		47.72	■■■■■ 5.23
SEC31A-231	ENST00000510310	NACAD	O15069	1562 aa		47.7	■■■■■ 5.23
SEC31A-231	ENST00000510310	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.53	■■■■■ 5.2
SEC31A-231	ENST00000510310	SCRIB	Q14160	1630 aa		46.56	■■■■■ 5.04
SEC31A-231	ENST00000510310	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.43	■■■■■ 5.02
SEC31A-231	ENST00000510310	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		46.41	■■■■■ 5.02
SEC31A-231	ENST00000510310	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.25	■■■■■ 4.99
SEC31A-231	ENST00000510310	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		46.19	■■■■■ 4.98
SEC31A-231	ENST00000510310	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		45.95	■■■■■ 4.95
SEC31A-231	ENST00000510310	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		44.83	■■■■■ 4.77
SEC31A-231	ENST00000510310	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.82	■■■■■ 4.77
SEC31A-231	ENST00000510310	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	44.78	■■■■■ 4.76
SEC31A-231	ENST00000510310	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	44.76	■■■■■ 4.76
SEC31A-231	ENST00000510310	SMARCA4	P51532	1647 aa		44.64	■■■■■ 4.74
SEC31A-231	ENST00000510310	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		44.5	■■■■■ 4.71
SEC31A-231	ENST00000510310	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	44.34	■■■■■ 4.69
SEC31A-231	ENST00000510310	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		44.18	■■■■■ 4.66
SEC31A-231	ENST00000510310	SMARCA2	P51531	1590 aa		44.18	■■■■■ 4.66
SEC31A-231	ENST00000510310	WIZ	O95785	1651 aa		44.1	■■■■■ 4.65
SEC31A-231	ENST00000510310	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		44.1	■■■■■ 4.65
SEC31A-231	ENST00000510310	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	43.98	■■■■■ 4.63
SEC31A-231	ENST00000510310	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.95	■■■■■ 4.63
SEC31A-231	ENST00000510310	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.87	■■■■■ 4.61
SEC31A-231	ENST00000510310	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.85	■■■■■ 4.61
SEC31A-231	ENST00000510310	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	43.73	■■■■■ 4.59
SEC31A-231	ENST00000510310	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		43.16	■■■■■ 4.5
SEC31A-231	ENST00000510310	ERCC6	Q03468	1493 aa		42.88	■■■■■ 4.46
SEC31A-231	ENST00000510310	CUX2	O14529	1486 aa		42.74	■■■■■ 4.43
SEC31A-231	ENST00000510310	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.72	■■■■■ 4.43
SEC31A-231	ENST00000510310	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.69	■■■■■ 4.43
SEC31A-231	ENST00000510310	CFTR	P13569	1480 aa		42.67	■■■■■ 4.42
SEC31A-231	ENST00000510310	NES	P48681	1621 aa		42.65	■■■■■ 4.42
SEC31A-231	ENST00000510310	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		42.57	■■■■■ 4.41
SEC31A-231	ENST00000510310	PRDM2	Q13029	1718 aa		42.56	■■■■■ 4.4
SEC31A-231	ENST00000510310	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.37	■■■■■ 4.37
SEC31A-231	ENST00000510310	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		42.24	■■■■■ 4.35
SEC31A-231	ENST00000510310	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.18	■■■■■ 4.34
SEC31A-231	ENST00000510310	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.15	■■■■■ 4.34
SEC31A-231	ENST00000510310	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		42.13	■■■■■ 4.34
SEC31A-231	ENST00000510310	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.88	■■■■■ 4.3
SEC31A-231	ENST00000510310	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		41.85	■■■■■ 4.29
SEC31A-231	ENST00000510310	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	41.84	■■■■■ 4.29
SEC31A-231	ENST00000510310	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.75	■■■■■ 4.27
SEC31A-231	ENST00000510310	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.72	■■■■■ 4.27
SEC31A-231	ENST00000510310	CUX1	P39880	1505 aa		41.7	■■■■■ 4.27
SEC31A-231	ENST00000510310	WDR62	O43379	1518 aa		41.68	■■■■■ 4.26
SEC31A-231	ENST00000510310	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.68	■■■■■ 4.26
SEC31A-231	ENST00000510310	TOP2B	Q02880	1626 aa		41.66	■■■■■ 4.26
SEC31A-231	ENST00000510310	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		41.66	■■■■■ 4.26
SEC31A-231	ENST00000510310	SYNJ1	O43426	1573 aa		41.65	■■■■■ 4.26
SEC31A-231	ENST00000510310	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		41.59	■■■■■ 4.25
SEC31A-231	ENST00000510310	TRIM41	Q8WV44	630 aa		41.54	■■■■■ 4.24
SEC31A-231	ENST00000510310	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		41.43	■■■■■ 4.22
SEC31A-231	ENST00000510310	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	41.37	■■■■■ 4.21
SEC31A-231	ENST00000510310	SOGA1	O94964	1423 aa		41.24	■■■■■ 4.19
SEC31A-231	ENST00000510310	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.21	■■■■■ 4.19
SEC31A-231	ENST00000510310	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		41.15	■■■■■ 4.18
SEC31A-231	ENST00000510310	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	41.14	■■■■■ 4.18
SEC31A-231	ENST00000510310	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		41.09	■■■■■ 4.17
SEC31A-231	ENST00000510310	WDR97	A6NE52	1622 aa		41.07	■■■■■ 4.17
SEC31A-231	ENST00000510310	KIF27	Q86VH2	1401 aa		40.92	■■■■■ 4.14
SEC31A-231	ENST00000510310	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		40.86	■■■■■ 4.13
SEC31A-231	ENST00000510310	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.85	■■■■■ 4.13
SEC31A-231	ENST00000510310	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	40.84	■■■■■ 4.13
SEC31A-231	ENST00000510310	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.84	■■■■■ 4.13
SEC31A-231	ENST00000510310	EEA1	Q15075	1411 aa		40.84	■■■■■ 4.13
SEC31A-231	ENST00000510310	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	40.81	■■■■■ 4.12
SEC31A-231	ENST00000510310	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.79	■■■■■ 4.12
SEC31A-231	ENST00000510310	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.75	■■■■■ 4.11	1e-7	■■■■□ 20.6
SEC31A-231	ENST00000510310	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		40.72	■■■■■ 4.11
SEC31A-231	ENST00000510310	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.7	■■■■■ 4.11
SEC31A-231	ENST00000510310	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.66	■■■■■ 4.1
SEC31A-231	ENST00000510310	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		40.64	■■■■■ 4.1
SEC31A-231	ENST00000510310	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	40.6	■■■■■ 4.09
SEC31A-231	ENST00000510310	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		40.55	■■■■■ 4.08
SEC31A-231	ENST00000510310	IGF1R	P08069	1367 aa		40.54	■■■■■ 4.08
SEC31A-231	ENST00000510310	CUL7	Q14999	1698 aa		40.52	■■■■■ 4.08
SEC31A-231	ENST00000510310	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.47	■■■■■ 4.07
SEC31A-231	ENST00000510310	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.45	■■■■■ 4.07
SEC31A-231	ENST00000510310	ADAMTS12	P58397	1594 aa		40.4	■■■■■ 4.06
SEC31A-231	ENST00000510310	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		40.36	■■■■■ 4.05
SEC31A-231	ENST00000510310	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		40.36	■■■■■ 4.05
SEC31A-231	ENST00000510310	PRX	Q9BXM0	1461 aa		40.32	■■■■■ 4.05
SEC31A-231	ENST00000510310	KIF21B	O75037	1637 aa		40.31	■■■■■ 4.04
SEC31A-231	ENST00000510310	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.28	■■■■■ 4.04
SEC31A-231	ENST00000510310	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		40.27	■■■■■ 4.04
SEC31A-231	ENST00000510310	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.22	■■■■■ 4.03
SEC31A-231	ENST00000510310	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.22	■■■■■ 4.03
SEC31A-231	ENST00000510310	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.22	■■■■■ 4.03
SEC31A-231	ENST00000510310	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.18	■■■■■ 4.02
SEC31A-231	ENST00000510310	FBLN2	P98095	1184 aa		40.15	■■■■■ 4.02
SEC31A-231	ENST00000510310	CHD1	O14646	1710 aa		40.15	■■■■■ 4.02
SEC31A-231	ENST00000510310	GOLGA3	Q08378	1498 aa		40.14	■■■■■ 4.02
SEC31A-231	ENST00000510310	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.14	■■■■■ 4.02

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