RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504806.5

ANKRD33B-202, Transcript of ankyrin repeat domain 33B, humanhuman

TSL 5

Gene ANKRD33B, Length 1,591 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD33B-202ENST00000504806 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.34■■■■■ 7.25
ANKRD33B-202ENST00000504806 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.05■■■■■ 6.08
ANKRD33B-202ENST00000504806 ABCC9O60706 1549 aa50.75■■■■■ 5.72
ANKRD33B-202ENST00000504806 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.54■■■■■ 5.68
ANKRD33B-202ENST00000504806 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.98■■■■■ 5.59
ANKRD33B-202ENST00000504806 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.96■■■■■ 5.59
ANKRD33B-202ENST00000504806 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.69■■■■■ 5.54
ANKRD33B-202ENST00000504806 NACADO15069 1562 aa49.59■■■■■ 5.53
ANKRD33B-202ENST00000504806 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.35■■■■■ 5.49
ANKRD33B-202ENST00000504806 SCRIBQ14160 1630 aa48.58■■■■■ 5.37
ANKRD33B-202ENST00000504806 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.55■■■■■ 5.36
ANKRD33B-202ENST00000504806 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.2■■■■■ 5.31
ANKRD33B-202ENST00000504806 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.78■■■■■ 5.24
ANKRD33B-202ENST00000504806 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.66■■■■■ 5.22
ANKRD33B-202ENST00000504806 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.87■■■■■ 5.09
ANKRD33B-202ENST00000504806 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.69■■■■■ 5.07
ANKRD33B-202ENST00000504806 SMARCA4P51532 1647 aa46.55■■■■■ 5.04
ANKRD33B-202ENST00000504806 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.53■■■■■ 5.04
ANKRD33B-202ENST00000504806 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.47■■■■■ 5.03
ANKRD33B-202ENST00000504806 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.45■■■■■ 5.03
ANKRD33B-202ENST00000504806 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.33■■■■■ 5.01
ANKRD33B-202ENST00000504806 WIZO95785 1651 aa46.1■■■■■ 4.97
ANKRD33B-202ENST00000504806 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.05■■■■■ 4.96
ANKRD33B-202ENST00000504806 SMARCA2P51531 1590 aa45.99■■■■■ 4.95
ANKRD33B-202ENST00000504806 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.97■■■■■ 4.95
ANKRD33B-202ENST00000504806 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.94■■■■■ 4.94
ANKRD33B-202ENST00000504806 NCAPD3P42695 1498 aa45.74■■■■■ 4.91
ANKRD33B-202ENST00000504806 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.7■■■■■ 4.91
ANKRD33B-202ENST00000504806 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.7■■■■■ 4.91
ANKRD33B-202ENST00000504806 HMGXB3Q12766 1538 aa45.64■■■■■ 4.9
ANKRD33B-202ENST00000504806 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.37■■■■■ 4.85
ANKRD33B-202ENST00000504806 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.16■■■■■ 4.82
ANKRD33B-202ENST00000504806 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.5■■■■■ 4.71
ANKRD33B-202ENST00000504806 CFTRP13569 1480 aa44.5■■■■■ 4.71
ANKRD33B-202ENST00000504806 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.34■■■■■ 4.69
ANKRD33B-202ENST00000504806 NESP48681 1621 aa44.28■■■■■ 4.68
ANKRD33B-202ENST00000504806 PRDM2Q13029 1718 aa44.24■■■■■ 4.67
ANKRD33B-202ENST00000504806 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.02■■■■■ 4.64
ANKRD33B-202ENST00000504806 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.01■■■■■ 4.64
ANKRD33B-202ENST00000504806 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.96■■■■■ 4.63
ANKRD33B-202ENST00000504806 ABCC8Q09428 1581 aa43.91■■■■■ 4.62
ANKRD33B-202ENST00000504806 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.83■■■■■ 4.61
ANKRD33B-202ENST00000504806 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.81■■■■■ 4.6
ANKRD33B-202ENST00000504806 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.78■■■■■ 4.6
ANKRD33B-202ENST00000504806 TRIM41Q8WV44 630 aa43.68■■■■■ 4.58
ANKRD33B-202ENST00000504806 ERCC6Q03468 1493 aa43.67■■■■■ 4.58
ANKRD33B-202ENST00000504806 SYNJ1O43426 1573 aa43.62■■■■■ 4.57
ANKRD33B-202ENST00000504806 CUX1P39880 1505 aa43.59■■■■■ 4.57
ANKRD33B-202ENST00000504806 TOP2BQ02880 1626 aa43.55■■■■■ 4.56
ANKRD33B-202ENST00000504806 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.52■■■■■ 4.56
ANKRD33B-202ENST00000504806 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.49■■■■■ 4.55
ANKRD33B-202ENST00000504806 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.49■■■■■ 4.55
ANKRD33B-202ENST00000504806 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.47■■■■■ 4.55
ANKRD33B-202ENST00000504806 TOPBP1Q92547 1522 aa43.44■■■■■ 4.54
ANKRD33B-202ENST00000504806 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
ANKRD33B-202ENST00000504806 WDR62O43379 1518 aa43.29■■■■■ 4.52
ANKRD33B-202ENST00000504806 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.25■■■■■ 4.51
ANKRD33B-202ENST00000504806 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.16■■■■■ 4.5
ANKRD33B-202ENST00000504806 SOGA1O94964 1423 aa43.01■■■■■ 4.48
ANKRD33B-202ENST00000504806 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.97■■■■■ 4.47
ANKRD33B-202ENST00000504806 CUX2O14529 1486 aa42.92■■■■■ 4.46
ANKRD33B-202ENST00000504806 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.88■■■■■ 4.46
ANKRD33B-202ENST00000504806 IFT140Q96RY7 1462 aa42.85■■■■■ 4.45
ANKRD33B-202ENST00000504806 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.84■■■■■ 4.45
ANKRD33B-202ENST00000504806 EEA1Q15075 1411 aa42.83■■■■■ 4.45
ANKRD33B-202ENST00000504806 KIF27Q86VH2 1401 aa42.79■■■■■ 4.44
ANKRD33B-202ENST00000504806 WDR97A6NE52 1622 aa42.79■■■■■ 4.44
ANKRD33B-202ENST00000504806 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.78■■■■■ 4.44
ANKRD33B-202ENST00000504806 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.78■■■■■ 4.44
ANKRD33B-202ENST00000504806 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
ANKRD33B-202ENST00000504806 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.59■■■■■ 4.41
ANKRD33B-202ENST00000504806 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.57■■■■■ 4.41
ANKRD33B-202ENST00000504806 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
ANKRD33B-202ENST00000504806 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.54■■■■■ 4.4
ANKRD33B-202ENST00000504806 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.48■■■■■ 4.39
ANKRD33B-202ENST00000504806 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.45■■■■■ 4.39
ANKRD33B-202ENST00000504806 IGF1RP08069 1367 aa42.43■■■■■ 4.38
ANKRD33B-202ENST00000504806 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.39■■■■■ 4.38
ANKRD33B-202ENST00000504806 GRIN2BQ13224 1484 aa42.35■■■■■ 4.37
ANKRD33B-202ENST00000504806 PBRM1Q86U86 1689 aa42.35■■■■■ 4.37
ANKRD33B-202ENST00000504806 PRXQ9BXM0 1461 aa42.27■■■■■ 4.36
ANKRD33B-202ENST00000504806 KIF21BO75037 1637 aa42.27■■■■■ 4.36
ANKRD33B-202ENST00000504806 CUL7Q14999 1698 aa42.26■■■■■ 4.36
ANKRD33B-202ENST00000504806 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.22■■■■■ 4.35
ANKRD33B-202ENST00000504806 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.17■■■■■ 4.34
ANKRD33B-202ENST00000504806 GOLGA3Q08378 1498 aa42.16■■■■■ 4.34
ANKRD33B-202ENST00000504806 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.16■■■■■ 4.34
ANKRD33B-202ENST00000504806 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.14■■■■■ 4.34
ANKRD33B-202ENST00000504806 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.13■■■■■ 4.33
ANKRD33B-202ENST00000504806 ADAMTS12P58397 1594 aa42.1■■■■■ 4.33
ANKRD33B-202ENST00000504806 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.1■■■■■ 4.33
ANKRD33B-202ENST00000504806 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.09■■■■■ 4.33
ANKRD33B-202ENST00000504806 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
ANKRD33B-202ENST00000504806 SYNJ2O15056 1496 aa41.92■■■■■ 4.3
ANKRD33B-202ENST00000504806 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.85■■■■■ 4.29
ANKRD33B-202ENST00000504806 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
ANKRD33B-202ENST00000504806 GRIN2AQ12879 1464 aa41.81■■■■■ 4.28
ANKRD33B-202ENST00000504806 FBLN2P98095 1184 aa41.77■■■■■ 4.28
ANKRD33B-202ENST00000504806 CHD1O14646 1710 aa41.64■■■■■ 4.26
ANKRD33B-202ENST00000504806 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.63■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms