RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496567.5

C9orf3-222, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 1,575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-222ENST00000496567 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.47■■■■■ 5.83
C9orf3-222ENST00000496567 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.46■■■■■ 4.87
C9orf3-222ENST00000496567 ABCC9O60706 1549 aa43.8■■■■■ 4.6
C9orf3-222ENST00000496567 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
C9orf3-222ENST00000496567 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.77■■■■■ 4.44
C9orf3-222ENST00000496567 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.64■■■■■ 4.42
C9orf3-222ENST00000496567 NACADO15069 1562 aa42.59■■■■■ 4.41
C9orf3-222ENST00000496567 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.57■■■■■ 4.41
C9orf3-222ENST00000496567 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.47■■■■■ 4.39
C9orf3-222ENST00000496567 SCRIBQ14160 1630 aa41.52■■■■■ 4.24
C9orf3-222ENST00000496567 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.46■■■■■ 4.23
C9orf3-222ENST00000496567 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.1■■■■■ 4.17
C9orf3-222ENST00000496567 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.08■■■■■ 4.17
C9orf3-222ENST00000496567 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.05■■■■■ 4.16
C9orf3-222ENST00000496567 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.99■■■■□ 3.99
C9orf3-222ENST00000496567 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
C9orf3-222ENST00000496567 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
C9orf3-222ENST00000496567 SMARCA4P51532 1647 aa39.79■■■■□ 3.96
C9orf3-222ENST00000496567 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.66■■■■□ 3.94
C9orf3-222ENST00000496567 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.65■■■■□ 3.94
C9orf3-222ENST00000496567 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.53■■■■□ 3.92
C9orf3-222ENST00000496567 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.47■■■■□ 3.91
C9orf3-222ENST00000496567 SMARCA2P51531 1590 aa39.41■■■■□ 3.9
C9orf3-222ENST00000496567 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.4■■■■□ 3.9
C9orf3-222ENST00000496567 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.4■■■■□ 3.9
C9orf3-222ENST00000496567 NCAPD3P42695 1498 aa39.28■■■■□ 3.88
C9orf3-222ENST00000496567 WIZO95785 1651 aa39.27■■■■□ 3.88
C9orf3-222ENST00000496567 HMGXB3Q12766 1538 aa39.15■■■■□ 3.86
C9orf3-222ENST00000496567 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
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C9orf3-222ENST00000496567 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.92■■■■□ 3.82
C9orf3-222ENST00000496567 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.46■■■■□ 3.75
C9orf3-222ENST00000496567 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.19■■■■□ 3.7
C9orf3-222ENST00000496567 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.15■■■■□ 3.7
C9orf3-222ENST00000496567 CFTRP13569 1480 aa38.09■■■■□ 3.69
C9orf3-222ENST00000496567 NESP48681 1621 aa38.09■■■■□ 3.69
C9orf3-222ENST00000496567 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.89■■■■□ 3.66
C9orf3-222ENST00000496567 PRDM2Q13029 1718 aa37.86■■■■□ 3.65
C9orf3-222ENST00000496567 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.74■■■■□ 3.63
C9orf3-222ENST00000496567 ERCC6Q03468 1493 aa37.73■■■■□ 3.63
C9orf3-222ENST00000496567 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.67■■■■□ 3.62
C9orf3-222ENST00000496567 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.63■■■■□ 3.61
C9orf3-222ENST00000496567 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.42■■■■□ 3.58
C9orf3-222ENST00000496567 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
C9orf3-222ENST00000496567 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
C9orf3-222ENST00000496567 ABCC8Q09428 1581 aa37.29■■■■□ 3.56
C9orf3-222ENST00000496567 WDR62O43379 1518 aa37.27■■■■□ 3.56
C9orf3-222ENST00000496567 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.23■■■■□ 3.55
C9orf3-222ENST00000496567 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.23■■■■□ 3.55
C9orf3-222ENST00000496567 TOPBP1Q92547 1522 aa37.2■■■■□ 3.55
C9orf3-222ENST00000496567 CUX1P39880 1505 aa37.17■■■■□ 3.54
C9orf3-222ENST00000496567 CUX2O14529 1486 aa37.07■■■■□ 3.53
C9orf3-222ENST00000496567 SYNJ1O43426 1573 aa37.06■■■■□ 3.52
C9orf3-222ENST00000496567 TOP2BQ02880 1626 aa37.06■■■■□ 3.52
C9orf3-222ENST00000496567 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.04■■■■□ 3.52
C9orf3-222ENST00000496567 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.95■■■■□ 3.51
C9orf3-222ENST00000496567 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
C9orf3-222ENST00000496567 TRIM41Q8WV44 630 aa36.87■■■■□ 3.49
C9orf3-222ENST00000496567 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.83■■■■□ 3.49
C9orf3-222ENST00000496567 SOGA1O94964 1423 aa36.82■■■■□ 3.49
C9orf3-222ENST00000496567 IFT140Q96RY7 1462 aa36.81■■■■□ 3.48
C9orf3-222ENST00000496567 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.76■■■■□ 3.47
C9orf3-222ENST00000496567 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
C9orf3-222ENST00000496567 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.64■■■■□ 3.46
C9orf3-222ENST00000496567 WDR97A6NE52 1622 aa36.59■■■■□ 3.45
C9orf3-222ENST00000496567 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
C9orf3-222ENST00000496567 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
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C9orf3-222ENST00000496567 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
C9orf3-222ENST00000496567 KIF27Q86VH2 1401 aa36.41■■■■□ 3.42
C9orf3-222ENST00000496567 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.41■■■■□ 3.42
C9orf3-222ENST00000496567 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.4■■■■□ 3.42
C9orf3-222ENST00000496567 GRIN2BQ13224 1484 aa36.3■■■■□ 3.4
C9orf3-222ENST00000496567 PBRM1Q86U86 1689 aa36.26■■■■□ 3.39
C9orf3-222ENST00000496567 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.23■■■■□ 3.39
C9orf3-222ENST00000496567 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.22■■■■□ 3.39
C9orf3-222ENST00000496567 EEA1Q15075 1411 aa36.2■■■■□ 3.39
C9orf3-222ENST00000496567 IGF1RP08069 1367 aa36.15■■■■□ 3.38
C9orf3-222ENST00000496567 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
C9orf3-222ENST00000496567 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.14■■■■□ 3.38
C9orf3-222ENST00000496567 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
C9orf3-222ENST00000496567 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.03■■■■□ 3.36
C9orf3-222ENST00000496567 CUL7Q14999 1698 aa36.03■■■■□ 3.36
C9orf3-222ENST00000496567 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.01■■■■□ 3.36
C9orf3-222ENST00000496567 ADAMTS12P58397 1594 aa36.01■■■■□ 3.36
C9orf3-222ENST00000496567 SYNJ2O15056 1496 aa35.98■■■■□ 3.35
C9orf3-222ENST00000496567 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.97■■■■□ 3.35
C9orf3-222ENST00000496567 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
C9orf3-222ENST00000496567 FBLN2P98095 1184 aa35.92■■■■□ 3.34
C9orf3-222ENST00000496567 PRXQ9BXM0 1461 aa35.86■■■■□ 3.33
C9orf3-222ENST00000496567 CHD1O14646 1710 aa35.85■■■■□ 3.33
C9orf3-222ENST00000496567 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.83■■■■□ 3.33
C9orf3-222ENST00000496567 GRIN2AQ12879 1464 aa35.83■■■■□ 3.33
C9orf3-222ENST00000496567 KIF21BO75037 1637 aa35.73■■■■□ 3.31
C9orf3-222ENST00000496567 OSCARQ8IYS5 282 aa35.69■■■■□ 3.3
C9orf3-222ENST00000496567 NUP160Q12769 1436 aa35.64■■■■□ 3.3
C9orf3-222ENST00000496567 CEP170Q5SW79 1584 aa35.6■■■■□ 3.29
C9orf3-222ENST00000496567 GOLGA3Q08378 1498 aa35.59■■■■□ 3.29
C9orf3-222ENST00000496567 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.51■■■■□ 3.27
C9orf3-222ENST00000496567 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.49■■■■□ 3.27
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