RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495220.5

ARRDC1-211, Transcript of arrestin domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARRDC1, Length 747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-211ENST00000495220 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.21■■■■■ 5.31
ARRDC1-211ENST00000495220 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.64■■■■■ 4.42
ARRDC1-211ENST00000495220 ABCC9O60706 1549 aa41.78■■■■■ 4.28
ARRDC1-211ENST00000495220 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.03
ARRDC1-211ENST00000495220 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.02■■■■■ 4
ARRDC1-211ENST00000495220 NACADO15069 1562 aa39.99■■■■□ 3.99
ARRDC1-211ENST00000495220 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.97■■■■□ 3.99
ARRDC1-211ENST00000495220 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.97■■■■□ 3.99
ARRDC1-211ENST00000495220 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.89■■■■□ 3.98
ARRDC1-211ENST00000495220 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.17■■■■□ 3.86
ARRDC1-211ENST00000495220 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.96■■■■□ 3.83
ARRDC1-211ENST00000495220 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.92■■■■□ 3.82
ARRDC1-211ENST00000495220 SCRIBQ14160 1630 aa38.86■■■■□ 3.81
ARRDC1-211ENST00000495220 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.63■■■■□ 3.77
ARRDC1-211ENST00000495220 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.36■■■■□ 3.73
ARRDC1-211ENST00000495220 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.74■■■■□ 3.63
ARRDC1-211ENST00000495220 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
ARRDC1-211ENST00000495220 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.67■■■■□ 3.62
ARRDC1-211ENST00000495220 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
ARRDC1-211ENST00000495220 SMARCA4P51532 1647 aa37.27■■■■□ 3.56
ARRDC1-211ENST00000495220 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.12■■■■□ 3.53
ARRDC1-211ENST00000495220 SMARCA2P51531 1590 aa36.96■■■■□ 3.51
ARRDC1-211ENST00000495220 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.96■■■■□ 3.51
ARRDC1-211ENST00000495220 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.95■■■■□ 3.51
ARRDC1-211ENST00000495220 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
ARRDC1-211ENST00000495220 NCAPD3P42695 1498 aa36.91■■■■□ 3.5
ARRDC1-211ENST00000495220 HMGXB3Q12766 1538 aa36.75■■■■□ 3.47
ARRDC1-211ENST00000495220 WIZO95785 1651 aa36.74■■■■□ 3.47
ARRDC1-211ENST00000495220 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
ARRDC1-211ENST00000495220 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
ARRDC1-211ENST00000495220 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
ARRDC1-211ENST00000495220 ERCC6Q03468 1493 aa36.11■■■■□ 3.37
ARRDC1-211ENST00000495220 CUX2O14529 1486 aa36.05■■■■□ 3.36
ARRDC1-211ENST00000495220 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36■■■■□ 3.35
ARRDC1-211ENST00000495220 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.99■■■■□ 3.35
ARRDC1-211ENST00000495220 NESP48681 1621 aa35.89■■■■□ 3.34
ARRDC1-211ENST00000495220 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.85■■■■□ 3.33
ARRDC1-211ENST00000495220 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.83■■■■□ 3.33
ARRDC1-211ENST00000495220 CFTRP13569 1480 aa35.73■■■■□ 3.31
ARRDC1-211ENST00000495220 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.59■■■■□ 3.29
ARRDC1-211ENST00000495220 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
ARRDC1-211ENST00000495220 PRDM2Q13029 1718 aa35.46■■■■□ 3.27
ARRDC1-211ENST00000495220 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.4■■■■□ 3.26
ARRDC1-211ENST00000495220 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.38■■■■□ 3.25
ARRDC1-211ENST00000495220 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.3■■■■□ 3.24
ARRDC1-211ENST00000495220 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.2■■■■□ 3.23
ARRDC1-211ENST00000495220 WDR62O43379 1518 aa35.09■■■■□ 3.21
ARRDC1-211ENST00000495220 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
ARRDC1-211ENST00000495220 ABCC8Q09428 1581 aa35■■■■□ 3.19
ARRDC1-211ENST00000495220 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.9■■■■□ 3.18
ARRDC1-211ENST00000495220 TOPBP1Q92547 1522 aa34.89■■■■□ 3.18
ARRDC1-211ENST00000495220 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.81■■■■□ 3.16
ARRDC1-211ENST00000495220 CUX1P39880 1505 aa34.8■■■■□ 3.16
ARRDC1-211ENST00000495220 TOP2BQ02880 1626 aa34.66■■■■□ 3.14
ARRDC1-211ENST00000495220 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.64■■■■□ 3.14
ARRDC1-211ENST00000495220 SYNJ1O43426 1573 aa34.63■■■■□ 3.13
ARRDC1-211ENST00000495220 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
ARRDC1-211ENST00000495220 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.6■■■■□ 3.13
ARRDC1-211ENST00000495220 IFT140Q96RY7 1462 aa34.58■■■■□ 3.13
ARRDC1-211ENST00000495220 SOGA1O94964 1423 aa34.52■■■■□ 3.12
ARRDC1-211ENST00000495220 OSCARQ8IYS5 282 aa34.51■■■■□ 3.12
ARRDC1-211ENST00000495220 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
ARRDC1-211ENST00000495220 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.44■■■■□ 3.1
ARRDC1-211ENST00000495220 TRIM41Q8WV44 630 aa34.37■■■■□ 3.09
ARRDC1-211ENST00000495220 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.34■■■■□ 3.09
ARRDC1-211ENST00000495220 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
ARRDC1-211ENST00000495220 WDR97A6NE52 1622 aa34.29■■■■□ 3.08
ARRDC1-211ENST00000495220 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.26■■■■□ 3.08
ARRDC1-211ENST00000495220 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
ARRDC1-211ENST00000495220 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.2■■■■□ 3.062e-10■■■■■ 40
ARRDC1-211ENST00000495220 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
ARRDC1-211ENST00000495220 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.12■■■■□ 3.05
ARRDC1-211ENST00000495220 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.11■■■■□ 3.05
ARRDC1-211ENST00000495220 GRIN2BQ13224 1484 aa34.06■■■■□ 3.04
ARRDC1-211ENST00000495220 KIF27Q86VH2 1401 aa34.05■■■■□ 3.04
ARRDC1-211ENST00000495220 PBRM1Q86U86 1689 aa33.96■■■■□ 3.03
ARRDC1-211ENST00000495220 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.94■■■■□ 3.02
ARRDC1-211ENST00000495220 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
ARRDC1-211ENST00000495220 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.89■■■■□ 3.02
ARRDC1-211ENST00000495220 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.86■■■■□ 3.01
ARRDC1-211ENST00000495220 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.86■■■■□ 3.01
ARRDC1-211ENST00000495220 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.86■■■■□ 3.01
ARRDC1-211ENST00000495220 IGF1RP08069 1367 aa33.85■■■■□ 3.01
ARRDC1-211ENST00000495220 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.83■■■■□ 3.01
ARRDC1-211ENST00000495220 FBLN2P98095 1184 aa33.81■■■■□ 3
ARRDC1-211ENST00000495220 ARHGEF11O15085 1522 aa33.8■■■■□ 3
ARRDC1-211ENST00000495220 EEA1Q15075 1411 aa33.79■■■■□ 3
ARRDC1-211ENST00000495220 SYNJ2O15056 1496 aa33.77■■■■□ 3
ARRDC1-211ENST00000495220 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.77■■■■□ 3
ARRDC1-211ENST00000495220 CHD1O14646 1710 aa33.74■■■□□ 2.99
ARRDC1-211ENST00000495220 ADAMTS12P58397 1594 aa33.74■■■□□ 2.99
ARRDC1-211ENST00000495220 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
ARRDC1-211ENST00000495220 CUL7Q14999 1698 aa33.71■■■□□ 2.99
ARRDC1-211ENST00000495220 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.66■■■□□ 2.98
ARRDC1-211ENST00000495220 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.65■■■□□ 2.98
ARRDC1-211ENST00000495220 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.65■■■□□ 2.98
ARRDC1-211ENST00000495220 GRIN2AQ12879 1464 aa33.59■■■□□ 2.97
ARRDC1-211ENST00000495220 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
ARRDC1-211ENST00000495220 PRXQ9BXM0 1461 aa33.53■■■□□ 2.96
ARRDC1-211ENST00000495220 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.51■■■□□ 2.96
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