RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493902.5

STX4-211, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 5

Gene STX4, Length 1,588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-211ENST00000493902 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.19■■■■■ 5.78
STX4-211ENST00000493902 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.91■■■■■ 4.78
STX4-211ENST00000493902 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
STX4-211ENST00000493902 ABCC9O60706 1549 aa42.8■■■■■ 4.44
STX4-211ENST00000493902 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.35■■■■■ 4.37
STX4-211ENST00000493902 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.34■■■■■ 4.37
STX4-211ENST00000493902 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.01■■■■■ 4.32
STX4-211ENST00000493902 NACADO15069 1562 aa41.9■■■■■ 4.3
STX4-211ENST00000493902 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.66■■■■■ 4.26
STX4-211ENST00000493902 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.38■■■■■ 4.22
STX4-211ENST00000493902 SCRIBQ14160 1630 aa41.19■■■■■ 4.18
STX4-211ENST00000493902 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.81■■■■■ 4.12
STX4-211ENST00000493902 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.38■■■■■ 4.05
STX4-211ENST00000493902 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.23■■■■■ 4.03
STX4-211ENST00000493902 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.78■■■■□ 3.96
STX4-211ENST00000493902 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
STX4-211ENST00000493902 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
STX4-211ENST00000493902 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.52■■■■□ 3.92
STX4-211ENST00000493902 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
STX4-211ENST00000493902 SMARCA4P51532 1647 aa39.46■■■■□ 3.91
STX4-211ENST00000493902 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
STX4-211ENST00000493902 WIZO95785 1651 aa39.18■■■■□ 3.86
STX4-211ENST00000493902 PEG3Q9GZU2 1588 aa39■■■■□ 3.83
STX4-211ENST00000493902 SMARCA2P51531 1590 aa38.9■■■■□ 3.82
STX4-211ENST00000493902 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.9■■■■□ 3.82
STX4-211ENST00000493902 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.79■■■■□ 3.8
STX4-211ENST00000493902 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.75■■■■□ 3.79
STX4-211ENST00000493902 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
STX4-211ENST00000493902 NCAPD3P42695 1498 aa38.64■■■■□ 3.78
STX4-211ENST00000493902 HMGXB3Q12766 1538 aa38.59■■■■□ 3.77
STX4-211ENST00000493902 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.34■■■■□ 3.73
STX4-211ENST00000493902 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.1■■■■□ 3.69
STX4-211ENST00000493902 CFTRP13569 1480 aa37.66■■■■□ 3.62
STX4-211ENST00000493902 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.65■■■■□ 3.62
STX4-211ENST00000493902 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.62■■■■□ 3.61
STX4-211ENST00000493902 PRDM2Q13029 1718 aa37.52■■■■□ 3.6
STX4-211ENST00000493902 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.44■■■■□ 3.58
STX4-211ENST00000493902 NESP48681 1621 aa37.42■■■■□ 3.58
STX4-211ENST00000493902 ABCC8Q09428 1581 aa37.4■■■■□ 3.58
STX4-211ENST00000493902 TRIM41Q8WV44 630 aa37.27■■■■□ 3.56
STX4-211ENST00000493902 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.22■■■■□ 3.55
STX4-211ENST00000493902 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.21■■■■□ 3.55
STX4-211ENST00000493902 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.14■■■■□ 3.54
STX4-211ENST00000493902 SYNJ1O43426 1573 aa37.09■■■■□ 3.53
STX4-211ENST00000493902 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.05■■■■□ 3.52
STX4-211ENST00000493902 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.02■■■■□ 3.52
STX4-211ENST00000493902 TOP2BQ02880 1626 aa36.99■■■■□ 3.51
STX4-211ENST00000493902 CUX1P39880 1505 aa36.99■■■■□ 3.51
STX4-211ENST00000493902 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.98■■■■□ 3.51
STX4-211ENST00000493902 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.82■■■■□ 3.49
STX4-211ENST00000493902 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
STX4-211ENST00000493902 ERCC6Q03468 1493 aa36.77■■■■□ 3.48
STX4-211ENST00000493902 TOPBP1Q92547 1522 aa36.76■■■■□ 3.48
STX4-211ENST00000493902 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.7■■■■□ 3.47
STX4-211ENST00000493902 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.66■■■■□ 3.46
STX4-211ENST00000493902 SOGA1O94964 1423 aa36.58■■■■□ 3.45
STX4-211ENST00000493902 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
STX4-211ENST00000493902 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
STX4-211ENST00000493902 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
STX4-211ENST00000493902 WDR62O43379 1518 aa36.53■■■■□ 3.44
STX4-211ENST00000493902 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.47■■■■□ 3.43
STX4-211ENST00000493902 EEA1Q15075 1411 aa36.46■■■■□ 3.43
STX4-211ENST00000493902 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.41■■■■□ 3.42
STX4-211ENST00000493902 CUX2O14529 1486 aa36.33■■■■□ 3.41
STX4-211ENST00000493902 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.32■■■■□ 3.41
STX4-211ENST00000493902 KIF27Q86VH2 1401 aa36.32■■■■□ 3.41
STX4-211ENST00000493902 WDR97A6NE52 1622 aa36.29■■■■□ 3.4
STX4-211ENST00000493902 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.27■■■■□ 3.4
STX4-211ENST00000493902 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
STX4-211ENST00000493902 IFT140Q96RY7 1462 aa36.18■■■■□ 3.38
STX4-211ENST00000493902 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.17■■■■□ 3.38
STX4-211ENST00000493902 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.09■■■■□ 3.37
STX4-211ENST00000493902 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
STX4-211ENST00000493902 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.05■■■■□ 3.36
STX4-211ENST00000493902 KIF21BO75037 1637 aa36.03■■■■□ 3.36
STX4-211ENST00000493902 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.02■■■■□ 3.36
STX4-211ENST00000493902 IGF1RP08069 1367 aa36.01■■■■□ 3.35
STX4-211ENST00000493902 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
STX4-211ENST00000493902 PRXQ9BXM0 1461 aa35.95■■■■□ 3.35
STX4-211ENST00000493902 GOLGA3Q08378 1498 aa35.94■■■■□ 3.34
STX4-211ENST00000493902 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.93■■■■□ 3.34
STX4-211ENST00000493902 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.91■■■■□ 3.34
STX4-211ENST00000493902 PBRM1Q86U86 1689 aa35.89■■■■□ 3.34
STX4-211ENST00000493902 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
STX4-211ENST00000493902 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.87■■■■□ 3.33
STX4-211ENST00000493902 CUL7Q14999 1698 aa35.85■■■■□ 3.33
STX4-211ENST00000493902 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.84■■■■□ 3.33
STX4-211ENST00000493902 GRIN2BQ13224 1484 aa35.81■■■■□ 3.32
STX4-211ENST00000493902 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
STX4-211ENST00000493902 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.72■■■■□ 3.31
STX4-211ENST00000493902 ADAMTS12P58397 1594 aa35.66■■■■□ 3.3
STX4-211ENST00000493902 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.63■■■■□ 3.29
STX4-211ENST00000493902 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.62■■■■□ 3.29
STX4-211ENST00000493902 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
STX4-211ENST00000493902 CEP162Q5TB80 1403 aa35.49■■■■□ 3.27
STX4-211ENST00000493902 SYNJ2O15056 1496 aa35.43■■■■□ 3.26
STX4-211ENST00000493902 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.4■■■■□ 3.26
STX4-211ENST00000493902 GRIN2AQ12879 1464 aa35.37■■■■□ 3.25
STX4-211ENST00000493902 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
STX4-211ENST00000493902 CLIP1P30622 1438 aa35.32■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms