RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510032.5

FAM200B-215, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, humanhuman

TSL 2

Gene FAM200B, Length 639 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200B-215ENST00000510032 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.32■■■■■ 6.29
FAM200B-215ENST00000510032 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.26■■■■■ 5.32
FAM200B-215ENST00000510032 ABCC9O60706 1549 aa47.22■■■■■ 5.15
FAM200B-215ENST00000510032 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.47■■■■■ 4.87
FAM200B-215ENST00000510032 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.46■■■■■ 4.87
FAM200B-215ENST00000510032 NACADO15069 1562 aa45.42■■■■■ 4.86
FAM200B-215ENST00000510032 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.24■■■■■ 4.83
FAM200B-215ENST00000510032 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.17■■■■■ 4.82
FAM200B-215ENST00000510032 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.97■■■■■ 4.79
FAM200B-215ENST00000510032 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.24■■■■■ 4.67
FAM200B-215ENST00000510032 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.14■■■■■ 4.66
FAM200B-215ENST00000510032 SCRIBQ14160 1630 aa44.03■■■■■ 4.64
FAM200B-215ENST00000510032 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.98■■■■■ 4.63
FAM200B-215ENST00000510032 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.68■■■■■ 4.58
FAM200B-215ENST00000510032 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.25■■■■■ 4.51
FAM200B-215ENST00000510032 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.45
FAM200B-215ENST00000510032 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.68■■■■■ 4.42
FAM200B-215ENST00000510032 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.46■■■■■ 4.39
FAM200B-215ENST00000510032 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
FAM200B-215ENST00000510032 SMARCA4P51532 1647 aa42.11■■■■■ 4.33
FAM200B-215ENST00000510032 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.92■■■■■ 4.3
FAM200B-215ENST00000510032 SMARCA2P51531 1590 aa41.91■■■■■ 4.3
FAM200B-215ENST00000510032 NCAPD3P42695 1498 aa41.91■■■■■ 4.3
FAM200B-215ENST00000510032 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.83■■■■■ 4.29
FAM200B-215ENST00000510032 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.71■■■■■ 4.27
FAM200B-215ENST00000510032 HMGXB3Q12766 1538 aa41.69■■■■■ 4.27
FAM200B-215ENST00000510032 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
FAM200B-215ENST00000510032 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
FAM200B-215ENST00000510032 WIZO95785 1651 aa41.34■■■■■ 4.21
FAM200B-215ENST00000510032 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
FAM200B-215ENST00000510032 NESP48681 1621 aa40.82■■■■■ 4.13
FAM200B-215ENST00000510032 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.79■■■■■ 4.12
FAM200B-215ENST00000510032 ERCC6Q03468 1493 aa40.77■■■■■ 4.12
FAM200B-215ENST00000510032 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.71■■■■■ 4.11
FAM200B-215ENST00000510032 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.59■■■■■ 4.09
FAM200B-215ENST00000510032 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.5■■■■■ 4.07
FAM200B-215ENST00000510032 CFTRP13569 1480 aa40.45■■■■■ 4.07
FAM200B-215ENST00000510032 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
FAM200B-215ENST00000510032 CUX2O14529 1486 aa40.32■■■■■ 4.04
FAM200B-215ENST00000510032 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.3■■■■■ 4.04
FAM200B-215ENST00000510032 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.23■■■■■ 4.03
FAM200B-215ENST00000510032 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.19■■■■■ 4.03
FAM200B-215ENST00000510032 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
FAM200B-215ENST00000510032 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.12■■■■■ 4.01
FAM200B-215ENST00000510032 PRDM2Q13029 1718 aa40.04■■■■■ 4
FAM200B-215ENST00000510032 WDR62O43379 1518 aa39.95■■■■□ 3.99
FAM200B-215ENST00000510032 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
FAM200B-215ENST00000510032 ABCC8Q09428 1581 aa39.64■■■■□ 3.94
FAM200B-215ENST00000510032 TOPBP1Q92547 1522 aa39.56■■■■□ 3.92
FAM200B-215ENST00000510032 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.53■■■■□ 3.92
FAM200B-215ENST00000510032 IFT140Q96RY7 1462 aa39.36■■■■□ 3.89
FAM200B-215ENST00000510032 CUX1P39880 1505 aa39.24■■■■□ 3.87
FAM200B-215ENST00000510032 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
FAM200B-215ENST00000510032 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.14■■■■□ 3.86
FAM200B-215ENST00000510032 SOGA1O94964 1423 aa39.12■■■■□ 3.85
FAM200B-215ENST00000510032 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.1■■■■□ 3.85
FAM200B-215ENST00000510032 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.08■■■■□ 3.85
FAM200B-215ENST00000510032 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.07■■■■□ 3.85
FAM200B-215ENST00000510032 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.04■■■■□ 3.84
FAM200B-215ENST00000510032 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.04■■■■□ 3.84
FAM200B-215ENST00000510032 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
FAM200B-215ENST00000510032 TOP2BQ02880 1626 aa38.93■■■■□ 3.82
FAM200B-215ENST00000510032 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.92■■■■□ 3.82
FAM200B-215ENST00000510032 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.89■■■■□ 3.82
FAM200B-215ENST00000510032 SYNJ1O43426 1573 aa38.89■■■■□ 3.82
FAM200B-215ENST00000510032 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.87■■■■□ 3.81
FAM200B-215ENST00000510032 WDR97A6NE52 1622 aa38.86■■■■□ 3.81
FAM200B-215ENST00000510032 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.79■■■■□ 3.8
FAM200B-215ENST00000510032 OSCARQ8IYS5 282 aa38.69■■■■□ 3.78
FAM200B-215ENST00000510032 GRIN2BQ13224 1484 aa38.66■■■■□ 3.78
FAM200B-215ENST00000510032 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.65■■■■□ 3.78
FAM200B-215ENST00000510032 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.57■■■■□ 3.77
FAM200B-215ENST00000510032 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.57■■■■□ 3.76
FAM200B-215ENST00000510032 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.55■■■■□ 3.76
FAM200B-215ENST00000510032 FBLN2P98095 1184 aa38.53■■■■□ 3.76
FAM200B-215ENST00000510032 PBRM1Q86U86 1689 aa38.47■■■■□ 3.75
FAM200B-215ENST00000510032 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.44■■■■□ 3.74
FAM200B-215ENST00000510032 CHD1O14646 1710 aa38.4■■■■□ 3.74
FAM200B-215ENST00000510032 SYNJ2O15056 1496 aa38.4■■■■□ 3.74
FAM200B-215ENST00000510032 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.33■■■■□ 3.73
FAM200B-215ENST00000510032 KIF27Q86VH2 1401 aa38.29■■■■□ 3.72
FAM200B-215ENST00000510032 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.23■■■■□ 3.71
FAM200B-215ENST00000510032 TRIM41Q8WV44 630 aa38.22■■■■□ 3.71
FAM200B-215ENST00000510032 ADAMTS12P58397 1594 aa38.22■■■■□ 3.71
FAM200B-215ENST00000510032 GRIN2AQ12879 1464 aa38.13■■■■□ 3.69
FAM200B-215ENST00000510032 IGF1RP08069 1367 aa38.08■■■■□ 3.69
FAM200B-215ENST00000510032 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.04■■■■□ 3.68
FAM200B-215ENST00000510032 ARHGEF11O15085 1522 aa37.97■■■■□ 3.67
FAM200B-215ENST00000510032 CUL7Q14999 1698 aa37.97■■■■□ 3.67
FAM200B-215ENST00000510032 NUP160Q12769 1436 aa37.95■■■■□ 3.67
FAM200B-215ENST00000510032 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.94■■■■□ 3.66
FAM200B-215ENST00000510032 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.94■■■■□ 3.66
FAM200B-215ENST00000510032 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.94■■■■□ 3.66
FAM200B-215ENST00000510032 CEP170Q5SW79 1584 aa37.89■■■■□ 3.66
FAM200B-215ENST00000510032 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.88■■■■□ 3.65
FAM200B-215ENST00000510032 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.82■■■■□ 3.64
FAM200B-215ENST00000510032 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.7■■■■□ 3.63
FAM200B-215ENST00000510032 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.68■■■■□ 3.62
FAM200B-215ENST00000510032 ARAP1Q96P48 1450 aa37.66■■■■□ 3.62
FAM200B-215ENST00000510032 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.66■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms