RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498406.1

THAP7-208, Transcript of THAP domain containing 7, human

TSL 2

Gene THAP7, Length 1,957 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
THAP7-208	ENST00000498406	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		45.46	■■■■■ 4.87
THAP7-208	ENST00000498406	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		39.63	■■■■□ 3.93
THAP7-208	ENST00000498406	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	38.16	■■■■□ 3.7
THAP7-208	ENST00000498406	ABCC9	O60706	1549 aa		37.71	■■■■□ 3.63
THAP7-208	ENST00000498406	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.69	■■■■□ 3.62
THAP7-208	ENST00000498406	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		37.51	■■■■□ 3.6
THAP7-208	ENST00000498406	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		37.14	■■■■□ 3.54
THAP7-208	ENST00000498406	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.1	■■■■□ 3.53
THAP7-208	ENST00000498406	NACAD	O15069	1562 aa		36.95	■■■■□ 3.51
THAP7-208	ENST00000498406	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		36.68	■■■■□ 3.46
THAP7-208	ENST00000498406	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.55	■■■■□ 3.44
THAP7-208	ENST00000498406	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		35.97	■■■■□ 3.35
THAP7-208	ENST00000498406	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	35.66	■■■■□ 3.3
THAP7-208	ENST00000498406	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		35.61	■■■■□ 3.29
THAP7-208	ENST00000498406	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	35.57	■■■■□ 3.28
THAP7-208	ENST00000498406	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.39	■■■■□ 3.26
THAP7-208	ENST00000498406	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	35.25	■■■■□ 3.23
THAP7-208	ENST00000498406	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		35.16	■■■■□ 3.22
THAP7-208	ENST00000498406	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	35.09	■■■■□ 3.21
THAP7-208	ENST00000498406	SMARCA4	P51532	1647 aa		34.98	■■■■□ 3.19
THAP7-208	ENST00000498406	WIZ	O95785	1651 aa		34.87	■■■■□ 3.17
THAP7-208	ENST00000498406	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	34.55	■■■■□ 3.12
THAP7-208	ENST00000498406	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.51	■■■■□ 3.11
THAP7-208	ENST00000498406	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	34.46	■■■■□ 3.11
THAP7-208	ENST00000498406	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.43	■■■■□ 3.1
THAP7-208	ENST00000498406	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.38	■■■■□ 3.09
THAP7-208	ENST00000498406	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.24	■■■■□ 3.07
THAP7-208	ENST00000498406	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		34.14	■■■■□ 3.05
THAP7-208	ENST00000498406	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.12	■■■■□ 3.05
THAP7-208	ENST00000498406	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		34.08	■■■■□ 3.05
THAP7-208	ENST00000498406	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.06	■■■■□ 3.04
THAP7-208	ENST00000498406	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		34.02	■■■■□ 3.04
THAP7-208	ENST00000498406	TRIM41	Q8WV44	630 aa		33.49	■■■□□ 2.95
THAP7-208	ENST00000498406	ABCC8	Q09428	1581 aa		33.43	■■■□□ 2.94
THAP7-208	ENST00000498406	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.38	■■■□□ 2.93
THAP7-208	ENST00000498406	CFTR	P13569	1480 aa		33.35	■■■□□ 2.93
THAP7-208	ENST00000498406	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.27	■■■□□ 2.92
THAP7-208	ENST00000498406	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	33.18	■■■□□ 2.9
THAP7-208	ENST00000498406	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.13	■■■□□ 2.89
THAP7-208	ENST00000498406	NES	P48681	1621 aa		33.08	■■■□□ 2.89
THAP7-208	ENST00000498406	SYNJ1	O43426	1573 aa		33.07	■■■□□ 2.88
THAP7-208	ENST00000498406	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		32.98	■■■□□ 2.87
THAP7-208	ENST00000498406	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
THAP7-208	ENST00000498406	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		32.92	■■■□□ 2.86
THAP7-208	ENST00000498406	TOP2B	Q02880	1626 aa		32.9	■■■□□ 2.86
THAP7-208	ENST00000498406	CUX1	P39880	1505 aa		32.87	■■■□□ 2.85
THAP7-208	ENST00000498406	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		32.85	■■■□□ 2.85
THAP7-208	ENST00000498406	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.78	■■■□□ 2.84
THAP7-208	ENST00000498406	SOGA1	O94964	1423 aa		32.77	■■■□□ 2.84
THAP7-208	ENST00000498406	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		32.74	■■■□□ 2.83
THAP7-208	ENST00000498406	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		32.71	■■■□□ 2.83
THAP7-208	ENST00000498406	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		32.67	■■■□□ 2.82
THAP7-208	ENST00000498406	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		32.63	■■■□□ 2.81
THAP7-208	ENST00000498406	EEA1	Q15075	1411 aa		32.58	■■■□□ 2.81
THAP7-208	ENST00000498406	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.57	■■■□□ 2.81
THAP7-208	ENST00000498406	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.55	■■■□□ 2.8
THAP7-208	ENST00000498406	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.55	■■■□□ 2.8
THAP7-208	ENST00000498406	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.53	■■■□□ 2.8
THAP7-208	ENST00000498406	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
THAP7-208	ENST00000498406	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.48	■■■□□ 2.79
THAP7-208	ENST00000498406	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
THAP7-208	ENST00000498406	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		32.34	■■■□□ 2.77
THAP7-208	ENST00000498406	KIF27	Q86VH2	1401 aa		32.33	■■■□□ 2.77
THAP7-208	ENST00000498406	ERCC6	Q03468	1493 aa		32.32	■■■□□ 2.76
THAP7-208	ENST00000498406	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.32	■■■□□ 2.76
THAP7-208	ENST00000498406	CUX2	O14529	1486 aa		32.31	■■■□□ 2.76
THAP7-208	ENST00000498406	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.21	■■■□□ 2.75
THAP7-208	ENST00000498406	KIF21B	O75037	1637 aa		32.19	■■■□□ 2.74
THAP7-208	ENST00000498406	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.18	■■■□□ 2.74
THAP7-208	ENST00000498406	WDR62	O43379	1518 aa		32.17	■■■□□ 2.74
THAP7-208	ENST00000498406	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
THAP7-208	ENST00000498406	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.11	■■■□□ 2.73
THAP7-208	ENST00000498406	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		32.1	■■■□□ 2.73
THAP7-208	ENST00000498406	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
THAP7-208	ENST00000498406	PRX	Q9BXM0	1461 aa		32.09	■■■□□ 2.73
THAP7-208	ENST00000498406	IGF1R	P08069	1367 aa		32.07	■■■□□ 2.72
THAP7-208	ENST00000498406	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
THAP7-208	ENST00000498406	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.04	■■■□□ 2.72
THAP7-208	ENST00000498406	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.72
THAP7-208	ENST00000498406	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		31.99	■■■□□ 2.71
THAP7-208	ENST00000498406	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		31.96	■■■□□ 2.71
THAP7-208	ENST00000498406	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		31.91	■■■□□ 2.7
THAP7-208	ENST00000498406	IFT140	Q96RY7	1462 aa		31.91	■■■□□ 2.7
THAP7-208	ENST00000498406	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		31.91	■■■□□ 2.7
THAP7-208	ENST00000498406	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.91	■■■□□ 2.7
THAP7-208	ENST00000498406	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	31.83	■■■□□ 2.69	4e-9	■■■■■ 36.3
THAP7-208	ENST00000498406	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
THAP7-208	ENST00000498406	CUL7	Q14999	1698 aa		31.79	■■■□□ 2.68
THAP7-208	ENST00000498406	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.73	■■■□□ 2.67
THAP7-208	ENST00000498406	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
THAP7-208	ENST00000498406	CLIP1	P30622	1438 aa		31.68	■■■□□ 2.66
THAP7-208	ENST00000498406	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
THAP7-208	ENST00000498406	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.67	■■■□□ 2.66
THAP7-208	ENST00000498406	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.56	■■■□□ 2.64
THAP7-208	ENST00000498406	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.55	■■■□□ 2.64
THAP7-208	ENST00000498406	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.51	■■■□□ 2.64
THAP7-208	ENST00000498406	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		31.44	■■■□□ 2.62
THAP7-208	ENST00000498406	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
THAP7-208	ENST00000498406	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		31.4	■■■□□ 2.62
THAP7-208	ENST00000498406	ARAP1	Q96P48	1450 aa		31.39	■■■□□ 2.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125 ms