RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493263.1

STK35-202, Transcript of serine/threonine kinase 35, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene STK35, Length 1,595 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STK35-202ENST00000493263 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.3■■■■■ 5.32
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STK35-202ENST00000493263 ABCC9O60706 1549 aa40.45■■■■■ 4.07
STK35-202ENST00000493263 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.06■■■■■ 4
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STK35-202ENST00000493263 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.67■■■■□ 3.94
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STK35-202ENST00000493263 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.31■■■■□ 3.88
STK35-202ENST00000493263 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.03■■■■□ 3.84
STK35-202ENST00000493263 SCRIBQ14160 1630 aa38.82■■■■□ 3.81
STK35-202ENST00000493263 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.46■■■■□ 3.75
STK35-202ENST00000493263 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.14■■■■□ 3.7
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STK35-202ENST00000493263 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
STK35-202ENST00000493263 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.29■■■■□ 3.56
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STK35-202ENST00000493263 WIZO95785 1651 aa36.93■■■■□ 3.5
STK35-202ENST00000493263 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.79■■■■□ 3.48
STK35-202ENST00000493263 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.75■■■■□ 3.47
STK35-202ENST00000493263 SMARCA2P51531 1590 aa36.71■■■■□ 3.47
STK35-202ENST00000493263 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.59■■■■□ 3.45
STK35-202ENST00000493263 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
STK35-202ENST00000493263 NCAPD3P42695 1498 aa36.54■■■■□ 3.44
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STK35-202ENST00000493263 CFTRP13569 1480 aa35.58■■■■□ 3.29
STK35-202ENST00000493263 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.57■■■■□ 3.28
STK35-202ENST00000493263 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.54■■■■□ 3.28
STK35-202ENST00000493263 NESP48681 1621 aa35.37■■■■□ 3.25
STK35-202ENST00000493263 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.34■■■■□ 3.25
STK35-202ENST00000493263 PRDM2Q13029 1718 aa35.29■■■■□ 3.24
STK35-202ENST00000493263 ABCC8Q09428 1581 aa35.23■■■■□ 3.23
STK35-202ENST00000493263 TRIM41Q8WV44 630 aa35.17■■■■□ 3.22
STK35-202ENST00000493263 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.14■■■■□ 3.22
STK35-202ENST00000493263 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.11■■■■□ 3.21
STK35-202ENST00000493263 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.11■■■■□ 3.21
STK35-202ENST00000493263 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.96■■■■□ 3.19
STK35-202ENST00000493263 SYNJ1O43426 1573 aa34.95■■■■□ 3.19
STK35-202ENST00000493263 CUX1P39880 1505 aa34.9■■■■□ 3.18
STK35-202ENST00000493263 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.9■■■■□ 3.18
STK35-202ENST00000493263 TOP2BQ02880 1626 aa34.86■■■■□ 3.17
STK35-202ENST00000493263 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.83■■■■□ 3.17
STK35-202ENST00000493263 ERCC6Q03468 1493 aa34.73■■■■□ 3.15
STK35-202ENST00000493263 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
STK35-202ENST00000493263 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.73■■■■□ 3.15
STK35-202ENST00000493263 TOPBP1Q92547 1522 aa34.71■■■■□ 3.15
STK35-202ENST00000493263 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.67■■■■□ 3.14
STK35-202ENST00000493263 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.59■■■■□ 3.13
STK35-202ENST00000493263 SOGA1O94964 1423 aa34.51■■■■□ 3.12
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STK35-202ENST00000493263 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
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STK35-202ENST00000493263 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.41■■■■□ 3.1
STK35-202ENST00000493263 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.39■■■■□ 3.1
STK35-202ENST00000493263 EEA1Q15075 1411 aa34.36■■■■□ 3.09
STK35-202ENST00000493263 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.29■■■■□ 3.08
STK35-202ENST00000493263 CUX2O14529 1486 aa34.28■■■■□ 3.08
STK35-202ENST00000493263 KIF27Q86VH2 1401 aa34.27■■■■□ 3.08
STK35-202ENST00000493263 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.26■■■■□ 3.07
STK35-202ENST00000493263 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
STK35-202ENST00000493263 IFT140Q96RY7 1462 aa34.18■■■■□ 3.06
STK35-202ENST00000493263 WDR97A6NE52 1622 aa34.17■■■■□ 3.06
STK35-202ENST00000493263 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.14■■■■□ 3.06
STK35-202ENST00000493263 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
STK35-202ENST00000493263 IGF1RP08069 1367 aa34.06■■■■□ 3.04
STK35-202ENST00000493263 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.01■■■■□ 3.04
STK35-202ENST00000493263 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.01■■■■□ 3.03
STK35-202ENST00000493263 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
STK35-202ENST00000493263 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.98■■■■□ 3.03
STK35-202ENST00000493263 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.97■■■■□ 3.03
STK35-202ENST00000493263 PRXQ9BXM0 1461 aa33.92■■■■□ 3.02
STK35-202ENST00000493263 KIF21BO75037 1637 aa33.91■■■■□ 3.02
STK35-202ENST00000493263 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.87■■■■□ 3.01
STK35-202ENST00000493263 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.86■■■■□ 3.01
STK35-202ENST00000493263 GOLGA3Q08378 1498 aa33.85■■■■□ 3.01
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STK35-202ENST00000493263 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.82■■■■□ 3
STK35-202ENST00000493263 PBRM1Q86U86 1689 aa33.79■■■■□ 3
STK35-202ENST00000493263 CUL7Q14999 1698 aa33.76■■■□□ 2.99
STK35-202ENST00000493263 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
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STK35-202ENST00000493263 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.63■■■□□ 2.97
STK35-202ENST00000493263 ADAMTS12P58397 1594 aa33.61■■■□□ 2.97
STK35-202ENST00000493263 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.58■■■□□ 2.97
STK35-202ENST00000493263 SYNJ2O15056 1496 aa33.46■■■□□ 2.95
STK35-202ENST00000493263 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.43■■■□□ 2.94
STK35-202ENST00000493263 CEP162Q5TB80 1403 aa33.43■■■□□ 2.94
STK35-202ENST00000493263 GRIN2AQ12879 1464 aa33.39■■■□□ 2.93
STK35-202ENST00000493263 FBLN2P98095 1184 aa33.37■■■□□ 2.93
STK35-202ENST00000493263 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.31■■■□□ 2.92
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