RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508598.5

SPATA20-215, Transcript of spermatogenesis associated 20, human

TSL 4

Gene SPATA20, Length 570 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPATA20-215	ENST00000508598	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		45.01	■■■■■ 4.8
SPATA20-215	ENST00000508598	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		40.09	■■■■■ 4.01
SPATA20-215	ENST00000508598	ABCC9	O60706	1549 aa		39.39	■■■■□ 3.9
SPATA20-215	ENST00000508598	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37.74	■■■■□ 3.63
SPATA20-215	ENST00000508598	NACAD	O15069	1562 aa		37.71	■■■■□ 3.63
SPATA20-215	ENST00000508598	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.52	■■■■□ 3.6
SPATA20-215	ENST00000508598	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.5	■■■■□ 3.59
SPATA20-215	ENST00000508598	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	37.47	■■■■□ 3.59
SPATA20-215	ENST00000508598	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		37.31	■■■■□ 3.56
SPATA20-215	ENST00000508598	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		37.07	■■■■□ 3.52
SPATA20-215	ENST00000508598	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.85	■■■■□ 3.49
SPATA20-215	ENST00000508598	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	36.66	■■■■□ 3.46
SPATA20-215	ENST00000508598	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.57	■■■■□ 3.44
SPATA20-215	ENST00000508598	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.45	■■■■□ 3.42
SPATA20-215	ENST00000508598	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.3	■■■■□ 3.4
SPATA20-215	ENST00000508598	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	35.61	■■■■□ 3.29
SPATA20-215	ENST00000508598	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.54	■■■■□ 3.28
SPATA20-215	ENST00000508598	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.42	■■■■□ 3.26
SPATA20-215	ENST00000508598	SMARCA4	P51532	1647 aa		34.92	■■■■□ 3.18
SPATA20-215	ENST00000508598	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	34.9	■■■■□ 3.18
SPATA20-215	ENST00000508598	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.79	■■■■□ 3.16
SPATA20-215	ENST00000508598	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.76	■■■■□ 3.15
SPATA20-215	ENST00000508598	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.74	■■■■□ 3.15
SPATA20-215	ENST00000508598	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.65	■■■■□ 3.14
SPATA20-215	ENST00000508598	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		34.63	■■■■□ 3.13
SPATA20-215	ENST00000508598	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.6	■■■■□ 3.13
SPATA20-215	ENST00000508598	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.46	■■■■□ 3.11
SPATA20-215	ENST00000508598	WIZ	O95785	1651 aa		34.25	■■■■□ 3.07
SPATA20-215	ENST00000508598	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	34.23	■■■■□ 3.07
SPATA20-215	ENST00000508598	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		33.95	■■■■□ 3.03
SPATA20-215	ENST00000508598	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	33.94	■■■■□ 3.02
SPATA20-215	ENST00000508598	ERCC6	Q03468	1493 aa		33.93	■■■■□ 3.02
SPATA20-215	ENST00000508598	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.88	■■■■□ 3.01
SPATA20-215	ENST00000508598	NES	P48681	1621 aa		33.86	■■■■□ 3.01
SPATA20-215	ENST00000508598	CUX2	O14529	1486 aa		33.83	■■■■□ 3.01
SPATA20-215	ENST00000508598	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.75	■■■□□ 2.99
SPATA20-215	ENST00000508598	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.64	■■■□□ 2.98
SPATA20-215	ENST00000508598	CFTR	P13569	1480 aa		33.54	■■■□□ 2.96
SPATA20-215	ENST00000508598	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		33.51	■■■□□ 2.96
SPATA20-215	ENST00000508598	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.5	■■■□□ 2.95
SPATA20-215	ENST00000508598	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95
SPATA20-215	ENST00000508598	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SPATA20-215	ENST00000508598	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.3	■■■□□ 2.92
SPATA20-215	ENST00000508598	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.3	■■■□□ 2.92
SPATA20-215	ENST00000508598	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SPATA20-215	ENST00000508598	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
SPATA20-215	ENST00000508598	WDR62	O43379	1518 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SPATA20-215	ENST00000508598	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
SPATA20-215	ENST00000508598	ABCC8	Q09428	1581 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SPATA20-215	ENST00000508598	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SPATA20-215	ENST00000508598	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.76	■■■□□ 2.84
SPATA20-215	ENST00000508598	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SPATA20-215	ENST00000508598	TRIM41	Q8WV44	630 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SPATA20-215	ENST00000508598	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
SPATA20-215	ENST00000508598	CUX1	P39880	1505 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SPATA20-215	ENST00000508598	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
SPATA20-215	ENST00000508598	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
SPATA20-215	ENST00000508598	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SPATA20-215	ENST00000508598	SOGA1	O94964	1423 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SPATA20-215	ENST00000508598	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SPATA20-215	ENST00000508598	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
SPATA20-215	ENST00000508598	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	32.28	■■■□□ 2.76
SPATA20-215	ENST00000508598	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SPATA20-215	ENST00000508598	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SPATA20-215	ENST00000508598	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SPATA20-215	ENST00000508598	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.24	■■■□□ 2.75
SPATA20-215	ENST00000508598	TOP2B	Q02880	1626 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SPATA20-215	ENST00000508598	SYNJ1	O43426	1573 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SPATA20-215	ENST00000508598	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
SPATA20-215	ENST00000508598	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.14	■■■□□ 2.74
SPATA20-215	ENST00000508598	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SPATA20-215	ENST00000508598	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32	■■■□□ 2.71
SPATA20-215	ENST00000508598	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32	■■■□□ 2.71
SPATA20-215	ENST00000508598	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SPATA20-215	ENST00000508598	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SPATA20-215	ENST00000508598	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SPATA20-215	ENST00000508598	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
SPATA20-215	ENST00000508598	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.95	■■■□□ 2.7
SPATA20-215	ENST00000508598	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SPATA20-215	ENST00000508598	CHD1	O14646	1710 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SPATA20-215	ENST00000508598	ARHGEF11	O15085	1522 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SPATA20-215	ENST00000508598	FBLN2	P98095	1184 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SPATA20-215	ENST00000508598	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SPATA20-215	ENST00000508598	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
SPATA20-215	ENST00000508598	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		31.76	■■■□□ 2.68
SPATA20-215	ENST00000508598	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SPATA20-215	ENST00000508598	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SPATA20-215	ENST00000508598	KIF27	Q86VH2	1401 aa		31.64	■■■□□ 2.66
SPATA20-215	ENST00000508598	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		31.6	■■■□□ 2.65
SPATA20-215	ENST00000508598	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.6	■■■□□ 2.65
SPATA20-215	ENST00000508598	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		31.6	■■■□□ 2.65
SPATA20-215	ENST00000508598	ARAP1	Q96P48	1450 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SPATA20-215	ENST00000508598	IGF1R	P08069	1367 aa		31.51	■■■□□ 2.63
SPATA20-215	ENST00000508598	NUP160	Q12769	1436 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SPATA20-215	ENST00000508598	CUL7	Q14999	1698 aa		31.45	■■■□□ 2.63
SPATA20-215	ENST00000508598	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.43	■■■□□ 2.62
SPATA20-215	ENST00000508598	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		31.31	■■■□□ 2.6
SPATA20-215	ENST00000508598	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	31.26	■■■□□ 2.59
SPATA20-215	ENST00000508598	SHROOM2	Q13796	1616 aa		31.26	■■■□□ 2.59
SPATA20-215	ENST00000508598	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		31.24	■■■□□ 2.59

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